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医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

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图像分类目标检测语义分割

共 350 个数据集

医学影像CT医学图像分割图像分类心血管疾病儿科

ImageCHD — 首个先心病三维CT分类数据集·110例心脏CT与7类亚结构分割

影像数据人工标注原始数据110 例 3D CT（患者年龄 1 个月-40 岁，绝大多数 1 个月-2 岁）

ImageCHD：首个面向先天性心脏病分类的公开三维 CT 影像数据集——110 例心脏 CT、7 类心脏亚结构分割标签、16 类 CHD 诊断标签，MICCAI 2020 会议论文发布，Kaggle 公开可下载（8.94 GB）

Siemens Biograph 64 扫描仪采集的 110 例先天性心脏病（CHD）心脏三维 CT 图像（512×512×(129-357)，典型体素 0.25×0.25×0.5mm³）+ 7 类心脏亚结构分割标签（LV=1/RV=2/LA=3/RA=4/Myo=5/AO=6/PA=7）+ 16 类 CHD 诊断分类标签 33

医学影像医学图像分割挑战赛数据集评测基准脑影像

MITOEM

人工标注影像数据原始数据2 个 volume（MitoEM-H 成人脑皮层 + MitoEM-R 成年大鼠脑皮层；供体级数量与人口学信息未在一级来源披露）；测试半卷 GT 私有

ISBI 2021 大规模三维线粒体实例分割挑战赛数据集：人+大鼠皮层 EM 两卷各 1,000×4,096×4,096 体素（8×8×30 nm）、约 4 万实例真值、AP-75→accuracy 双轨评测、IIPPR 夺冠、挑战至今开放提交

两卷连续切片电子显微镜（EM）三维图像栈：每卷 1,000×4,096×4,096 voxels、8×8×30 nm（物理 32.8×32.8×30 µm），人/大鼠脑皮层各一；线粒体实例真值：每卷前 500 slices（train 400 + val 100），v1 H 24.5K/R 14.4K、v2 H 19K/R 10.8K 实例，实例≥2,000 voxels；后 500 slices 私有测试 27

医学影像内窥镜影像图像分类评测基准肿瘤学

MIQR-CC ERCP 精选图像数据集 — 内镜逆行胰胆管造影荧光图像的 5 类临床所见分类库

人工标注影像数据原始数据1,602 例患者

1,602 例患者、19,018 张原始 ERCP 荧光透视帧、5,519 张专家标注图像，2 名消化内科医师独立标注并由 20 年经验高年资医师裁定终审；5 类临床所见（胆道结石/胆漏/良性狭窄/恶性狭窄/正常），双机型（Ziehm Vision RFD 3D + Philips PCR Eleva）单中心连续收案，70-15-15 按检查分层划分防泄漏，附 EfficientNet/DenseNet/ResNet/MobileNet/DeiT 五基线评测

葡萄牙 ULSAM 消化内镜中心单中心连续收案的 ERCP 荧光透视原始图像（Ziehm Vision RFD 3D 与 Philips PCR Eleva 双 C 臂机型），去标识化 + PNG 转码 + 预处理流水线产出，专家图像级 5 类标注子集 39

医学影像MRI医学图像分割挑战赛数据集心血管疾病评测基准

LAScarQS 2022 — 左心房与瘢痕定量分割挑战赛

影像数据专家标注原始数据194 例 3D LGE MRI（官网一口径；文献另有 200/200+ 口径）；训练集 LA 130 例 / scar 60 例（二手来源划分）

MICCAI 2022 首届左心房 LA 与左心房瘢痕联合分割挑战赛——194 例多中心多厂商 LGE MRI（Utah/BIDMC/KCL 三家），两项赛道（LA+scar 联合分割、多中心 LA 分割），scar 中位仅 3.18 cm³ 构成极端类别不平衡，官方已停更并演化为 CARE-Left Atrium

三家中心多厂商 3D LGE MRI：University of Utah（Siemens 1.5T/3T，0.625×0.625×2.5 mm）、Beth Israel Deaconess Medical Center（Philips Achieva 1.5T，1.4×1.4×1.4 mm）、King's College London（Philips Achieva 1.5T，1.3×1.3×4.0 mm）；含 LA 血池与瘢痕金标准掩码（NIfTI） 42

医学影像MRI医学图像分割挑战赛数据集心血管疾病

LVQuan 2018

人工标注影像数据原始数据cine-MRI 序列175 例受试者（训练 145 + 测试 30），每例 20 帧，共 3,500 帧心中部短轴 cine-MRI

MICCAI 2018 STACOM 首个左心室全量化挑战——Cardiac-DIG 175 例 cine-MRI、逐帧心肌掩码与 12 项量化指标（2 面积 + 3 径线 + 6 壁厚 + 1 时相），12 队基准，直接回归与分割等价结论的官方出处

