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医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

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图像分类目标检测语义分割

共 1802 个数据集

医学影像内窥镜影像医学图像分割图像分类评测基准

HyperKvasir — 胃肠道内镜息肉检测数据集

人工标注影像数据原始数据未标注数据患者级数量未披露（110,079 张图像 + 374 条视频，来自 2008-2016 年常规检查，全匿名化）

Bærum 医院胃肠内镜全消化道数据集——110,079 张图像（10,662 张 23 类专家标注 + 99,417 张未标注）+ 1,000 张息肉像素级分割 + 374 条视频，CC BY 4.0 于 OSF 公开直链，SimulaMet 半监督医学影像 AI 的标准底座

挪威 Bærum 医院（Vestre Viken）2008-2016 年常规胃镜/肠镜原片（Olympus/Pentax 设备，Picsara 系统导出，全匿名）+ 专家 23 类标注 + Labelbox 息肉像素级掩码与边界框 46

医学影像图像分类挑战赛数据集

ACOUSLIC-AI

人工标注影像数据原始数据600 例 cine loop（训练 300 + 验证 10 + 测试 290）；每例约 840 帧（官网口径）

MICCAI 2024 附属挑战赛与配套公开数据集：塞拉利昂 3 卫生单元新手盲扫 cine 300 例公开训练集（每例 840 帧、744×562、0.28 mm/px），16 队参赛 6 进决赛，Top-3 算法开源，首个低收入国家盲扫胎儿超声公开数据集

塞拉利昂 3 个公共卫生单元（PHU，训练集）+ 坦桑尼亚 2 个 PHU 与一家欧洲医院（验证/测试集）的新手操作者盲扫 cine 胎儿腹部超声；MicrUs Pro-C60S（Telemed）低成本设备；744×562 px、0.28 mm/px；逐帧标准平面标签 + 标准帧腹围椭圆标注（经验丰富阅片者） 53

医学影像MRI医学图像分割挑战赛数据集脑肿瘤肿瘤学

BraTS-MEN — BraTS 脑膜瘤赛道双数据集：2023 术前四序列分割 1424 例 + 2024/2025 放疗规划 T1c 靶区 750 例

人工标注影像数据原始数据BraTS-MEN 2023：1,424 例（训练 1,000／验证 141／测试 283）；BraTS-MEN-RT 2024：750 例（训练 500／验证 70／测试 180）；两实体公开可得合

BraTS 挑战赛脑膜瘤支线数据集家族：2023 届 BraTS-MEN 六中心 1424 例术前四序列 mpMRI 三亚区专家标注分割集 + 2024 届 BraTS-MEN-RT 750 例放疗规划单序列 T1c 靶区集，Synapse 注册获取

BraTS Pre-operative Meningioma Dataset（Duke／Thomas Jefferson／UCSF／Yale／UPenn／Missouri 六中心术前四序列 mpMRI + ET/NET/SNFH 三亚区掩码，FeTS 工具链预处理至 SRI24 空间 1mm³）+ BraTS-MEN-RT Dataset（放疗规划 3D T1c 原生分辨率 + 单 target volume 标签 + 临床元数据表，dcmrtstruct2nii 转换 + AFNI defacing） 86

医学影像医学图像分割评测基准

TG3K — 3,585 张甲状腺腺体超声分割数据集（TN3K 腺体先验姊妹集）

人工标注影像数据原始数据16 段三维超声视频（未按患者去重口径公开；论文仅交代视频段数，不公布患者例数）

中山大学团队随 TRFE+/TRFE-Net 论文发布的开放获取甲状腺腺体超声分割数据集——3,585 张灰度超声图配像素级二值腺体掩码，由 Wunderling et al. 2017 的 16 段三维超声视频抽帧并按腺体面积占比大于 0.06 筛选而来，与结节分割姊妹集 TN3K 共享论文、代码仓库与下载包，在 TRFE+ 多任务框架中充当腺体区域先验分支的监督数据

