腹主动脉瘤组织蛋白质提取标准操作流程数据集:提升蛋白质组学应用

主题标签:腹主动脉瘤、蛋白质提取、标准操作流程、蛋白质组学、心血管系统疾病、PRIDE。本站分类:心血管系统疾病/腹主动脉瘤

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蛋白质预测腹主动脉瘤蛋白质提取标准操作流程蛋白质组学心血管系统疾病PRIDE
Data from: A Standard Operating Procedure for Protein Extraction from Abdominal Aortic Aneurysm Tissue: Enhancing Proteomics Applications

基本信息

模态
蛋白质
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

腹主动脉瘤组织蛋白质提取标准操作流程数据集:提升蛋白质组学应用

该数据集为一项围绕腹主动脉瘤组织蛋白质提取标准操作流程而建立的数据集,英文名称为“Data from: A Standard Operating Procedure for Protein Extraction from Abdominal Aortic Aneurysm Tissue: Enhancing Proteomics Applications”。其主题涉及腹主动脉瘤、蛋白质提取、标准操作流程、蛋白质组学以及心血管系统疾病,并在本站归入心血管系统疾病/腹主动脉瘤分类。数据集来源于 ebI.ac.uk,源站记录显示作者为 Rui Vitorino,年份为 2026 年,数据集与 PRIDE 项目 PXD060417 相关联。整体而言,该数据集服务于腹主动脉瘤组织蛋白质组学研究中对标准化蛋白质提取流程的需求,为相关实验操作与蛋白质组学应用提供参考依据。

【数据集背景】

腹主动脉瘤属于心血管系统疾病范畴,其组织样本的蛋白质组学研究对于理解疾病相关蛋白变化具有重要意义。蛋白质提取是蛋白质组学工作流程中的关键前置步骤,提取效果直接影响后续分析结果。该数据集以“腹主动脉瘤组织蛋白质提取标准操作流程”为主题,旨在为增强蛋白质组学应用提供规范化的操作依据。数据集在分类上归属于心血管系统疾病/腹主动脉瘤,主题标签涵盖腹主动脉瘤、蛋白质提取、标准操作流程、蛋白质组学、心血管系统疾病与 PRIDE。

【数据内容】

该数据集的内容围绕腹主动脉瘤组织蛋白质提取的标准操作流程展开,服务于蛋白质组学应用。其主题标签明确指向腹主动脉瘤、蛋白质提取、标准操作流程、蛋白质组学、心血管系统疾病以及 PRIDE。数据集英文名称进一步表明,其核心内容为“A Standard Operating Procedure for Protein Extraction from Abdominal Aortic Aneurysm Tissue: Enhancing Proteomics Applications”。除上述主题与名称信息外,源站未提供关于数据内容的具体组成、文件类型、样本数量或数据规模的进一步说明。

【采集与来源】

该数据集来源于 ebi.ac.uk。源站描述显示,其引用信息为:Rui Vitorino (2026). A Standard Operating Procedure for Protein Extraction from Abdominal Aortic Aneurysm Tissue: Enhancing Proteomics Applications [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD060417。由此可知,该数据集与 PRIDE 项目 PXD060417 相关联,作者为 Rui Vitorino,年份为 2026 年。除上述来源与引用信息外,源站未提供关于样本采集地点、采集时间、采集方法或伦理审批等具体信息。

【适用场景】

该数据集适用于腹主动脉瘤组织蛋白质组学研究中与蛋白质提取相关的场景,尤其是需要参考标准操作流程以增强蛋白质组学应用的情形。其主题标签涵盖腹主动脉瘤、蛋白质提取、标准操作流程、蛋白质组学、心血管系统疾病与 PRIDE,表明其可服务于心血管系统疾病领域中腹主动脉瘤的蛋白质组学实验设计与操作参考。除上述适用方向外,源站未提供关于具体应用案例、适用实验平台或下游分析类型的进一步说明。

【使用方法】

该数据集的使用应围绕腹主动脉瘤组织蛋白质提取的标准操作流程展开,并可用于蛋白质组学应用的相关参考。由于其与 PRIDE 项目 PXD060417 相关联,使用者可通过源站提供的项目链接获取该数据集。除上述获取途径与使用方向外,源站未提供关于具体操作步骤、参数设置、软件工具或数据处理流程的进一步说明。

【质量与限制】

该数据集以标准操作流程为主题,旨在增强蛋白质组学应用,其来源为 ebi.ac.uk,并与 PRIDE 项目 PXD060417 相关联。除上述信息外,源站未提供关于数据质量评估、验证结果、局限性说明或潜在偏差的进一步信息。

【引用与许可】

该数据集的引用信息为:Rui Vitorino (2026). A Standard Operating Procedure for Protein Extraction from Abdominal Aortic Aneurysm Tissue: Enhancing Proteomics Applications [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD060417。除上述引用信息外,源站未提供关于许可条款、使用限制或授权方式的进一步说明。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD060417

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Rui Vitorino (2026). A Standard Operating Procedure for Protein Extraction from Abdominal Aortic Aneurysm Tissue: Enhancing Proteomics Applications [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD060417

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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