基于解剖学精确3D打印小鼠体模的磁粒子成像定量策略系统评估数据

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5061/dryad.59zw3r2pz

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 6.42 GB。

数据说明

该数据集包含用于评估生物医学相关条件下磁粒子成像（MPI）分割方法的小鼠体模图像。数据集包括小鼠体模的MPI图像，其中肝脏腔室内含有100 ugFe，脑部、后侧腹和肺部感兴趣区（ROI）内有不同测试质量（范围从0到2.5 ugFe）。二维和三维MPI图像以.nrrd格式提供，ROI信号的分割结果以.seg.nrrd格式提供。数据使用MOMENTUM磁粒子成像扫描仪（Magnetic Insight）和实验室自制的涂有nDPEG的氧化铁示踪剂获得。用于3D打印的体模模型（脑部和肺部端口+肝脏和后侧腹腔室）以STL格式提供，同时还提供了另一个包含脑部、肺部、肝脏和后侧腹解剖腔室的模型。还提供了所有体模配置的配准计算机断层扫描（CT）图像。数据集按文件夹组织，包含成像数据（.nrrd）、文章中绘制的表格数据（.txt）文件夹以及体模模型（.stl）。

成像数据由所研究的每个数据集（脑、侧腹和肺）以及包含额外数据的文件夹组成，这些额外数据如用于将信号校准为铁质量的参考样本和模型。该数据集对于推进MPI中磁性纳米颗粒生物分布研究的定量成像技术具有更广泛的相关性。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。