精子tRNA衍生小RNA在获得性代谢紊乱跨代遗传中的作用
该数据集包含高脂饮食雄性小鼠精子中tRNA衍生小RNA（tsRNAs）的表达谱与修饰变化数据，以及这些RNA对后代胚胎和胰岛基因表达影响的实验数据，属于RNA分子与基因表达模态，主要用于研究表观遗传机制在代谢疾病跨代遗传中的作用，为父系环境因素影响后代健康提供了重要的分子生物学依据。
基本信息
资源简介
精子tRNA衍生小RNA在获得性代谢紊乱跨代遗传中的作用
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Sperm tsRNAs contribute to intergenerational inheritance of an acquired metabolic disorder》。源站首次发布：2022-02-20。
【数据内容】
源站原始描述：Increasing evidences indicate diet-induced metabolic disorder could be paternally inherited, but the exact sperm epigenetic carrier remains unclear. Here, in a paternal high-fat diet (HFD) mouse model, we revealed that a highly enriched subset of sperm small RNAs (30-34 nt) that derived from the 5’ halves of tRNAs (tsRNAs), exhibit changes in both expression profiles and RNA modifications. Injection of sperm tsRNAs from HFD male but not synthetic tsRNAs lacking RNA modifications, into normal zyg…
【主题与分类】
主题标签：小鼠、sperm、胚胎、Islet、Blastocyst、转录组、基因组。
【获取与许可】
源站页面：http://data.iscr.ac.cn/Article?id=05195d2ba4933da11f65c691e8a3cbd4
使用许可：openSource。
规范引用：PMID: 26721680
下载信息
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源站：http://data.iscr.ac.cn/Article?id=05195d2ba4933da11f65c691e8a3cbd4
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集来源于一项研究精子tRNA衍生小RNA（tsRNAs）在获得性代谢紊乱跨代遗传中作用的小鼠实验。数据集包含高脂饮食（HFD）雄性小鼠精子中tsRNAs的表达谱和RNA修饰变化数据，以及将这些tsRNAs注射到正常受精卵后对F1代胚胎和胰岛基因表达的影响数据。数据通过RNA测序、修饰分析和基因表达检测等技术构建，主要研究方向为表观遗传机制在代谢疾病（如肥胖、糖尿病）跨代遗传中的作用，为理解父系饮食对后代健康的影响提供了分子层面的证据。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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