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数据标签

医学影像 AI-Ready 数据集

电子病历与文本数据集

病灶分割与标注数据集

共 350 个数据集

BedsideBench — 500 例床旁临床问答评测基准
医学问答与基准医学问答评测基准医疗NLP药物安全电子健康记录

BedsideBench — 500 例床旁临床问答评测基准

人工标注文本数据合成数据0 名真实患者(案例为合成或去标识化构造,不含 PHI);共 500 例合成临床情境,公开 250 例

Doximity 出品的 10 面板×50 例临床问答基准:8 面板用签名加权 points rubric、2 面板用严重度加权 F1 管理计划评分;公开 250 例 + 私有 250 例,CC BY-NC-SA 4.0,附完整 judge 协议与 runner

BrainWeb — MRI 仿真脑数据库与真值金标准
医学影像MRI脑影像医学图像分割神经科学评测基准

BrainWeb — MRI 仿真脑数据库与真值金标准

合成数据影像数据人工标注正常脑解剖模体 1 套(旧版,10 类标签)+ 20 个正常脑模体(2006 扩展,12 类标签)+ MS 病变模体 3 套(moderate 进预计算库;mild/severe 仅定制模拟)

McGill McConnell 脑影像中心用数字脑模体按 Bloch 方程第一性原理生成的 MRI 仿真数据库——提供模糊隶属度与离散标签双轨真值,3 模态×5 层厚×6 噪声×3 INU 预计算网格,20 个正常脑模体扩展

MedTrinity-25M — 2500 万级多粒度标注医学多模态数据集
多模态医学影像医学图像分割图像分类医疗NLP

MedTrinity-25M — 2500 万级多粒度标注医学多模态数据集

原始数据文本标注自动生成标注2500 万幅图像(25M 全量 / 18M accessible / 75K demo 三档),覆盖 10 种模态与 65 种以上疾病;患者级数量未披露

UCSC-VLAA 与华中科技大学等联合构建的超大规模医学多模态图像-感兴趣区-描述三元组数据集:2500 万幅图、10 种模态、65 种疾病,自动流水线产出病灶级多粒度文本标注,无需人工配对报告,支撑 ICLR 2025 论文与 LLaVA-Tri 基础模型

IUGC 2024 产时超声挑战赛数据集 — 标准平面分类·胎头耻骨联合分割·AoP/HSD 自动测量的 MICCAI 2024 产时超声视频挑战赛数据集
医学影像图像分类医学图像分割挑战赛数据集评测基准

IUGC 2024 产时超声挑战赛数据集 — 标准平面分类·胎头耻骨联合分割·AoP/HSD 自动测量的 MICCAI 2024 产时超声视频挑战赛数据集

人工标注影像数据原始数据训练 456 个视频(288 全标准平面 + 168 全非标准平面);帧级:标准平面 24,434 帧(含 2,906 帧分割标注)+ 非标准平面 31,450 帧;患者总数未公开

MICCAI 2024 产时超声 Grand Challenge:三所中国大学医院 456 个训练视频(288 标准平面 + 168 非标准平面)、24,434 个标准平面帧与 31,450 个非标准平面帧,三位超声医师标注 2,906 帧胎头/耻骨联合分割,级联完成标准平面分类、双结构分割与进展角/头耻距自动测量

TCMBank — 全球最大免费中医药关系型数据库
药物发现与化学化学信息学药物-靶点相互作用虚拟筛选分子对接知识图谱

TCMBank — 全球最大免费中医药关系型数据库

知识库关系数据原始数据不适用(非患者级数据集:9191 草药 / 61965 成分 / 15179 靶标 / 32529 疾病)

9191 种草药、61965 种成分、15179 个靶标与 32529 种疾病构成六对异质关系网络——中山大学陈语谦团队以 IDIM 智能文献识别+两次人工验证持续更新,并提供 mol2 三维结构支撑虚拟筛选与集成学习药物重定位

KPIs 2024 — MICCAI 2024 肾小球分割挑战赛
医学影像病理图像医学图像分割目标检测挑战赛数据集评测基准

KPIs 2024 — MICCAI 2024 肾小球分割挑战赛

人工标注影像数据原始数据啮齿动物(小鼠)4 模型组:Normal / 5,6Nx / DN / NEP25;45–60+ 张 WSI(患者/个体级数量未披露)

MICCAI 2024 首个肾脏病理功能单元分割挑战赛——逾 10,000 个肾小球标注、60+ 张 PAS 染色全切片、10,428 个 2048×2048 patch,以 DSC 与 F1 双指标在四种 CKD 啮齿模型上建立肾小球分割基准

