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医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

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图像分类目标检测语义分割

共 1367 个数据集

药物发现与化学化学信息学药物-靶点相互作用

Davis 激酶亲和力 — 激酶抑制剂 Kd 矩阵

442 种激酶 × 72 种抑制剂30,056 个 Kd 测量（社区标准版）pKd 范围约 5.0–10.8开放下载（CC BY 4.0）不适用（体外药物-靶点结合数据，无患者）

442 种激酶 × 72 种抑制剂的全激酶组 Kd 亲和力矩阵

Ambit Biosciences（Davis et al., Nature Biotechnology 2011） url: https://www.nature.com/articles/nbt.1990 70

药物发现与化学医学问答与基准化学信息学虚拟筛选评测基准

LIT-PCBA — 真实实验来源虚拟筛选基准

15 个靶标集约 41.5 万化合物PubChem 试验来源AVE 去偏划分免费下载约 41.5 万个化合物（7,844 活性 + 407,381 非活性，论文口径）

15 靶标 41.5 万化合物：PubChem 真实高通量筛选实验衍生的无偏虚拟筛选基准

Laboratoire d'Innovation Thérapeutique, UMR 7200 CNRS–Université de Strasbourg url: http://drugdesign.unistra.fr/LIT-PCBA/ 103

医学影像乳腺癌图像分类挑战赛数据集病理图像

BreastPathQ — 乳腺癌细胞增殖定量挑战

3,698 patch96 WSI55 名 NAT 后患者H&E 20X 扫描0-1 连续 TC 标签需申请下载55 名乳腺癌新辅助治疗后患者（NAT 后残余病变）

新辅助治疗后乳腺癌 H&E patch 肿瘤细胞占比回归 · 3,698 patch · 55 患者

SPIE BreastPathQ Grand Challenge（官方组织方） url: https://breastpathq.grand-challenge.org/ 72

医学影像电子健康记录临床电子病历皮肤影像

PAD-UFES-20 — 智能手机皮肤癌筛查数据集

2,298 张临床照片1,373 名患者6 类诊断3.35 GB PNG+CSVCC BY 4.0 开放1,373 名患者

2,298 张智能手机临床照片 + 1,373 名患者临床特征，6 类皮肤病变多模态基准

Universidade Federal do Espírito Santo (UFES) — LABCIN & PAD url: https://data.mendeley.com/datasets/zr7vgbcyr2 83

公共卫生与流行病学神经科学转录组

Allen Brain Atlas — 多模态脑图谱

约 20,000 个基因 ISH3,702 个人脑微阵列样本非商业免费须引用非患者队列（脑组织转录组/连接组研究图谱）

全脑基因表达+连接组+细胞类型多模态公共图谱

Allen Institute for Brain Science url: https://portal.brain-map.org/ 66

生理信号可穿戴传感时序数据步态与运动

MHEALTH — 穿戴多传感器活动识别基准

10 名受试者12 类身体活动23 个传感器通道50 Hz 采样72.1 MB 文本日志10 名健康志愿者（非患者队列）

10 名受试者 × 23 通道穿戴多模态信号 × 12 类身体活动

UCI 机器学习库（数据收集：西班牙格拉纳达大学 CITIC-UGR） url: https://archive.ics.uci.edu/dataset/319/mhealth+dataset 77

医学影像电子健康记录皮肤影像真实世界数据

SCIN — 众包真实世界皮肤影像

约 10,408 张 PNG 照片5,033 个贡献案例12.6 GB 免费开放下载加权鉴别诊断标注5,033 个公众贡献案例（约 5,000 余名美国志愿者）

10,408 张众包皮肤状况照片与加权鉴别诊断标注，覆盖美国公众常见皮肤病谱

Google Research 与 Stanford Medicine url: https://github.com/google-research-datasets/scin 58

医学影像手术视频内窥镜影像医学图像分割结直肠癌

HeiCo — 结直肠腹腔镜手术器械分割

30 段结直肠腹腔镜视频14 类手术相位10,040 帧实例分割掩码CC BY-NC-SASynapse 申请获取30 例结直肠腹腔镜手术视频

30 段结直肠腹腔镜视频 + 14 相位 + >10,000 帧实例分割标注

DKFZ / Heidelberg University Hospital url: https://link.springer.com/article/10.1038/s41597-021-00882-2 71

电子健康记录临床电子病历医疗登记流行病学重症监护

CUB-Réa — 法国大巴黎 ICU 多中心登记队列

约 475,357 次 ICU 入院35-40 家大巴黎 ICU1993 年起前瞻采集申请审核获取累计 47.5 万+ 次 ICU 入院（1997-2016 公开研究口径）

累计 47.5 万+ 次 ICU 入院的大巴黎多中心重症监护登记库

CUB-Réa Network（SRLF 发起，AP-HP 资助） url: https://doi.org/10.1164/rccm.2201087 50

药物发现与化学虚拟筛选肿瘤学

PRISM — 池化条码肿瘤细胞系药敏数据集

4,518 化合物 × 578 细胞系非患者细胞系数据CSV 免费下载DepMap 持续更新非患者数据，细胞系药敏数据

分子条码池化测活 · 4,518 化合物 × 578 细胞系 · 药物重定位

Broad Institute — Cancer Dependency Map (DepMap) url: https://depmap.org/repurposing/ 84

神经科学电子健康记录脑影像队列研究

ADHD-200 — 注意力缺陷多动障碍脑成像竞赛数据集

776 名训练受试者285 ADHD491 对照8 个国际中心rs-fMRI+T1+表型776 名训练受试者（另 197 名留出测试）

8 中心 973 人 ADHD/对照儿童 rs-fMRI+T1 竞赛开放数据

ADHD-200 Consortium / INDI（1000 Functional Connectomes Project） url: http://fcon_1000.projects.nitrc.org/indi/adhd200/ 66

电子健康记录多模态时序数据重症监护

MIMIC-IV 全球规模最大的重症监护公开数据集 · 36.4 万患者 EHR

约 7GB（CSV）约 450GB（含影像）36.4 万名患者

MIT 计算生理学实验室 & 贝斯以色列女执事医疗中心 289

定制数据集服务

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