rbpms2a; rbpms2b双突变与对照斑马鱼胚胎33小时RNA测序

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE167414

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

鉴定支持心室功能的新型心肌细胞内在因子，将拓展心力衰竭的候选基因数量和治疗选择，而心力衰竭是全球主要死因之一。在此，我们证明一种保守的RNA结合蛋白RBPMS2是斑马鱼心室功能所必需的，并且是斑马鱼和人心肌细胞中肌原纤维组织和细胞内钙动力学调节所必需的。差异表达筛选发现rbpms2a和rbpms2b在斑马鱼心肌细胞中共表达。双敲除胚胎在心动周期舒张期出现心室充盈受损，显著降低心输出量。通过剪接敏感性差异表达分析、定量PCR和原位杂交评估rbpms2缺失胚胎，揭示了心肌病相关基因的差异可变剪接，包括肌球蛋白结合蛋白C3（mybpc3）和受磷蛋白（pln）。双突变体心室中的心肌细胞以及来源于RBPMS2缺失的人诱导多能干细胞的心肌细胞均表现出肌原纤维排列紊乱和钙处理异常。

综上所述，我们的数据表明RBPMS2在调控心肌细胞可变剪接中发挥保守作用，这对于肌节组织、最佳钙处理和心脏功能是必需的。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。