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医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

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图像分类目标检测语义分割

共 350 个数据集

医学影像病理图像图像分类评测基准

BBBC051 (Human kidney cortex cells)

人工标注影像数据原始数据三口径并存：BBBC 总表口径 690,000 images（细胞）｜论文口径 ~230,000 cells 完成八类分类｜TissueMNIST 衍生口径 236,386 样本；组织来源为 3 例

Broad Bioimage Benchmark Collection 第 051 号：3 例人体肾皮质组织的 DAPI 单通道共聚焦荧光显微图像（3D 体积 / 2D 投影 / 2D 切片三形态），VTEA 半自动流水线标注 8 类肾皮质细胞类型，NephNet3D 仅凭细胞核 DAPI 特征即达 balanced accuracy 80.26%，衍生 MedMNIST 轻量基准 TissueMNIST

Broad Bioimage Benchmark Collection 官方直链 Images.zip（2.9 GB，data.broadinstitute.org/bbbc/BBBC051/）+ groundtruthlabels.txt；人肾皮质 DAPI 单通道共聚焦 z-stack（3 例 deceased donor nephrectomy 标本、50 μm 切片）+ VTEA 半自动流水线八类细胞标注 78

多模态手术视频生理信号队列研究评测基准

VISEM — 人类精子显微视频多模态数据集（85 人/研究用途）

视频数据生理信号原始数据85 名男性（≥18 岁；每人收录 1 段显微视频）；部分受试者录制两段但因样本漂移仅保留一段

挪威 SimulaMet 与 OsloMet 发布的 85 名男性精子显微视频 + 精液分析 + 脂肪酸 + 性激素 + 人口学五模态开放数据集，人类生殖领域首个开放多模态数据集，MediaEval 2019 Medico 任务官方基准，35.2 GB 直链下载、CC BY-NC 4.0（仅限研究与教育用途）

85 段精子显微 AVI 视频（640×480@50fps，400× 放大，Olympus CX31，2-7 分钟/段，>35 GB）+ 6 个 CSV（精液分析/精子脂肪酸/血清磷脂脂肪酸/性激素/人口学/视频映射）+ 描述文件；Zenodo visem-dataset.zip 35.2 GB（md5 c4ab1788457fa3395d94bb643559f6c5） 41

医学影像CT肿瘤学结直肠癌图像分类

CT COLONOGRAPHY (ACRIN 6664) — 美国 ACRIN 6664 国家 CT 结肠成像试验 825 例筛查人群无创结直肠肿瘤检出影像与息肉定位金标准数据集

原始数据影像数据临床随访人工采集825 例收录 TCIA（试验口径：15 中心招募 2,600 名 50 岁以上无症状受试者 → 2,531 名（97%）完整数据；TCIA 收录的是可用 CTC 影像子集 825 例；V2 临床人口

ACRIN 6664 国家 CT 结肠成像试验（NCT00084929）的 TCIA 影像遗产：825 例受试者俯卧+仰卧双体位 CT 结肠成像 DICOM（941,771 图 / 496.67 GB）+ 大肠息肉逐例描述表 + 752 例人口学临床表；主论文 Johnson 等 NEJM 2008 奠定 CT 结肠成像作为结直肠癌无创筛查工具的临床地位

ACRIN 6664 国家 CT 结肠成像试验影像 DICOM（CT 模态，836 studies / 3,451 series / 941,771 images / 496.67 GB，俯卧+仰卧双体位、≥16 排多排探测器、标准肠道准备+粪便液体标记+CO2 充气）+ 大肠息肉逐例描述表（结肠分段定位+尺寸+组织学类型）+ 752 例人口学/随访/治疗/家族史临床表 + 人类可读与机器可读数据字典 35

医学影像CT医学图像分割影像-文本对齐评测基准肺癌

ReXGroundingCT

人工标注影像数据原始数据3,142 个非对比胸部 CT volumes（unique 患者数未披露；平均年龄 42.08±14.52 岁，男 55.9%/女 44.1%）

首个手工标注的「自由文本发现→3D 体素分割」胸部 CT 数据集——3,142 例非对比 CT、8,028 个发现、16,301 个分割实体、12 类 61 子类本体，GPT 管线加放射科医师质控，现役模型近零分、SAT 微调 Dice 仅 0.209，CC BY-NC-SA 4.0 gated 发布

