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医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

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图像分类目标检测语义分割

共 50 个数据集

Open-PMC-18M | 生物医学多模态视觉-语言数据集 | 千方医数集

多模态视觉-语言文献挖掘图像-文本对

Open-PMC-18M | 生物医学多模态视觉-语言数据集 | 千方医数集

约 1800 万对图文对放射学显微镜VLP 三模态PMC 来源文献来源数据集

Vector Institute (https://vectorinstitute.ai) | PMC Open Access Subset (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/tools/openftlist/) 45

PDB 蛋白质数据银行 | 千方医数集

蛋白质结构结构生物学药物发现分子对接

PDB 蛋白质数据银行 | 千方医数集

约21万+结构约500GB压缩X-raycryo-EMNMR分子级数据

wwPDB 联盟（RCSB PDB / PDBe / PDBj / EMDB / BMRB / PDBc）— https://www.wwpdb.org 22

CAMELYON16/17 — 乳腺癌淋巴结转移全切片检测基准数据集 | 千方医数集

计算病理学全切片图像乳腺癌淋巴结转移深度学习基准

CAMELYON16/17 — 乳腺癌淋巴结转移全切片检测基准数据集 | 千方医数集

bigTIFF WSIXML 标注CC0AWS 公开数据约 400 名乳腺癌患者 (CAMELYON16) + 200 名人造患者 (CAMELYON17, 5 张/人

荷兰 5 家医学中心 (RUMC, UMCU, CWZ, LPON, RST) 21

ANHIR (自动非刚性组织学图像配准) — 数字病理配准基准数据集 | 千方医数集

数字病理全切片图像挑战赛

ANHIR (自动非刚性组织学图像配准) — 数字病理配准基准数据集 | 千方医数集

355 张全切片图像481 个配准对18 种染色约 50GB 大小多物种 (小鼠/人类)

CTU Prague / grand-challenge.org · https://anhir.grand-challenge.org/ 20

BCNB (早期乳腺癌芯针活检) — 计算病理多示例学习数据集 | 千方医数集

数字病理乳腺癌多示例学习全切片图像腋窝淋巴结芯针穿刺

BCNB (早期乳腺癌芯针活检) — 计算病理多示例学习数据集 | 千方医数集

1058 名患者约 33 GBJPG WSI13 项临床特征1058 名

北京邮电大学 & 北京朝阳医院 (bcnb.grand-challenge.org) 35

TCGA 癌症基因组图谱 AI-Ready 数据集 | 千方医数集

多组学数据基因组学转录组学表观组学蛋白质组学

TCGA 癌症基因组图谱 AI-Ready 数据集 | 千方医数集

约 2.5 PB 规模约 20000 个样本33 种癌症类型7 种分子表征平台11000+ 名患者11,000+ 名患者

美国国家癌症研究所 (NCI) https://portal.gdc.cancer.gov/ 32

BraTS 脑肿瘤分割挑战赛 AI-Ready 数据集 | 千方医数集

MRI 影像脑肿瘤语义分割挑战赛基准

BraTS 脑肿瘤分割挑战赛 AI-Ready 数据集 | 千方医数集

约 4,500+ 病例约 200 GB 大小4 模态 MRI80+ 机构4,500+

MICCAI BraTS 组织委员会 / CBICA (宾夕法尼亚大学) 46

fastMRI — 全球最大的原始 k 空间 MRI 重建数据集 | 千方医数集

MRI重建k空间膝部MRI脑部MRI前列腺MRI乳腺MRI

fastMRI — 全球最大的原始 k 空间 MRI 重建数据集 | 千方医数集

约 1.45 TB HDF58876+ 例全采样20000+ 例 DICOM12+ 扫描仪代码 MIT 开源8,876+ 人

NYU Langone Health CAI2R + Meta AI Research (FAIR) · https://fastmri.med.nyu.edu/ 36

MedPix — NLM 放射影像教学数据库 AI-Ready Wikipedia | 千方医数集

多模态医学教育CT影像MRI影像

MedPix — NLM 放射影像教学数据库 AI-Ready Wikipedia | 千方医数集

约 5.9 万张图像约 1.2 万病例约 322 MB (MedPix-2.0)约 1.2 万人 / 2,050 例

NLM (https://medpix.nlm.nih.gov/) / University of Palermo (https://github.com/CHILab1/MedPix-2.0) 50

OASIS 脑影像系列数据集 | 千方医数集

神经影像脑MRIPET成像病例随访

OASIS 脑影像系列数据集 | 千方医数集

1378 名参与者~2842 次 MR 扫描~2157 次 PET 扫描约 2-5 TB 大小2,607 名参与者

华盛顿大学 Knight ADRC | https://sites.wustl.edu/oasisbrains/ 41

RSNA Series — RSNA 年度 AI 挑战赛系列数据集 AI-Ready Wikipedia | 千方医数集

医学影像放射学AI竞赛数据集多模态

RSNA Series — RSNA 年度 AI 挑战赛系列数据集 AI-Ready Wikipedia | 千方医数集

12 项挑战11 年编年约 360 万张影像400+ 名放射科专家累计 10 万+ 名患者

Radiological Society of North America 42

LIDC-IDRI — 肺结节 CT 影像参考数据库 AI-Ready Wikipedia | 千方医数集

CT影像肺部目标检测语义分割

LIDC-IDRI — 肺结节 CT 影像参考数据库 AI-Ready Wikipedia | 千方医数集

1,018 例 CT1,010 名患者7,371 个病灶四重放射科医师标注约 133 GB"1,010 名患者

国家癌症研究所（NCI）/ 国家卫生研究院基金会（FNIH）/ FDA 100

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