BTKbase:X连锁无丙种球蛋白血症(XLA)突变数据库
BTKbase是一个专注于X连锁无丙种球蛋白血症(XLA)的基因突变数据库,以文本和临床表格形式收录了来自189个家庭的225条BTK基因突变记录,包括患者身份标识、表型症状和突变结构影响信息,主要用于研究遗传病突变机制、分析基因型与表型关联,并为临床诊断提供数据支持。
基本信息
资源简介
BTKbase是一个专门针对X连锁无丙种球蛋白血症(XLA)的突变数据库,该疾病是一种由布鲁顿无丙种球蛋白血症酪氨酸激酶(BTK)基因突变引起的免疫缺陷病。该数据库收录了来自189个无亲缘关系家庭的225条记录,涵盖148种独特的分子突变事件,每条记录包含患者的唯一身份标识(PIN)和表型信息(如症状)。突变覆盖BTK蛋白的所有五个结构域,其中错义突变最为常见,且突变在分子中分布广泛,常影响CpG位点形成精氨酸残基。数据库还提供了所有错义突变的潜在结构影响分析,主要用于遗传病突变机制研究、基因型-表型关联分析以及临床诊断支持。
下载信息
注册下载
Tips: 该数据集需要在对应的数据源网站注册通过后,才能进行数据下载,注册有对应要求,或者需要收费。
暂未开放公开下载
Tips: 该数据集属于公开下载,应该可以免费公开下载。
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提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
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使用方式
数据集获取
源站:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC145577/
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
BTKbase是一个专门针对X连锁无丙种球蛋白血症(XLA)的突变数据库,该疾病是一种由布鲁顿无丙种球蛋白血症酪氨酸激酶(BTK)基因突变引起的免疫缺陷病。该数据库收录了来自189个无亲缘关系家庭的225条记录,涵盖148种独特的分子突变事件,每条记录包含患者的唯一身份标识(PIN)和表型信息(如症状)。突变覆盖BTK蛋白的所有五个结构域,其中错义突变最为常见,且突变在分子中分布广泛,常影响CpG位点形成精氨酸残基。数据库还提供了所有错义突变的潜在结构影响分析,主要用于遗传病突变机制研究、基因型-表型关联分析以及临床诊断支持。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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