即取即用的 AI-Ready 医疗数据集库

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医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

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图像分类目标检测语义分割

共 343 个数据集

医学影像医学问答与基准CT医学图像分割挑战赛数据集肿瘤学

全球最大中国人群前瞻队列 · 51.2 万参与者 · 随访近 20 年

牛津大学人口健康系 & 北京大学公共卫生学院 & 中国医学科学院 url: https://www.ckbiobank.org/ 148

医学影像生理信号手术视频内窥镜影像步态与运动肿瘤学

SARAS-ESAD — 内窥镜术者动作检测

53,370 帧手术视频帧46,325 个动作实例21 个动作类别约 13 GB JPG+TXTCC BY-NC-SA 免费下载4 台真实 RARP 手术（前列腺癌患者，获录制与分发同意）

4 台真实 RARP 手术 53,370 帧内窥镜动作检测标注

SARAS 项目（牛津布鲁克斯大学视觉人工智能实验室等） url: https://saras-esad.grand-challenge.org 50

电子健康记录神经科学脑影像队列研究阿尔茨海默病

ADNI — 阿尔茨海默病纵向多模态队列

2,500+ 参与者20+ 年随访MRI + PET + CSF + 基因免费申请获取2,500+ 名参与者

全球最大AD纵向多模态队列 · 2,500+参与者

Alzheimer''''s Disease Neuroimaging Initiative (ADNI, PI: Michael W. Weiner, M.D.) url: https://adni.loni.usc.edu/ 107

公共卫生与流行病学基因组学与多组学医学影像

UK Biobank — 大规模人群队列

503,317 招募志愿者490,640 人 WGS10 万人影像 10 亿+ 图蛋白代谢组约 30 PB503,317 名去标识英国志愿者（40-69 岁基线招募，含纵向随访与 EHR 链接）

50 万英国人的 30 PB 生命蓝本：全基因组测序 + 十万人影像 + 全程 EHR 链接

https://www.ukbiobank.ac.uk/ 62

药物发现与化学化学信息学虚拟筛选

DrugCentral — 开放药物信息知识库

4,950+ 种药物约 724 个 MoA 靶点142,303 个药品制剂约 1.3 GB Postgres dumpCC BY-SA 4.0 开放非患者队列数据集；4,950+ 种药物活性成分（截至 2023-08）

覆盖 4,950+ 种药物的开放获取药物信息资源，CC BY-SA 4.0 免注册下载

University of New Mexico, Division of Translational Informatics url: https://drugcentral.org/ 101

多模态医疗NLP影像-文本对齐生物医学文献

PMC-OA — 百万级生物医学图文对数据集

1,646,592 图文对1,003,911 子图-子图注对齐对381,096 复合图注级对覆盖约 240 万篇 PMC 论文JSONL + 图像压缩包免费直接下载不适用（文献挖掘图像，非患者队列，未按患者计数）

165 万图文对，文献级生物医学多模态预训练语料，细粒度子图-子图注对齐

上海交通大学 Cooperative Medianet Innovation Center / 上海人工智能实验室（数据托管于 HuggingFace） url: https://huggingface.co/datasets/axiong/pmc_oa 68

医学影像医疗NLP视觉问答

VQA-RAD — 放射学视觉问答基准

315 张放射影像3,515 个问答对11 类问题类型CC0 1.0 开放获取约 40 MB 归档315 例教学病例（每图对应唯一患者）

315 张放射影像与 3,515 个临床医生问答对

U.S. National Library of Medicine（NIH）Lister Hill National Center for Biomedical Communications url: https://osf.io/89kps/ 64

基因组学与多组学单细胞基因组学转录组

HCL — 人类细胞景观单细胞图谱

702,968 个单细胞60 种人体组织102 种细胞簇CC BY 4.0 开放884.2 MB DGE 矩阵58 名人体组织供体（HCA Explorer 口径，覆盖胎儿与成人阶段）

702,968 个单细胞 · 60 种人体组织 · Microwell-seq 构建的中文人群细胞图谱

浙江大学医学院干细胞与再生医学中心（郭国骥/韩晓平团队） url: http://bis.zju.edu.cn/HCL/ 64

多模态医学问答与基准医学问答多模态影像影像-文本对齐视觉问答

MedReCo-DB — 大规模对比影像推理数据库

约 69 万张图像7 种影像模态139 个临床实体4 国 8 机构16 万+ 名患者

上海交通大学 & 上海人工智能实验室 https://github.com/time-seed/MedReCo 93

电子健康记录真实世界数据肿瘤学临床电子病历

Flatiron Health — 肿瘤真实世界数据引擎

5M+ 患者记录280+ 诊所与学术机构22 个病种数据集HIPAA 去标识化提案制免费获取（学术）关系表加数据字典500 万+ 名癌症患者（去标识化，美国为主）

5M+ 患者 EHR 深度整理的美国肿瘤真实世界数据网络

Flatiron Health（罗氏集团独立成员） url: https://www.flatiron.com 99

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