Hutchinson-Gilford早衰综合征动脉粥样硬化内皮YAP/TAZ激活数据集
Hutchinson-Gilford早衰综合征（HGPS）是一种极为罕见的疾病，由progerin的表达引起，progerin是一种由LMNA基因新生点突变产生的异常蛋白
基本信息
资源简介
Hutchinson-Gilford早衰综合征动脉粥样硬化内皮YAP/TAZ激活数据集
PRJEB71629 数据集围绕 Hutchinson-Gilford 早衰综合征（HGPS）中的血管病变机制展开，该病由 LMNA 基因新生点突变所产生的异常蛋白 progerin 表达所引起，患者表现为加速衰老，并主要死于动脉粥样硬化并发症。为解析动脉壁内高度异质的细胞亚群在疾病发生与进展中的分子与功能改变，该研究采用单细胞 RNA 测序刻画了表达 progerin 的 LmnaG609G/G609G 小鼠与野生型对照主动脉的细胞与分子图谱，并结合去细胞主动脉的原子力显微镜检测内皮下细胞外基质（ECM）硬度以及活体超声监测主动脉血流。数据集归属于心血管系统疾病 / 动脉粥样硬化方向，来源于 ebi.ac.uk，可为 HGPS 相关动脉粥样硬化的细胞类型特异性机制研究与治疗靶点发现提供支撑。
【数据集背景】
Hutchinson-Gilford 早衰综合征是一种极为罕见的疾病，其根本原因在于 LMNA 基因发生新生点突变，由此表达出异常蛋白 progerin。HGPS 患者呈现加速衰老的表型，并因动脉粥样硬化并发症而过早死亡。要在 HGPS 中理解血管疾病的起病与进展、并发现新的治疗靶点，关键在于识别动脉壁中高度异质的细胞亚群所发生的细胞类型特异性分子与功能改变。该数据集正是针对这一需求，对表达 progerin 的 LmnaG609G/G609G 小鼠模型及野生型对照的主动脉开展研究。
【数据内容】
数据集的核心内容是 progerin 表达小鼠与野生型对照主动脉的单细胞 RNA 测序所获得的细胞与分子图谱，用于刻画主动脉内的细胞组成与分子特征。除转录组层面的内容外，研究还涉及两类与血管功能相关的测量：一是对去细胞主动脉以内皮下细胞外基质（ECM）硬度为对象、采用原子力显微镜进行的分析；二是对活体主动脉血流进行的超声监测。数据集所属分类为心血管系统疾病 / 动脉粥样硬化。
【采集与来源】
该数据集来源于 ebi.ac.uk。研究对象为表达 progerin 的 LmnaG609G/G609G 小鼠以及野生型对照。所采用的技术手段包括单细胞 RNA 测序（用于主动脉细胞与分子图谱的刻画）、原子力显微镜（用于去细胞主动脉内皮下 ECM 硬度的分析）以及活体超声（用于主动脉血流的监测）。源站描述在超声监测部分于“ultrasoun”处截断，其后内容未提供。
【适用场景】
基于其内容构成，该数据集适用于围绕 HGPS 相关动脉粥样硬化的机制研究，尤其是需要在动脉壁异质细胞亚群中识别细胞类型特异性分子与功能改变的场景；也可用于比较 progerin 表达小鼠与野生型对照在主动脉细胞图谱、内皮下 ECM 硬度及主动脉血流方面的差异。源站描述明确指出，理解 HGPS 中血管疾病的起病与进展以及发现新的治疗靶点，依赖于此类细胞类型特异性改变的识别。
【使用方法】
源站未提供。
【质量与限制】
源站未提供。
【引用与许可】
源站未提供。
下载信息
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暂未开放公开下载
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使用方式
数据集获取
源站：https://ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB71629
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Hutchinson-Gilford早衰综合征（HGPS）是一种极为罕见的疾病，由LMNA基因新生点突变所产生的异常蛋白progerin的表达所致。HGPS患者表现出加速衰老并过早死亡，主要死于动脉粥样硬化并发症。要理解HGPS中血管疾病的发病与进展并发现新的治疗靶点，关键在于识别动脉壁中高度异质性细胞亚群里的细胞类型特异性分子与功能改变。我们采用单细胞RNA测序技术，对表达progerin的LmnaG609G/G609G小鼠及野生型对照的主动脉细胞与分子图谱进行了表征。通过原子力显微镜对去细胞化主动脉的内皮下细胞外基质（ECM）硬度进行分析，并通过超声评估在体内监测主动脉血流。在动脉粥样硬化研究中，我们使用了早衰且易患动脉粥样硬化的Apoe–/– LmnaG609G/G609G小鼠。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
