GSE172504:高通量剪接实验鉴定垂体激素缺乏相关POU1F1错义与同义剪接破坏变异
该数据集来自NCBI GEO,包含一项针对垂体发育关键转录因子POU1F1的高通量剪接报告实验。研究检测了1,080个单核苷酸变异,构建饱和剪接效应图谱,鉴定出96个剪接破坏变异,其中14个为同义变异,8个见于确诊垂体功能减退症的无亲缘关系患者

基本信息
资源简介
GSE172504:高通量剪接实验鉴定垂体激素缺乏相关POU1F1错义与同义剪接破坏变异
High-throughput splicing assays identify missense and silent splice-disruptive POU1F1 variants underlying pituitary hormone deficiency
该数据集来自NCBI GEO,包含一项针对垂体发育关键转录因子POU1F1的高通量剪接报告实验。研究检测了1,080个单核苷酸变异,构建饱和剪接效应图谱,鉴定出96个剪接破坏变异,其中14个为同义变异,8个见于确诊垂体功能减退症的无亲缘关系患者。数据可用于评估POU1F1变异的剪接效应,辅助垂体激素缺乏症的变异解读与致病性预测(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Apr 21 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):使用高通量剪接报告实验,我们检测了POU1F1中的1,080个单核苷酸变异,POU1F1是垂体发育所必需的关键转录因子。我们的饱和剪接效应图谱鉴定出96个剪接破坏变异,包括14个同义变异,其中8个见于确诊垂体功能减退症的无亲缘关系患者。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:Other、GPL20301、9534。本站分类:内分泌系统疾病/垂体功能减退症。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE172504
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jul 22 202,引用时请注意版本时效。
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
我们采用高通量剪接报告基因检测法,对POU1F1基因中的1,080个单核苷酸变异进行了测试。POU1F1是一个对垂体发育至关重要的关键转录因子。我们的饱和剪接效应图谱识别出96个剪接破坏性变异,其中包括14个同义变异,其中8个在诊断为垂体功能减退症的无亲缘关系患者中被发现。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。

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