Wunderling et al. 2017 的 16 段三维超声（3DUS）记录抽帧（GE Logiq E9 XDclear 2.0 + Ascension driveBay 电磁追踪）：3,585 张灰度超声图 + 像素级二值腺体掩码（thyroid-image/ 与 thyroid-mask/ 目录同名对应）+ tg3k-trainval.json；腺体面积占比大于 0.06 的帧被保留 84

医学影像眼科影像图像分类

OCTDL

人工标注影像数据原始数据821 患者 / 2064 张 B-scan（患者级去重）；年龄 20-93 岁（均值 63），男:女 = 3:2；年龄/性别/眼别仅对可公开患者提供（OD/OS）

2064 张黄斑 OCT B-scan、821 患者、7 类视网膜疾病的开源分类数据集——7 名医学生初标、2 名资深专家复标、诊所主任终审的三级标注流水线，Optovue Avanti RTVue XR 采集，数据 CC BY 4.0、代码 Apache-2.0，Zenodo 与 Mendeley 双托管并附官方 VGG16/ResNet50 分类基线

Optovue Avanti RTVue XR 黄斑光栅扫描 OCT B-scan（轴向 5 μm/横向 15 μm，SLD 840 nm，中心凹对准，扫描长度与分辨率动态），JPG 按疾病分文件夹（[label]/[label]_[patient_id]_[n].jpg），OCTDL_labels.csv 十列元数据（file_name/disease/subcategory/condition/patient_id/eye/sex/year/宽高） 61

药物发现与化学药物安全化学信息学图像分类虚拟筛选

TOX21 — 计算毒理学高通量筛选基准数据集

约 7,831 化合物12 毒性终点约 25MB 下载公共领域许可体外高通量筛选数据集

7,831化合物 · 12毒性终点 · qHTS · 多任务分类 · MoleculeNet标准基准 · 公共领域

NIEHS/NTP · EPA · NIH/NCATS · FDA url: https://tripod.nih.gov/tox21/ 133

医学影像X光影像医学图像分割

MIMIC-CXR-Ext-ILS — 指令引导病灶分割数据集

分割掩码指令-答案对大规模标注191,563 张 CXR 图像（MIMIC-CXR 派生，全自动管线生成标注）

110 万条指令分割对：CVPR 2026 的全自动管线教会 AI'指哪打哪'

MIMIC-CXR DICOM+报告经四阶段 LLM 管线自动生成标注（四名放射肿瘤专家验证） 68

生理信号神经科学心血管疾病糖尿病视网膜病变多模态

Cerebral Vasoregulation in Diabetes — 糖尿病患者的脑血管调节研究数据

生理信号时序数据队列研究86 人（37 例糖尿病 + 49 例健康对照，年龄 55–75 岁）

BIDMC 老年晕厥与跌倒实验室 86 例（37 型糖尿病 + 49 对照，55–75 岁）多模态脑血管自动调节测量：经颅多普勒 MCA/BRA、呼气末 CO₂ 反应、Valsalva、头高位倾斜与坐立测试，PhysioNet v1.0.0 公开（DOI 10.13026/m40k-4758）

BIDMC 老年晕厥与跌倒实验室多模态测量：经颅多普勒（MCA/BRA 血流速度）+ 呼气末 CO₂/O₂/呼吸 + 连续心电血压（Portapress）+ 3T MRI（T1/T2/MRA）+ 平衡步态 + Pedar 足底压力；任务含低碳酸/高碳酸反应、Valsalva、头高位倾斜（day1/day2）、坐立测试 35

医学问答与基准医疗NLP生物医学文献医学问答关系抽取评测基准

MedHop — 跨文档多跳推理的医学药物相互作用阅读理解数据集

自动构建文本数据知识图谱0（非患者数据；为文献摘要问答实例）｜实例口径：train 1,620 / dev 342 / test 546，合计 2,508 例查询

