GSE235379：必需伴侣蛋白DNAJC17激活HSP70协调RNA剪接与G2-M进程

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE235379

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

包括70千道尔顿热休克蛋白（HSP70）家族和含J结构域蛋白（JDP）共伴侣在内的分子伴侣，通过调控蛋白质组维持真核细胞的稳态平衡。庞大的JDP家族有助于指导HSP70的具体功能，然而哺乳动物细胞对单个JDP编码基因的缺失普遍耐受，表明存在高度冗余性。通过对人类癌细胞系中DJPs的遗传筛选，我们发现含有RNA识别 motif（RRM）的DNAJC17是泛必需的。DNAJC17的敲低导致个别mRNA丰度的保守变化相对较少，而是通过外显子跳跃，主要是涉及细胞周期进程的基因，扰乱了基因表达。与细胞活力实验结果一致，DNAJC17的C端部分对于恢复剪接和G2-M进程并非必需。我们的发现确定了细胞必需的JDPs，并提示JDP结构的多样化扩展了HSP70-JDP系统，以控制如RNA剪接等多样化的过程。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。