GSE295384：ATF3过表达通过增强增殖诱导斑马鱼心脏肥大和电功能障碍

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE295384

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数据说明

激活转录因子3（ATF3）是多种组织中应对生理应激时基因表达的关键调控因子。尽管其异常表达已被证实与心脏功能障碍相关，但ATF3影响心脏病理的具体机制仍不明确，文献报道亦存在相互矛盾的发现。为解决这一问题，我们利用斑马鱼这一成熟的心血管研究脊椎动物模型，构建了心脏特异性表达ATF3的斑马鱼品系Tg (myl7:ATF3)。与野生型（WT）同胞相比，Tg (myl7:ATF3)斑马鱼表现出显著的病理生理改变，包括心脏肥大及类似肥厚型心肌病（HCM）的特征。组织学分析显示纤维化瘢痕增加、肌节排列紊乱，以及心力衰竭基因标志物（nppa和nppb）表达升高。值得注意的是，心电图（ECG）测量表明ATF3过表达可导致类似长QT综合征（LQTS）的症状，提示电功能异常。

转录组分析进一步揭示，在转基因斑马鱼心脏中，凋亡相关基因表达下调，而增殖相关基因表达上调。这些发现表明，应激诱导的ATF3表达通过增强心肌细胞增殖促进心脏肥大，为其在心血管疾病进展中的作用提供了新的见解。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。