CT-RATE 非对比胸部 CT volumes（3,142 例，土耳其医院 2016-2022 采集）+ GPT-4 标准化英文报告 + 3D 像素级分割掩码（NIfTI）+ 12 类 61 子类本体 finding 分类 + anatomical CoT 解剖思维链（GPT-4o 生成） 53

医学影像图像分类挑战赛数据集

ACOUSLIC-AI

人工标注影像数据原始数据600 例 cine loop（训练 300 + 验证 10 + 测试 290）；每例约 840 帧（官网口径）

MICCAI 2024 附属挑战赛与配套公开数据集：塞拉利昂 3 卫生单元新手盲扫 cine 300 例公开训练集（每例 840 帧、744×562、0.28 mm/px），16 队参赛 6 进决赛，Top-3 算法开源，首个低收入国家盲扫胎儿超声公开数据集

塞拉利昂 3 个公共卫生单元（PHU，训练集）+ 坦桑尼亚 2 个 PHU 与一家欧洲医院（验证/测试集）的新手操作者盲扫 cine 胎儿腹部超声；MicrUs Pro-C60S（Telemed）低成本设备；744×562 px、0.28 mm/px；逐帧标准平面标签 + 标准帧腹围椭圆标注（经验丰富阅片者） 49

医学影像MRI医学图像分割挑战赛数据集脑肿瘤肿瘤学

BraTS-MEN — BraTS 脑膜瘤赛道双数据集：2023 术前四序列分割 1424 例 + 2024/2025 放疗规划 T1c 靶区 750 例

人工标注影像数据原始数据BraTS-MEN 2023：1,424 例（训练 1,000／验证 141／测试 283）；BraTS-MEN-RT 2024：750 例（训练 500／验证 70／测试 180）；两实体公开可得合

BraTS 挑战赛脑膜瘤支线数据集家族：2023 届 BraTS-MEN 六中心 1424 例术前四序列 mpMRI 三亚区专家标注分割集 + 2024 届 BraTS-MEN-RT 750 例放疗规划单序列 T1c 靶区集，Synapse 注册获取

BraTS Pre-operative Meningioma Dataset（Duke／Thomas Jefferson／UCSF／Yale／UPenn／Missouri 六中心术前四序列 mpMRI + ET/NET/SNFH 三亚区掩码，FeTS 工具链预处理至 SRI24 空间 1mm³）+ BraTS-MEN-RT Dataset（放疗规划 3D T1c 原生分辨率 + 单 target volume 标签 + 临床元数据表，dcmrtstruct2nii 转换 + AFNI defacing） 84

生理信号神经科学心血管疾病糖尿病视网膜病变多模态

Cerebral Vasoregulation in Diabetes — 糖尿病患者的脑血管调节研究数据

生理信号时序数据队列研究86 人（37 例糖尿病 + 49 例健康对照，年龄 55–75 岁）

BIDMC 老年晕厥与跌倒实验室 86 例（37 型糖尿病 + 49 对照，55–75 岁）多模态脑血管自动调节测量：经颅多普勒 MCA/BRA、呼气末 CO₂ 反应、Valsalva、头高位倾斜与坐立测试，PhysioNet v1.0.0 公开（DOI 10.13026/m40k-4758）

BIDMC 老年晕厥与跌倒实验室多模态测量：经颅多普勒（MCA/BRA 血流速度）+ 呼气末 CO₂/O₂/呼吸 + 连续心电血压（Portapress）+ 3T MRI（T1/T2/MRA）+ 平衡步态 + Pedar 足底压力；任务含低碳酸/高碳酸反应、Valsalva、头高位倾斜（day1/day2）、坐立测试 34

医学影像MRI医学图像分割脑肿瘤肿瘤学

BraTS-Africa

人工标注影像数据原始数据146 例患者（95 例弥漫性胶质瘤 + 51 例其他脑肿瘤）；挑战赛口径 2023 年 95 例 / 2024 年 115 例

撒哈拉以南非洲成人胶质瘤 mpMRI 分割数据集：146 例尼日利亚 1.5T 影像（95 例弥漫性胶质瘤+51 例其他脑肿瘤），MICCAI-CAMERA-Lacuna Fund 挑战赛 2023-2024 两届基准，专家三阶段标注，TCIA CC BY 4.0 公开——为 LMIC 资源受限场景补上全球脑瘤 AI 地图中最空缺的一块

尼日利亚多家诊断中心（TCIA 口径 6 家/NOAJ 论文口径 7 家）临床常规采集的回顾性术前脑 1.5T mpMRI（T1/T1-CE/T2/T2-FLAIR，2010-01~2022-12），经 AfNiA 汇总，按 BraTS 协议预处理（SRI24 配准、1mm³ 重采样、N4 校正、颅骨剥离）并三阶段专家标注 ET/NETC/SNFH 三肿瘤子区域 47