QAngaroo 项目医学半边：以 DrugBank/Reactome/Swiss-Prot 的远监督信号从 2016 版 Medline 摘要自动构建的 2,508 题多跳阅读理解基准——查询『两药是否相互作用』，证据须沿『药物—靶点蛋白—蛋白—药物』反应链跨 36.4 篇文档串起，姊妹数据集 WikiHop 同论文同格式同期发布，test 集长期封闭盲评

Zenodo records/6407401（qangaroo_v1.1.zip，339.8 MB，md5 dd4f65d2f73244c0946b5810e24a8e43）；官方站 qangaroo.cs.ucl.ac.uk；HuggingFace bigbio/medhop（train+validation）；社区镜像 OpenDataLab MedHop 43

医学影像MRI医学图像分割脑肿瘤肿瘤学

BraTS-Africa

人工标注影像数据原始数据146 例患者（95 例弥漫性胶质瘤 + 51 例其他脑肿瘤）；挑战赛口径 2023 年 95 例 / 2024 年 115 例

撒哈拉以南非洲成人胶质瘤 mpMRI 分割数据集：146 例尼日利亚 1.5T 影像（95 例弥漫性胶质瘤+51 例其他脑肿瘤），MICCAI-CAMERA-Lacuna Fund 挑战赛 2023-2024 两届基准，专家三阶段标注，TCIA CC BY 4.0 公开——为 LMIC 资源受限场景补上全球脑瘤 AI 地图中最空缺的一块

尼日利亚多家诊断中心（TCIA 口径 6 家/NOAJ 论文口径 7 家）临床常规采集的回顾性术前脑 1.5T mpMRI（T1/T1-CE/T2/T2-FLAIR，2010-01~2022-12），经 AfNiA 汇总，按 BraTS 协议预处理（SRI24 配准、1mm³ 重采样、N4 校正、颅骨剥离）并三阶段专家标注 ET/NETC/SNFH 三肿瘤子区域 51

医学影像MRI脑影像挑战赛数据集评测基准

MRIxFields2026 — 跨磁场强度脑 MRI 协调与翻译挑战赛

影像数据原始数据配对数据回顾性非配对约 1056 例（ID 0001–1056 按场强分块）+ 前瞻配对 40 位流动志愿者；图像级展开口径见正文 §4 双口径存照

MICCAI 2026 卫星挑战赛：0.1T–7T 五档磁场强度、T1W/T2W/T2FLAIR 三模态、前瞻配对与回顾非配对混合脑 MRI，三任务评测 nRMSE/SSIM/LPIPS/Dice-14核团/体积一致性，Synapse 门控获取、代码与基线权重 MIT 全开

多中心 0.1T/1.5T/3T/5T/7T 脑 MRI（Siemens Healthineers、United Imaging Healthcare 联影、Point Imaging 设备），T1W/T2W/T2FLAIR，NIfTI 364×436×364 @0.5mm MNI float32；前瞻 travelling volunteers 配对 + 回顾非配对 70

医学影像内窥镜影像图像分类评测基准

LIMUC: Labeled Images for Ulcerative Colitis — 溃疡性结肠炎内镜 Mayo 评分 11,276 图专家标注数据集

人工标注影像数据原始数据564 名 UC 患者（11,276 张图像 / 1,043 次结肠镜操作，2011-12 至 2019-07）

马尔马拉大学医学院胃肠病学科 2011-12 至 2019-07 采集的 11,276 张结肠镜图像、564 名 UC 患者、1,043 次肠镜操作的 Mayo 内镜评分（MES 0-3）四分类专家标注数据集——双盲双专家加第三专家仲裁多数投票，官方 10 折交叉验证与固定测试集防泄漏，回归式深度学习融入类间有序距离，CC BY-4.0 于 Zenodo 公开直链

Marmara 大学医学院胃肠病学科 2011-12 至 2019-07 采集的结肠镜图像（统一缩放 352×288 BMP）+ Mayo 内镜评分（MES 0-3）三专家共识标注 + 官方 10 折交叉验证划分与固定测试集 + 按患者组织的全量图像包（patient_based_classified_images.zip） 63

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