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![GSE190959:通过化学沉淀图谱进行全基因组分析和无序转录因子鉴定 [ATAC-seq]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/196274.jpg)
GSE190959:通过化学沉淀图谱进行全基因组分析和无序转录因子鉴定 [ATAC-seq]
该数据集来自 NCBI GEO(GSE190959),采用 DisP-seq 方法(b-isox 介导沉淀结合新一代测序)在 Ewing 肉瘤等细胞类型中全基因组定位内在无序蛋白,产生与多种染色质状态相关的强峰,并富集 EWS-FLI1 等转录因子的 DNA 结合基序
![GSE190960:通过化学沉淀图谱进行全基因组分析和鉴定无序转录因子 [ChIP-seq]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/196272.jpg)
GSE190960:通过化学沉淀图谱进行全基因组分析和鉴定无序转录因子 [ChIP-seq]
研究开发了不依赖抗体的 DisP-seq 方法,结合 b-isox 介导沉淀与下一代测序,在 Ewing 肉瘤等细胞中绘制无序蛋白的全基因组结合位点,并鉴定与 EWS-FLI1 等转录因子相关的 DNA 结合基序
![GSE190961:通过化学沉淀图谱进行全基因组分析和无序转录因子鉴定 [DisP-Seq]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/196270.jpg)
GSE190961:通过化学沉淀图谱进行全基因组分析和无序转录因子鉴定 [DisP-Seq]
该数据集来自 NCBI GEO,标题为 GSE190961,采用 DisP-seq(无序蛋白沉淀结合 DNA 测序)方法,在 Ewing 肉瘤等细胞类型中全基因组定位内在无序区(IDR)相关蛋白
![GSE190962:通过化学沉淀图谱进行全基因组分析并鉴定无序转录因子 [RNA-Seq]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/196269.jpg)
GSE190962:通过化学沉淀图谱进行全基因组分析并鉴定无序转录因子 [RNA-Seq]
源站描述显示,研究开发了不依赖抗体的 DisP-seq 方法,将 b-isox 介导的沉淀与下一代测序结合,在 Ewing 肉瘤等细胞中全基因组定位无序蛋白,并发现与 EWS-FLI1 等转录因子基序高度富集的强峰

GSE213545:新型尤文肉瘤染色质可及性小分子调节剂UNC0621与RNA相关大分子复合物相互作用并影响RNA剪接
研究聚焦Ewing肉瘤中EWS::FLI融合蛋白介导的异常染色质可及性,报道小分子UNC0621作为染色质状态调节剂,与RNA相关大分子复合物互作并影响RNA剪接

LY2835219对表达EWS-FLI1的U2OS细胞系的转录影响
源站描述指出,癌症相关染色体易位可产生致病性融合蛋白,许多融合蛋白由相分离倾向结构域(PS)和DNA结合结构域(DBD)组成,与异常基因表达模式强相关;研究者建立了DropScan高通量筛选方法,筛选出LY2835219能有效溶解表达尤文肉瘤融合蛋白的报告细胞系中的凝聚物,并部分挽救靶基因的

GSE235379:必需伴侣蛋白DNAJC17激活HSP70协调RNA剪接与G2-M进程
该数据集来自NCBI GEO,包含人类癌症细胞系中JDP家族基因遗传筛选的高通量测序表达谱数据,聚焦含RRM结构域的DNAJC17

GSE260602:细胞背景是Ewing肉瘤中ATR抑制与顺铂协同作用的第三轴
研究利用EWS-FLI1转录因子广泛转录失调,通过矩阵药物筛选评估DNA-PK抑制剂M9831或ATR抑制剂berzosertib与化疗的协同作用,发现berzosertib联合顺铂在多个Ewing肉瘤细胞系中于临床可及浓度下产生显著协同,并进行了机制与体内方案优化

EWSR1::FLI1融合癌蛋白调控ETS1的ChIP-seq数据集
该数据集来自NCBI GEO,包含1个ChIP-seq样本矩阵文件,用于研究Ewing肉瘤中EWSR1::FLI1融合癌蛋白对ETS1基因的抑制调控

尤文肉瘤细胞中的ATAC-seq、ChIP-seq和RNA-seq
该数据集为NCBI GEO上的SuperSeries,整合了尤文肉瘤细胞中ATAC-seq、ChIP-seq和RNA-seq的测序数据,用于研究染色质可及性、蛋白质-DNA结合及基因表达

CHD4与EWS-FLI1敲低对Ewing肉瘤细胞基因表达的影响
该数据集来自NCBI GEO,研究Ewing肉瘤细胞(SKNMC)中稳定表达多西环素诱导型shRNA靶向NuRD组分CHD4或融合转录因子EWS-FLI1后对基因表达调控的影响

EWSR1::FLI1融合癌蛋白调控ETS1的RNA-seq数据集
该数据集来自NCBI GEO,包含1个RNA-seq表达谱文件,用于研究Ewing肉瘤中EWSR1::FLI1/ERG融合癌蛋白对靶基因ETS1的抑制调控