Cardiac-DIG：加拿大安大略省伦敦市三所医院（隶属 London Healthcare Center 与 St. Joseph's HealthCare）心中部短轴 cine-MRI，统一预处理为 80×80 ROI，逐帧心肌掩码 + 12 项量化指标全心动周期标注 39

医学影像乳腺影像病理图像多模态肿瘤学乳腺癌

Cancer Moonshot Biobank — Invasive Breast Carcinoma Cancer Collection — 美国 NCI 癌症登月生物样本库乳腺癌多模态影像集合

影像数据原始数据多模态101 受试（集合级去重；放射 50 受试 + 病理 99 受试，含跨分区重叠）

NCI Cancer Moonshot Biobank 浸润性乳腺癌队列的放射影像+组织病理整片图像集合——托管 TCIA，Version 6 共 101 受试、203.94GB，放射 50 受试/139,173 图（MR/CT/MG/US/PT）与病理 99 受试/136 切片，公开部分 CC BY 4.0，DICOM 内嵌入组天数可对齐临床事件

NCI Cancer Moonshot Biobank 浸润性乳腺癌队列采集的放射影像（MR/CT/MG/US/PT DICOM）与组织病理整片图像（SVS）+ 病理元数据（JSON）；关联基因组/临床数据托管于 dbGaP(phs002192) 与 Clinical Commons(NCT04314401) 34

医学影像MRI医学图像分割脑影像挑战赛数据集

AIMS-TBI — T1w MRI 中重度颅脑创伤病灶分割挑战赛

人工标注影像数据原始数据1,100 例 T1w MRI（12 站点汇集）；764 例手动病灶分割（训练 388 + 验证 101 + 测试 275）；受试者年龄 5-85 岁

MICCAI 2024 挑战赛数据集：ENIGMA 脑损伤工作组 12 站点汇集 1,100 例中重度 TBI 的 T1w MRI，764 例经 12 人标注团队手动 3D 病灶分割，388/101/275 三分发放，Dice/体积差/病灶计数差/病灶级 F1 四指标累计排名，最佳平均 Dice 0.61，数据经 grand-challenge 平台注册制发放

ENIGMA 联盟 TBI 工作组 12 个站点汇集的中重度颅脑创伤 T1w MRI（联盟两子组近 1,300 例池 → 实际汇集 1,100 例）+ 12 人标注团队手动 3D 病灶掩码（764 例，病灶涵盖挫伤/出血/血肿/脑软化/胶质增生/白质病变/手术引流道七类结构性损伤，二值掩码不分型） 39

医学影像医学图像分割图像分类心血管疾病评测基准

HMC-QU — 心尖四腔超声心动图心肌梗死检测与左心室壁分割数据集（162 例）

影像数据原始数据人工标注162 例唯一患者（93 例 MI + 69 例非 MI）；322 段超声心动图视频（A4C 162 + A2C 160）

全球首个公开面向左心室壁心肌梗死检测的 2D 超声心动图基准：卡塔尔 Hamad Medical Corporation × 卡塔尔大学 × 坦佩雷大学共建，322 段心尖四腔（A4C）与二腔（A2C）视频覆盖 162 例患者（93 例 MI + 69 例非 MI），含 109 例逐帧左心室壁分割掩码，25 fps，CC BY-NC-SA 3.0 IGO

卡塔尔 Hamad Medical Corporation 心脏医院等机构 2018–2019 年采集的去标识 2D 超声心动图（Philips 与 GE Vivid 设备，25 fps，422×636 – 768×1024 px）+ 心肌节段 MI/non-MI 真值标签 + 109 例 A4C 逐帧左心室壁分割掩码（224×224 px）+ Active Polynomials 特征与数据划分 56

医学影像MRI医学图像分割脑肿瘤儿科挑战赛数据集

BraTS-Pediatric

人工标注影像数据原始数据临床数据患者来源 464 例（2024 论文口径：CBTN 120 + DMG/DIPG Registry 256 + Boston Children's 61 + Yale 27）；挑战赛 metadata

MICCAI BraTS 挑战赛儿科赛道（2023-2025）官方 mpMRI 分割数据集——CBTN+CONNECT+DIPGR 联盟 464 例儿童脑肿瘤四序列 MRI，儿科四区（ET/NET/CC/ED）标注，Synapse/TCIA/NCI CDC 三层异构托管，TCIA 口径 CC BY 4.0

儿童脑肿瘤多参数 MRI 四序列（T1w/T1CE/T2w/T2-FLAIR，1mm³ 各向同性，SRI24 共配准，儿科专用 defacing）+ 儿科四区体素级分割标注 NIfTI（ET/NET/CC/ED）+ 患者级临床 metadata（含 OS/PFS）；Synapse syn53708249/syn64153130 + TCIA BraTS-PED + NCI CCDI 54