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医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

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图像分类目标检测语义分割

共 167 个数据集

外科手术与内镜器械分割医学影像

Kvasir-Instrument — 内镜手术器械分割数据集 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

590 帧胃肠镜器械图像逐像素掩膜 + 边界框单类 instrument约 170 MB 免注册下载研究教育用途限制非疾病诊断数据非患者级数据（590 帧器械图）

首个胃肠道内镜器械分割基准 · 590 帧专家掩膜 + 边界框 · 引用 170+

SimulaDatasets（SimulaMet） url: https://datasets.simula.no/kvasir-instrument 2

眼科影像图像质量评估糖尿病视网膜病变医学影像挑战赛

DeepDRiD — 眼底图像质量评估与DR分级挑战赛 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

2,000 张常规眼底图 + 256 张超广角500 例 + 128 例患者四维图像质量标注CC-BY-SA 免费获取628 例患者（500 例常规 + 128 例超广角）

ISBI 2020 眼底图像质量评估 + DR 分级双任务挑战数据集（2,000 张常规眼底图 / 500 例）

上海交通大学附属第六人民医院 & 上海交通大学 url: https://github.com/deepdrdoc/DeepDRiD 1

基因组学多组学GWAS队列研究临床表型

dbGaP — 基因型-表型档案数据库 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

约 3,000 项研究约 510 万名受试者VCFCSVSRA 格式受控访问获取约 510 万名研究受试者（累计，截至 2025-12）

约 3,000 项研究、510 万名受试者的受控访问基因组-表型档案

NCBI（NLM/NIH） url: https://dbgap.ncbi.nlm.nih.gov/ 2

肿瘤学病理组织与全切片结直肠癌腺体实例分割公开数据集

CRAG — 结直肠腺癌腺体实例分割基准 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

213 张 H&E 病理图像38 位患者全切片实例级腺体掩码约 2.2 GB PNG免费研究获取（须引用）38 位患者（38 张 WSI 每例 1 张，年龄与性别未公布）

213 张 H&E 病理图像、38 位患者，GlaS 姊妹腺体实例分割基准

University of Warwick TIA Centre（Colorectal Adenocarcinoma Gland Dataset） url: https://warwick.ac.uk/fac/cross_fac/tia/data/mildnet/ 2

二放射科影像与断层扫描胸部 X 光CT 影像COVID-19深度学习

BIMCV-COVID19 — 西班牙开放新冠胸片与 CT 影像库 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

64,089 次影像研究7,918 组 CT21,342 张 CR + 34,829 张 DXDICOMPNGNIfTITSVJSON免费申请获取约 7,944 例患者（COVID+ 4,706 + COVID- 3,238）

64,000+ 影像研究、7,918 组 CT 的开放 COVID-19 胸部影像参考库

Medical Imaging Databank of the Valencian Region (BIMCV), FISABIO-CIPF url: https://bimcv.cipf.es/bimcv-projects/bimcv-covid19/ 3

药物发现化学信息学药物敏感性癌细胞系精准肿瘤学

CTRP v2 癌细胞系药敏数据库 — AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

约 900 细胞系 × 545 化合物AUCEC50 药敏 + 分子特征开放下载 CC BY 4.0txtCSV 多表非患者数据，细胞系药敏数据

约 900 细胞系 × 545 化合物的肿瘤药敏矩阵与分子特征库

Broad Institute, Center for the Science of Therapeutics (CTD²) url: https://portals.broadinstitute.org/ctrp.v2.1/ 4

消化道内镜内窥镜影像医学图像分类AI 辅助诊断

GastroVision — 胃肠道内镜多类影像分类 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

约 1.8GB JPG 图像8,000 张 27 类上下消化道内镜免费开放获取CC BY 4.08,000 张内镜图像（非患者级数据）

8,000 张上下消化道内镜图像 · 27 类 · 多中心开放访问

OSF GastroVision Project url: https://osf.io/84e7f/ 2

糖尿病视网膜病变眼底影像专科影像DR 分级

DDR — 糖尿病视网膜病变分级与分割数据集 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

13,673 张眼底图9,598 名患者757 张病灶精标6 级多专家分级开放直链下载9,598 名患者

中国最大公开眼底 DR 分级+病灶分割数据集 · 1.37 万图 · 9,598 名患者

南开大学智能计算系统研究室（NKiCS）/ OIA 联合机构 url: https://github.com/nkicsl/DDR-dataset 3

医患对话中文NLP儿科医学语言理解

IMCS-21 — 中文医患多轮对话基准 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

4,116 条儿科对话164,731 句10 种儿科疾病5 任务多级标注GitHub 公开测试集走 CBLUE 天池非患者数据，对话语料（4,116 条儿科问诊记录）

4,116 条儿科医患对话 · 5 任务多级标注 · 中文医疗对话理解基准

复旦大学（魏忠钰）等 + GitHub lemuria-wchen/imcs21 url: https://github.com/lemuria-wchen/imcs21 6

神经影像自闭症谱系障碍公共卫生与脑神经静息态 fMRI多中心联盟

ABIDE — 自闭症脑成像多中心联盟开放数据集 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

约 2,226 个影像数据集539+521 名 ASD 受试者rs-fMRI + T1 + 73 字段表型CC BY-NC-SA 开放获取2,156 名独立受试者（官网口径 2,226 个数据集）

17+19 站点 2,226 个 rs-fMRI/T1 自闭症脑影像开放数据

ABIDE Consortium（NYU Langone / Nathan S. Kline Institute / Child Mind Institute） url: http://fcon_1000.projects.nitrc.org/indi/abide/ 2

“放射科影像”“胸部X光”“传染病”“图像分类”“开放基准”

“COVIDx CXR — 全球最大开放新冠胸片基准 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集”

“30,386 张胸片”“16,648+ 名患者”“51+ 国多源聚合”“PNGJPEG 图像”“Kaggle 免费下载”“约 1.7 万名患者（训练 16,648 + 测试 378）”

“30,386 张胸片 / 1.7 万患者 / 51+ 国多源新冠 CXR 开放基准”

“滑铁卢大学 Vision and Image Processing 研究组 / DarwinAI Corp.（加拿大）” url: https://github.com/lindawangg/COVID-Net 3