C. elegans Connectome — 秀丽隐杆线虫发育期全脑连接组
神经科学脑影像脑机接口评测基准

C. elegans Connectome — 秀丽隐杆线虫发育期全脑连接组

影像数据原始数据人工标注8 只同源(isogenic)C. elegans 个体;物种常量 302 个神经元(雌雄同体)

8 只同源线虫跨出生后发育阶段的串行切片电子显微镜全脑连接组重建——302 个神经元、化学突触与电连接逐个体推导,首次揭示「连接身份稳定、连接强度动态」的脑成熟原理,数据以 CC-BY-4.0 托管于 Zenodo/BossDB 并配 NemaNode 在线浏览

H01 — 人颞叶皮层 1 mm³ 突触级电镜重建
神经科学脑影像医学图像分割图像分类癫痫

H01 — 人颞叶皮层 1 mm³ 突触级电镜重建

影像数据原始数据人工标注1 例(1 位 45 岁女性药物难治性颞叶癫痫患者手术切除的旁路颞叶皮层,1 mm³)

人颞叶皮层 1 立方毫米体积的连续切片电子显微镜重建——约 1.4 PB、约 5.7 万细胞、1.5-1.83 亿突触、104 个手工校对神经元,Harvard Lichtman 实验室 + Google Research 联合发布,Science 2024,CC BY 4.0 完全开放

Cell Tracking Challenge — 细胞分割与追踪十余年客观基准
医学影像挑战赛数据集评测基准医学图像分割目标检测时序数据

Cell Tracking Challenge — 细胞分割与追踪十余年客观基准

影像数据原始数据人工标注20 个数据集(2D+t 10 个 + 3D+t 10 个);CTB/CSB 各含 13 个评测数据集;多物种(人/小鼠/大鼠/线虫/果蝇/拟谷盗)

细胞时序显微视频分割/关联/追踪的客观基准——马萨里克大学 CBIA 主办,自 2012 年运行逾十年,三大基准 CTB/CSB/CLB 覆盖 20 个真实与合成 2D/3D 数据集,月度评估,Nature Methods 三次系统分析

MICrONS — 小鼠视皮层立方毫米功能-结构联合连接组图谱
神经科学脑影像多模态单细胞基因组学评测基准

MICrONS — 小鼠视皮层立方毫米功能-结构联合连接组图谱

原始数据影像数据人工标注1 只 P87 小鼠(单被试,非人群队列);体积内约 200,000 细胞、约 120,000 神经元、约 75,000 有功能记录的神经元

IARPA MICrONS 项目以双光子钙成像与串行切片电镜在同一只 P87 小鼠 1.4×0.87×0.84 mm 视皮层体积上联合采集功能与结构数据,重建约 20 万细胞、约 12 万神经元与 5.23 亿突触,成为首个跨多脑区的哺乳动物皮层功能连接组开放资源

Neurofeedback Skull-stripped — 脑部 MRI 颅骨剥离金标准库
神经科学脑影像MRI医学图像分割评测基准

Neurofeedback Skull-stripped — 脑部 MRI 颅骨剥离金标准库

影像数据人工标注原始数据125 例受试者(77 女 + 48 男,21–45 岁,均值 31、标准差 6.6);其中 66 例有 ≥1 项当前或既往精神科诊断(SCID/DSM-IV);每例含 T1w 原图 + 脑图 + 脑

NKI Enhanced Rockland Sample 神经反馈子研究 125 例 T1 加权 MRI 的手工校正颅骨剥离库——BEaST 自动初剥 + Freeview 逐例手修(85 例编辑)的迭代 bootstrap 工艺,无条件开放、无需数据使用协议,为脑提取算法提供金标准训练/测试数据

Siena Scalp EEG Database — 14 例癫痫患者头皮脑电 47 次发作长程参考集
生理信号脑电信号神经科学癫痫

Siena Scalp EEG Database — 14 例癫痫患者头皮脑电 47 次发作长程参考集

原始数据时序数据人工标注14 例癫痫患者(9 男 / 5 女,PhysioNet 摘要口径;subject_info.csv 逐行实为 8 男 / 6 女)

锡耶纳大学神经内科与神经生理学科 14 例癫痫患者视频-EEG,512 Hz、国际 10-20 导联、47 次发作 / 约 128 小时,CC BY 4.0 于 PhysioNet 公开;源自托斯卡纳 PANACEE 非侵入式发作预测项目,是成人头皮脑电发作检测与预测的经典长程数据锚点

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