医学影像MRI脑影像挑战赛数据集评测基准

MRIxFields2026 — 跨磁场强度脑 MRI 协调与翻译挑战赛

影像数据原始数据配对数据回顾性非配对约 1056 例（ID 0001–1056 按场强分块）+ 前瞻配对 40 位流动志愿者；图像级展开口径见正文 §4 双口径存照

MICCAI 2026 卫星挑战赛：0.1T–7T 五档磁场强度、T1W/T2W/T2FLAIR 三模态、前瞻配对与回顾非配对混合脑 MRI，三任务评测 nRMSE/SSIM/LPIPS/Dice-14核团/体积一致性，Synapse 门控获取、代码与基线权重 MIT 全开

多中心 0.1T/1.5T/3T/5T/7T 脑 MRI（Siemens Healthineers、United Imaging Healthcare 联影、Point Imaging 设备），T1W/T2W/T2FLAIR，NIfTI 364×436×364 @0.5mm MNI float32；前瞻 travelling volunteers 配对 + 回顾非配对 60

医学影像MRI医学图像分割挑战赛数据集心血管疾病

M&Ms-2 多疾病多视图多中心右心室分割挑战数据集

人工标注影像数据原始数据360 例 cine CMR 研究（75 健康 + 7 组病理共 285 例；患者级去重数未披露）；训练 160 / 验证 40 / 测试 160

STACOM 2021 官方挑战数据集：360 例 cine CMR、3 家巴塞罗那医院、9 台扫描仪、8 组病理，短轴+长轴 4CH 双视图，DRV/TRI 未见病理测泛化，15 队参赛 nnU-Net 最优，DSC 较 M&Ms-1 提升 0.042

3 家西班牙巴塞罗那医院（Vall d'Hebron、Clínica Sagrada Familia、Dexeus）回顾性 cine CMR（短轴 SA + 长轴 4CH 双视图，ED/ES 两时相）+ LV/RV/MYO 三结构 NIfTI 标注（来源中心专家标注、另 2 人复核、cvi42 软件链）；挑战评估仅针对 RV 56

医学影像医学图像分割图像分类挑战赛数据集脑影像阿尔茨海默病

SELMA3D

影像数据人工标注原始数据58 幅 3D 图像（2025 训练集：Task 1 离散结构 30 幅 + Task 2 连续结构 >25 幅）；2024 首届对照 35 幅 + 315 个标注 patch；小鼠 cleared

SELMA3D 2025：MICCAI 2025 卫星挑战赛——58 幅小鼠组织透明化光片显微 3D 图像（单幅最大 10000³ 体素）的自监督/半监督分割，两赛道分治离散与连续生物结构，设计文档 CC-BY-4.0，图像三层托管（Zenodo/EBI BioStudies/Grand Challenge 注册制）

小鼠组织透明化 + 特异性染色 + 光片显微镜三维成像（16-bit TIFF 体数据，单幅最大 10000³ voxels；2024 patch 为 NIfTI LPS+）；托管三层异构：Zenodo 设计文档 cc-by-4.0 / EBI BioStudies S-BIAD1196 + S-BIAD1197（2024 图像）/ Grand Challenge 注册制下载（2025 图像） 33

医学影像MRI骨骼肌肉影像多模态挑战赛数据集影像-文本对齐

RSNA Knee Abnormality Detection — 膝关节 MRI 十二类异常多模态检测挑战赛

影像数据临床文本公开基准4,407 例训练研究（train.csv；官网口径 >5,000 knee MRI exams，含测试/隐藏集）；约 1,300 例测试研究；24,371 条训练 series

RSNA 2026 首次把原始放射报告文本与膝关节 MRI 影像配对参赛，4,407 例训练研究覆盖五大洲 19 站、约 12 种语言的十二类韧带/半月板/软骨/骨性病变多标签 AUC 竞赛，并首创效率赛道与 $77,000 奖金池

Kaggle 竞赛 rsna-knee-abnormality-detection：DICOM 膝关节 MRI series（每例多序列，去标识至 86 个白名单元数据标签）+ train.csv（StudyInstanceUID/Report 与 12 个二值标签）+ train_series.csv（Fluid_Sensitive/Fat_Suppression/Anatomical_Plane）+ 多语言原始放射报告文本 85

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