即取即用的 AI-Ready 医疗数据集库

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医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

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图像分类目标检测语义分割

共 343 个数据集

医学影像乳腺癌图像分类挑战赛数据集病理图像

BreastPathQ — 乳腺癌细胞增殖定量挑战

3,698 patch96 WSI55 名 NAT 后患者H&E 20X 扫描0-1 连续 TC 标签需申请下载55 名乳腺癌新辅助治疗后患者（NAT 后残余病变）

新辅助治疗后乳腺癌 H&E patch 肿瘤细胞占比回归 · 3,698 patch · 55 患者

SPIE BreastPathQ Grand Challenge（官方组织方） url: https://breastpathq.grand-challenge.org/ 71

公共卫生与流行病学神经科学转录组

Allen Brain Atlas — 多模态脑图谱

约 20,000 个基因 ISH3,702 个人脑微阵列样本非商业免费须引用非患者队列（脑组织转录组/连接组研究图谱）

全脑基因表达+连接组+细胞类型多模态公共图谱

Allen Institute for Brain Science url: https://portal.brain-map.org/ 59

神经科学电子健康记录脑影像队列研究

ADHD-200 — 注意力缺陷多动障碍脑成像竞赛数据集

776 名训练受试者285 ADHD491 对照8 个国际中心rs-fMRI+T1+表型776 名训练受试者（另 197 名留出测试）

8 中心 973 人 ADHD/对照儿童 rs-fMRI+T1 竞赛开放数据

ADHD-200 Consortium / INDI（1000 Functional Connectomes Project） url: http://fcon_1000.projects.nitrc.org/indi/adhd200/ 64

基因组学与多组学药物发现与化学蛋白质组学分子对接

52 万 DICOM 影像 · 20.6 万次超声检查 · 可关联 MIMIC-IV 全院 EHR

MIT Laboratory for Computational Physiology / PhysioNet（BIDMC 采集） url: https://physionet.org/content/mimic-iv-echo/1.0.1/ 28

医学影像基因组学与多组学MRIX光影像脑肿瘤

REMBRANDT — 胶质瘤影像与基因组配对数据集

110,020 张 MR 图像130 例 MRI 患者671 例基因组临床患者10.59 GB DICOM874 例分子标本受控影像+公开组学130 例（MRI）；671 例（基因组/临床）

130 例胶质瘤 MRI 配对 671 例基因组临床数据的放射组学奠基数据集

National Cancer Institute（现由 Georgetown University ICBI 与 TCIA 托管） url: https://www.cancerimagingarchive.net/?p=43429 66

医学影像医学问答与基准内窥镜影像医学图像分割评测基准

CVC-ColonDB — 结肠镜息肉分割经典基准

380 帧结肠镜图像15 段检查序列574×500 像素像素级二值息肉 mask原始版含 1,706 个文件（4 组）研究用途免费获取15 例结肠镜检查（各文献记载 13–15 例不一）

380 帧专家标注结肠镜息肉分割图像，源自 15 段检查序列的单中心经典基准

Computer Vision Center, Universitat Autònoma de Barcelona（CVC-UAB） url: http://mv.cvc.uab.es/projects/colon-qa/cvc-colondb 99

医学影像手术视频医学图像分割

AutoImplant — 颅骨植入体自动设计挑战

630 个 NRRD 文件（2020 届）570+100 个三元组（2021 届 SkullBreak）512×512×Z 二值体素CC BY-NC-SA 4.0 免费获取非患者队列：合成数据共 344 个颅骨（2020 届 210 + 2021 届 134），不含人口学信息

CQ500 合成颅骨缺损基准：210 颅骨 + 670 三元组，MICCAI 两届挑战

Graz University of Technology (TU Graz) — Institute of Computer Graphics and Vision url: https://autoimplant.grand-challenge.org/ 44

医学影像电子健康记录病理图像神经退行性疾病队列研究阿尔茨海默病

ROS/MAP — 老化与阿尔茨海默病纵向多组学队列

约 3,322 名入组者（截至 2017-10）1,475 例死后脑尸检7 类组学模态2,093 人已基因分型（截至 2018-03）受控访问（DUC）截至 2017-10 入组 3,322 人（其中 1,475 例死后脑捐赠）

两条纵向队列、3,322 名入组、1,475 例死后脑多组学图谱

Rush University Medical Center — Rush Alzheimer's Disease Center（经 AMP-AD / Synapse AD Knowledge Portal 开放） url: https://adknowledgeportal.synapse.org/Explore/Studies/DetailsPage/StudyDetails?Study=syn3219045 103

医疗NLP临床文本命名实体识别关系抽取

RadGraph — 放射报告实体关系抽取数据集

600 份医师金标报告22 万份推理标注报告token 级实体关系 schemaPhysioNet 凭证许可源自 MIMIC-CXR/CheXpert 的脱敏放射报告（数十万级报告对应的检查）

600 份医师金标报告 + 22 万份推理标注、token 级 schema 的报告结构化基础设施

https://physionet.org/content/radgraph/ 111

多模态医学影像医学问答与基准医疗NLP

GMAI-MMBench — 通用医疗多模态评测基准

284 源数据集约 26K 选择题38 模态 18 科室4 级感知粒度NeurIPS 2024 D&B题目源自 284 个脱敏医学数据集（公开 268 + 医院合作 16）

284 源数据集 · 38 模态 · 26K 选择题 · 4 级感知粒度的 LVLM 医疗能力标尺

https://huggingface.co/datasets/OpenGVLab/GMAI-MMBench 44

定制数据集服务

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