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医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

按任务类型浏览

图像分类目标检测语义分割

共 343 个数据集

生理信号医学问答与基准心电信号心血管疾病时序数据评测基准

MIT-BIH Arrhythmia — 心律失常标准心电数据库

约 104 MB48 条 30 分钟记录11 万次心拍标注免费直接下载47 名受试者

data_source: MIT Laboratory for Computer Science & Beth Israel Hospital url: https://physionet.org/content/mitdb/1.0.0/ 94

医疗NLP多模态影像-文本对齐生物医学文献

MedICaT — 医学图像-图注对齐数据集

217,060 幅医学插图131,410 篇开放获取论文7,507 对 subfigure 标注约 25,000 条 ROCO 引用约 104 GB 压缩包不适用（文献图文数据集，无患者队列）

217,060 幅医学论文插图 + 图注 + 图内引用的复合图对齐基准

Allen Institute for AI（与华盛顿大学等合作） url: https://github.com/allenai/medicat 43

医学影像医学问答与基准病理图像挑战赛数据集

ANHIR (自动非刚性组织学图像配准) — 数字病理配准基准数据集

355 张全切片图像481 个配准对18 种染色约 50GB 大小多物种 (小鼠/人类)

CTU Prague / grand-challenge.org · https://anhir.grand-challenge.org/ 86

医学影像医学问答与基准MRI挑战赛数据集肿瘤学

ATLAS — 肝肿瘤 CE-MRI 分割基准

["90 例 CE-MRI""训练 60 例测试 30 例""NIfTI 三分类标签""CC BY-NC-SA 4.0""注册后下载"]90 名不可切除肝细胞癌患者（训练 60 例 + 测试 30 例）

90 例不可切除 HCC 对比增强 MRI 的肝脏与肿瘤双标签分割基准

name: "法国第戎大学医院与勃艮第大学 ICMUB（ATLAS Challenge 组委会）" url: "https://atlas-challenge.u-bourgogne.fr/" 64

医学影像医学图像分割挑战赛数据集心血管疾病

CAMUS — 心脏超声多结构分割金标准

4.8 GB NIfTI 序列500 名患者2,000 帧手工标注非商业研究免费下载500 名患者（450 例带标注 / 50 例无标注测试集）

500 例患者、2,000 帧手工标注的心尖两腔与四腔心超声序列

CREATIS 实验室（里昂大学 / INSA Lyon）与圣艾蒂安大学医院心血管科 url: https://camus.creatis.insa-lyon.fr/challenge/ 87

医学影像MRI肿瘤学挑战赛数据集目标检测

PI-CAI — 前列腺 MRI 癌症 AI 基准

1,500 例 bpMRI 检查约 27.6GB MHA 压缩包CC BY-NC 4.0 非商业病灶级 AP + 患者级 AUROC1,500 例 MRI 检查（9,129 名患者的完整队列子集）

1,500 例多中心前列腺 bpMRI，csPCa 检测与 PI-RADS 分级基准

Radboud University Medical Center（Diagnostic Image Analysis Group，PI-CAI Consortium） url: https://pi-cai.grand-challenge.org/ 65

医学影像MRI医学图像分割挑战赛数据集心血管疾病

EMIDEC 挑战赛数据集 — 延迟增强心脏 MRI 心肌梗死评估

NIfTI 图像 + NIfTI 标签 + 临床文本（每例 3 个文件）150 例（50 正常100 急性心梗）150 例检查（训练 100 例 67P/33N + 分割测试 50 例 33P/17N；分类赛另有未公开独立测试集）

150 例成人急性心梗 DE-MRI · 心肌/梗死/无复流三区手工标注 · MICCAI 2020 STACOM 分割与分类双赛

勃艮第大学 ImViA 实验室 & 第戎大学医院（University of Burgundy, ImViA Laboratory & University Hospital of Dijon, France） url: https://emidec.com/dataset 45

医学影像神经科学病理图像脑影像

BigBrain — 超高分辨率人脑图谱

7,404 张组织学切片20 µm 各向同性 3D 重建原始扫描约 1 TBMINCNIfTI 双格式CC BY-NC-SA 4.0 开放下载1 名捐献者（65 岁男性，7,404 张切片）

7,404 张切片重建的 20 µm 级细胞分辨 3D 人脑参考图谱

Forschungszentrum Jülich（INM-1） & McGill University Montreal Neurological Institute url: https://bigbrainproject.org 42

医学影像医学图像分割挑战赛数据集儿科

HC18 — 胎儿头围超声测量基准

1,334 张 2D 超声999 训练 + 335 测试176.8 MB ZIPCC-BY-4.0 开放下载551 名孕妇

1,334 张胎儿头部标准切面 2D 超声，999 训练 + 335 测试

Radboud University Medical Center url: https://hc18.grand-challenge.org/ 61

医学影像MRI医学图像分割图像分类心血管疾病

Cardiac Atlas Project — 心脏统计图谱开源库

MESA 2,450 例 + DETERMINE 450 例DICOMNIfTIVTK 多格式Sunnybrook 子集 CC0 公开域免费申请获取（需签 DDA）5,000+ 例心脏 CMR 检查（MESA 队列基线 CMR 5,098 名参与者）

全球最早的开源心脏 MRI 统计图谱库：5,000+ 例 CMR 检查

Cardiac Atlas Project（奥克兰大学 & UCLA，NHLBI 资助） url: http://www.cardiacatlas.org/ 46

电子健康记录公共卫生与流行病学临床电子病历卫生服务研究真实世界数据

GEMINI — 加拿大最大医院数据共享网络

>200 亿数据点~300 万次住院~40 家医院需 REB 审批获取98-100% 数据准确率~300 万次住院

Unity Health Toronto (St. Michael's Hospital) / University of Toronto 82

医学影像医学问答与基准MRI医学图像分割挑战赛数据集脑肿瘤

BraTS — 脑肿瘤分割挑战赛

约 4,500+ 病例约 200 GB 大小4 模态 MRI80+ 机构4,500+

MICCAI BraTS 组织委员会 / CBICA (宾夕法尼亚大学) 187

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