人干细胞来源视网膜类器官视网膜母细胞瘤RNA测序数据集

数据集获取

源站：http://data.iscr.ac.cn/Article?id=c4ab0b09f2168bb41b08cff7d0d7914b

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集是一个用于研究视网膜母细胞瘤的RNA测序数据集。视网膜母细胞瘤是一种儿童期发生的视网膜发育相关癌症，其发生与RB1基因的双等位基因失活相关。数据集通过从15名携带胚系RB1突变的参与者中提取诱导多能干细胞（iPSCs），培养45天后形成视网膜类器官，再将其注入免疫缺陷小鼠玻璃体中以促进肿瘤生长，从而构建了人类视网膜母细胞瘤的实验室模型。数据集包含了由此产生的肿瘤组织的RNA测序数据，这些数据在分子、细胞和基因组特征上与人类视网膜母细胞瘤高度一致，可用于研究该疾病的发病机制、基因表达谱以及开发新的治疗策略。

数据加载示例（表格/文本类）

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))