LY2835219对表达EWS-FLI1的U2OS细胞系的转录影响

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE232072

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

癌症相关的染色体易位可导致多种致病性融合蛋白的表达。这些融合蛋白促进肿瘤发生的机制在很大程度上尚不清楚，针对融合相关癌症的有效疗法也仍然缺乏。在此，我们全面审查了在多种癌症中发现的融合蛋白。我们发现，许多融合蛋白由易于发生相分离的结构域（PS）和DNA结合结构域（DBD）组成，且这些融合与异常的基因表达模式密切相关。此外，我们建立了一种名为DropScan的高通量筛选方法，用于筛选能够调节异常凝聚体的药物。通过DropScan鉴定出的一种药物LY2835219，能有效溶解表达尤文肉瘤融合蛋白的报告细胞系中的凝聚体，并部分恢复了靶基因的异常表达。我们的结果表明，异常的相分离可能是这些PS-DBD融合相关癌症的一种常见机制，并提示调节异常的相分离是治疗这些疾病的一种潜在途径。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。