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医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

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图像分类目标检测语义分割

共 343 个数据集

医学影像CT医学图像分割挑战赛数据集肿瘤学

KiTS23 — 肾脏肿瘤分割挑战赛数据集（MICCAI 2023）

599 例增强腹部 CT489 训练110 测试kidneytumorcyst 三类体素标注NIfTI .nii.gz 格式期相异构（皮髓质期为主+肾实质期新增）临床元数据随仓库更新599 例 CT 扫描（489 例训练公开标注 + 110 例测试官方持有标注）

599 例双期相 CT 肾脏/肿瘤/囊肿三类分割，Sørensen-Dice + Surface Dice 双指标 rank-then-aggregate 官方排名，MICCAI 2023 挑战赛

明尼苏达大学机器人研究所（MnRI）、Helmholtz Imaging（DKFZ）与克利夫兰诊所联合（M Health Fairview 2010-2022 回顾性队列；通讯作者 Nicholas Heller） url: https://kits23.kits-challenge.org/ 75

电子健康记录公共卫生与流行病学儿科脑影像队列研究

ABCD — 青少年脑发育纵向队列

约 100 TB 多模态11,878 名儿童21 个采集点随访至成年需 NDADAC 申请1.2 万名儿童（11,878 基线）

迄今最大青少年脑发育多模态纵向队列 · 11,878 名 · 随访至成年

Adolescent Brain Cognitive Development Consortium / NIMH Data Archive url: https://nda.nih.gov/abcd 72

医学影像公共卫生与流行病学脑影像

ENIGMA — 国际多中心脑影像遗传联盟

50 个活跃工作组43 国 200+ 机构GWAS 汇总 51,665 人26 种脑疾病协议公开共享汇总统计申请获取代表性 GWAS 汇总 30,717-51,665 名受试者

50 个工作组、43 国 200+ 机构的分布式脑影像遗传荟萃分析联盟

ENIGMA Consortium（USC Stevens 神经影像与信息学研究所） url: http://enigma.ini.usc.edu/ 76

药物发现与化学化学信息学虚拟筛选

ZINC — 全球最大可购买化合物虚拟筛选数据库

375亿化合物 · 150+供应商化合物

375亿化合物 · 150+供应商 · 超大规模对接 · UCSF · 免费使用

是由加州大学旧金山分校（UCSF）制药化学系 Irwin & Shoichet 实验室开发和维护的免费化合物数据库 133

医学影像基因组学与多组学影像-文本对齐

MultiMedBench — 谷歌医学多任务多模态基准

14 项任务12 个数据集超 100 万样本7 种数据模态许可证混合（部分需 CITI 认证）无统一打包下载Google Research 发布超 100 万样本（12 个去标识化数据集）

Med-PaLM M 配套评测基准 · 14 任务 12 数据集 7 模态 · 超 100 万样本

Google Research & Google DeepMind url: https://research.google/pubs/towards-generalist-biomedical-ai/ 96

医学影像图像分类病理图像肿瘤学乳腺癌

BreakHis — 乳腺癌组织病理图像数据库

7,909 张 H&E 显微图像82 名患者40×-400× 四倍率约 4 GB PNG免费非商业使用82 名患者

乳腺癌病理图像分类的事实基准 · 7,909 张图像 · 82 名患者

巴西巴拉那联邦大学（UFPR）VRI 实验室 & P&D Laboratory url: https://web.inf.ufpr.br/vri/databases/breast-cancer-histopathological-database-breakhis/ 64

医学影像图像分类病理图像结直肠癌肺癌肿瘤学

LC25000 — 肺与结肠 H&E 病理图像分类基准

25,000 张 H&E 图像768×768 JPEG1.85 GB ZIP5 类各 5,000 张免费开放下载病例数未披露（1,250 个原始组织 tile，患者与玻片层级元数据未公开）

25,000 张 H&E 肺与结肠病理图像，5 类均衡分类基准

James A. Haley Veterans' Hospital 病理科 / University of South Florida url: https://github.com/tampapath/lung_colon_image_set 41

医学影像CT医学图像分割肿瘤学肺癌

LCTSC — 肺癌放疗 CT 正常器官勾画挑战

60 例胸部放疗 CT5 类正常器官勾画5.15GB DICOMCC BY 3.0 公开60 例患者

60 例胸部放疗 CT + 5 类正常器官勾画，TCIA 公开基准

The Cancer Imaging Archive (TCIA) url: https://www.cancerimagingarchive.net/collection/lctsc/ 80

神经科学公共卫生与流行病学脑影像

ABIDE — 自闭症脑成像多中心联盟开放数据集

约 2,226 个影像数据集539+521 名 ASD 受试者rs-fMRI + T1 + 73 字段表型CC BY-NC-SA 开放获取2,156 名独立受试者（官网口径 2,226 个数据集）

17+19 站点 2,226 个 rs-fMRI/T1 自闭症脑影像开放数据

ABIDE Consortium（NYU Langone / Nathan S. Kline Institute / Child Mind Institute） url: http://fcon_1000.projects.nitrc.org/indi/abide/ 54

医学影像CT肺癌

RIDER Lung CT — 重复扫描肺癌 CT 数据

32 例 NSCLC 重复扫描43.01GB DICOM六重建设置CC BY 4.0免费下载32 例患者

32 例 NSCLC 同日双 CT 重复扫描，六重建设置，影像组学可重复性金标准

Memorial Sloan Kettering Cancer Center（经由 The Cancer Imaging Archive） url: https://www.cancerimagingarchive.net/?p=43451 50

电子健康记录公共卫生与流行病学心血管疾病流行病学队列研究

Framingham Heart Study — 心血管流行病学奠基队列

- "约 15,000 名参与者（三代+Omni）" - "随访超 75 年" - "教学数据集免申请" - "dbGaPBioLINCC 申请获取" - "风险评分发源地"约 1.5 万名参与者

现代医学最长寿三代心血管队列 · 约 1.5 万人 · 随访 75 年+ · 风险评分发源地

name: "NHLBI & 波士顿大学弗雷明汉心脏研究" url: "https://www.framinghamheartstudy.org/" 59

基因组学与多组学心血管疾病肿瘤学队列研究

TOPMed — 心肺血液睡眠多组学旗舰

96,620 份 30x WGS（freeze 8）约 4.28 亿过 QC 变异RNA-seq甲基化代谢组多组学dbGaP 受控访问逾 18 万名参与者（WGS freeze 8 为 96,620 人）

逾 18 万份 30x 全基因组 + 深度表型的心肺血液睡眠精准医学资源

National Heart, Lung, and Blood Institute (NHLBI), NIH url: https://topmed.nhlbi.nih.gov 56

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