GSE260602：细胞背景是Ewing肉瘤中ATR抑制与顺铂协同作用的第三轴

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE260602

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数据说明

目的：细胞背景对DNA损伤反应（DDR）靶向药物协同作用的重要性对于DDR通路突变的肿瘤尤为重要，但对于由致癌转录因子驱动的肿瘤则尚不明确。本研究利用EWS-FLI1转录因子广泛的转录失调，为尤文肉瘤（ES）确定一种有效的DDR靶向联合疗法。实验设计：我们采用矩阵药物筛选评估DNA-PK抑制剂（M9831）或ATR抑制剂（berzosertib）与化疗药物之间的协同作用。选择berzosertib与顺铂联合方案因其具有广泛协同作用，对其ES选择性进行机制评估，并优化体内给药方案。结果：Berzosertib与顺铂联合在临床可达到的浓度下于多种ES细胞系中表现出显著协同作用。该协同作用源于ATR下游靶点CHEK1表达缺失、细胞周期检查点丧失及有丝分裂灾难。与本项目目标一致，EWS-FLI1驱动CHEK1及另外五个ATR通路成员的表达。

表达缺失并非由于转录抑制，而是由降解及蛋白质翻译抑制共同导致。通过在该联合方案的一种新型优化给药方案下，于部分ES模型体内实现了深度协同效应，使50%携带两种不同ES异种移植瘤的动物获得持久完全缓解。结论：这些数据利用EWS-FLI1驱动的细胞背景改变，拓宽了berzosertib与顺铂的治疗窗，从而建立了一种有前景的联合疗法及一种新型体内给药方案。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。