机械力实现人类干细胞蛋白质聚集性心肌病建模的数据与代码

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5061/dryad.k6djh9wp3

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

遗传性心肌病是年轻人心力衰竭的主要原因，治疗选择有限。由细胞骨架蛋白及其伴侣蛋白突变引起的结蛋白相关性心肌病（DRM）就是这一挑战的典型例证：在这种情况下，蛋白质质量控制受损，导致毒性蛋白聚集体破坏心肌细胞的收缩机制。伴侣蛋白aB晶体蛋白（CRYAB-R120G）中最致命的DRM突变之一缺乏遗传匹配的临床前模型：小鼠模型需要大量过表达突变型CRYAB，这引发了对其生理相关性的质疑。在此，我们利用在接近内源性水平表达突变型CRYAB的诱导多能干细胞，建立了首个CRYAB相关DRM的人类模型。我们发现，三维机械加载——而非基于脂肪酸的代谢成熟培养基——对于表达结蛋白至关重要，而结蛋白的聚集正是DRM的定义特征。利用微工程心脏组织，我们发现收缩缺陷与钙处理受损相关，这指向了机电耦合在DRM中的作用。

使用JAK1抑制剂Itacitinib治疗部分恢复了收缩功能，为这一新兴治疗策略提供了首次功能性验证。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。