达比加群对脂多糖诱导内毒素血症的保护作用不通过其抗凝功能介导

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE245299

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数据说明

内毒素血症是脓毒症发病机制的关键特征，也被发现介导多种慢性炎症性疾病的病理生理过程。在本研究中，我们利用斑马鱼扩展了由脂多糖（LPS）诱导的内毒素血症模型，并证明该模型表现出炎症和促凝血基因的激活、内皮损伤后凝血功能受损以及器官功能障碍的征象。一项计算机分析（in silico分析）显示，LPS处理胚胎的RNA-seq特征与涉及多种通路的基因和药物的RNA-seq特征之间存在多重关联。一项涉及超过1，500种FDA批准药物的体内筛选鉴定出跨越多个药物类别的多种化合物，这些化合物可部分或完全预防内毒素血症性死亡。通过体内和计算机分析共同鉴定出三种小分子，其中包括一种抗凝药达比加群。达比加群是一种直接凝血酶抑制剂，可显著降低炎症细胞因子和促凝血基因的上调，并完全保护斑马鱼免受LPS导致的内毒素血症性死亡。

然而，其他抗凝药物阿加曲班（直接凝血酶抑制剂）以及利伐沙班和阿哌沙班（Xa因子抑制剂）并未提供此类保护作用。最后，凝血酶原突变斑马鱼在接受LPS处理后未表现出存活率增加。这些数据共同表明，达比加群通过一种不依赖其抗凝作用的机制保护斑马鱼免受内毒素血症的影响。总之，我们的计算机模拟和体内分析表明，达比加群及其他几种新型小分子能够预防LPS诱导的内毒素血症，值得在急性和慢性炎症条件下进一步开展治疗探索。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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