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医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

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图像分类目标检测语义分割

共 167 个数据集

分子对接基准虚拟筛选计算药物发现打分函数评估

DUD-E — 分子对接诱饵基准 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

102 个蛋白靶标22,886 个活性配体（ChEMBL）约 110 万性质匹配诱饵（ZINC1:50）SMILESmol2SDF 三格式 + receptor.pdb不适用（纯小分子-靶标计算基准，无人类受试者数据）

102 靶标 · 22,886 活性物 · 约 110 万性质匹配诱饵的虚拟筛选基准

UCSF Irwin & Shoichet 实验室（加州大学旧金山分校药化系） url: http://dude.docking.org/ 9

心电信号心律失常PhysioNet公开基准时序数据

Chapman-Shaoxing — 12 导联心律失常 ECG AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

约 2.8 GB（figshare 六文件扩展版 5.1 GB）10,646 例 12 导联 ECG（扩展版 45,152 例）500 Hz × 10 秒 × 12 导联10,646 名患者（扩展版 45,152 名）

10,646 例 12 导联静息 ECG 的心律失常分类公开基准

Chapman University & Shaoxing People's Hospital（PhysioNet 托管） url: https://physionet.org/content/ecg-arrhythmia/1.0.0/ 6

医学影像内镜图像息肉分割公开基准计算机视觉

CVC-ColonDB — 结肠镜息肉分割经典基准 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

380 帧结肠镜图像15 段检查序列574×500 像素像素级二值息肉 mask原始版含 1,706 个文件（4 组）研究用途免费获取15 例结肠镜检查（各文献记载 13–15 例不一）

380 帧专家标注结肠镜息肉分割图像，源自 15 段检查序列的单中心经典基准

Computer Vision Center, Universitat Autònoma de Barcelona（CVC-UAB） url: http://mv.cvc.uab.es/projects/colon-qa/cvc-colondb 8

皮肤影像3D 全身摄影癌症筛查类别不平衡

SLICE-3D — ISIC 2024 3D 全身照相皮损数据集 | 千方病案医数集

401,059 张皮损裁剪图1,042 名患者恶性率仅 0.1%约 1.2GB 图像CC-BY-NCCC-BY 双许可Kaggle 8 万美元竞赛1,042 名患者 · 40.1 万张皮损图

全球最大 3D-TBP 皮肤癌筛查数据集 · 40.1 万皮损裁剪 · 约 1:1,000 极端不平衡

国际皮肤影像协作组（ISIC）& 纪念斯隆凯特琳癌症中心（MSK） url: https://challenge2024.isic-archive.com/ 7

病理全切片乳腺癌肿瘤学图像分类

BRACS — 乳腺癌亚型全切片数据集 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

约 1.1TB WSI52GB ROI547 张全切片4,539 个 ROI7 类亚型病理学家共识标注CC BY-NC 4.0注册后免费获取189 名患者

乳腺 H&E 七亚型双层级标注 · 547 WSI / 4,539 ROI

ICAR-CNR & IRCCS Fondazione Pascale & IBM Research-Zurich url: https://www.bracs.icar.cnr.it/ 10

放射影像目标检测胸部X光边界框标注

ChestX-Det10 — 胸部X光异常检测数据集 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

3,543 张胸片8,339 个标注框10 类胸部异常3 名认证放射科医生标注图像 CC0 公有领域官方 traintest 划分3,543 张影像

ChestX-ray14 首个实例级框标注子集 · 3,543 张 · 10 类异常

Deepwise AI Lab（深睿医疗）｜图像来源：NIH Clinical Center url: https://github.com/Deepwise-AILab/ChestX-Det10-Dataset 9

内窥镜影像语义分割经典基准消化道

CVC-ClinicDB — 结肠镜息肉分割基准数据集 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

612 帧专家标注掩膜31 序列23 患者约 50MB 大小免费下载（非商业）MICCAI 2015 官方训练集23 名患者 · 612 帧

息肉分割领域被引最多的公开基准 · 612 帧专家标注 · 引用 2,400+

巴塞罗那自治大学计算机视觉中心（CVC）& Hospital Clínic de Barcelona url: https://polyp.grand-challenge.org/CVCClinicDB 15

皮肤科影像临床照片图像分类小样本基准

MED-NODE — 临床皮肤照片黑色素瘤数据集 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

约 24.7MB zip170 张图像70 黑色素瘤 + 100 痣非皮肤镜临床照片免费下载引用论文即可使用170 张图像

最常用的非皮肤镜临床照片基准 · 170 张图像 · 真实世界评估场景

格罗宁根大学 & 格罗宁根大学医学中心（UMCG）皮肤科 url: https://www.cs.rug.nl/~imaging/databases/melanoma_naevi 10

医疗NLP多模态基准医学影像基因组

MultiMedBench — 谷歌医学多任务多模态基准 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

14 项任务12 个数据集超 100 万样本7 种数据模态许可证混合（部分需 CITI 认证）无统一打包下载Google Research 发布超 100 万样本（12 个去标识化数据集）

Med-PaLM M 配套评测基准 · 14 任务 12 数据集 7 模态 · 超 100 万样本

Google Research & Google DeepMind url: https://research.google/pubs/towards-generalist-biomedical-ai/ 13

肿瘤学病理组织图像分类

BreakHis — 乳腺癌组织病理图像数据库 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

7,909 张 H&E 显微图像82 名患者40×-400× 四倍率约 4 GB PNG免费非商业使用82 名患者

乳腺癌病理图像分类的事实基准 · 7,909 张图像 · 82 名患者

巴西巴拉那联邦大学（UFPR）VRI 实验室 & P&D Laboratory url: https://web.inf.ufpr.br/vri/databases/breast-cancer-histopathological-database-breakhis/ 9

胸部X光目标检测放射科影像医师精标

VinDr-CXR — 放射科医师精标胸片数据集 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

约 192GB DICOM18,000 张胸片17 名医师标注28 类标签需 CITI 培训1.8 万张影像

训练与测试全医师精标的大规模胸片集 · 1.8 万张 DICOM

VinBigdata（Vingroup）& 河内医科大学医院 & 108 医院 url: https://physionet.org/content/vindr-cxr/1.0.0/ 12

内窥镜影像胶囊内镜目标检测图像分类

Kvasir-Capsule — 最大公开胶囊内镜视频数据集 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

约 89GB（含视频）521MB（仅标注帧）47,238 张标注帧14 类病灶标注含边界框免注册下载CC BY 4.047,238 张标注帧 / 117 段视频

全球最大公开胶囊内镜数据集 · 47,238 标注帧 · 14 类病灶

Simula 都会数字工程研究中心（SimulaMet）& Vestre Viken 医院集团 url: https://datasets.simula.no/kvasir-capsule 6

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