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医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

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图像分类目标检测语义分割

共 167 个数据集

["医疗 NLP 与多模态""医学影像""视觉问答""知识图谱"]

SLAKE — 中英双语医学 VQA 基准 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

["642 幅放射影像""中英双语 QA（清洗版 5,980 条）""5,232 条知识三元组""约 217 MB JSON图像打包""CC-BY-4.0 免费下载"]不适用（影像级开放数据，未提供独立患者人口学信息）

642 幅放射影像、中英双语问答与 5,232 条知识图谱三元组的医生标注 Med-VQA 基准

name: "香港理工大学（med-vqa.com / HuggingFace BoKelvin/SLAKE）" url: "https://www.med-vqa.com/slake/" 2

基因组学多组学转录调控功能基因组

FANTOM5 — 哺乳动物转录调控元件图谱 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

2,832 个 CAGE 样本201,802 个人类 CAGE 峰65,423 个增强子CC BY 4.0 开放获取核心表达表 4.1 GB2,832 个样本（1,816 人 + 1,016 小鼠，phase 1+2）

975 人类样本启动子图谱 + 43,011 增强子，CAGE 单碱基分辨率转录调控参考

FANTOM Consortium / RIKEN Center for Integrative Medical Sciences url: https://fantom.gsc.riken.jp/5/ 2

肿瘤学病理组织与全切片乳腺癌计算病理学细胞核实例分割

NuCLS — 乳腺癌病理核分类数据集 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

222,396 条核标注125 张 TCGA H&E WSI13/7/4 三级核分类CC0 1.0 开放获取官方五折划分125 名患者（每人 1 张 TCGA H&E 全切片）

TCGA 222,396 条核标注 · 三级分类 · CC0 开放

Northwestern University Department of Pathology（NuCLS 研究团队） url: https://sites.google.com/view/nucls/home 2

放射科影像与断层扫描肺癌影像组学生存预测公开数据集

NSCLC-Radiomics — 肺癌影像组学队列 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

422 名患者52,073 张 CT 切片35.78 GB DICOM7 项临床字段CC BY-NC 3.0 开放下载422 名 NSCLC 患者

422 例 NSCLC 患者的 CT 影像组学与生存随访金标准队列

MAASTRO Clinic / The Cancer Imaging Archive (TCIA) url: https://www.cancerimagingarchive.net/collection/nsclc-radiomics/ 2

公共卫生队列研究脑神经儿童青少年精神健康神经影像

HBN — 儿童青少年脑与精神健康跨诊断队列 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

约 4,867 名受试者多模态 MRIEEG表型BIDS 格式CC BY-NC-SA 与 CC BY-SA 双许可DUA 申请获取约 4,867 名 5-21 岁受试者（Release 11，数据截至 2022-11）

5-21 岁约 4,867 名受试者的跨诊断儿童脑与精神健康开放生物样本库

Child Mind Institute（美国儿童心理研究所） url: https://fcon_1000.projects.nitrc.org/indi/cmi_healthy_brain_network/ 3

外科手术语义分割手术器械识别计算机辅助介入

CaDIS — 白内障手术语义分割基准数据集 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

4,670 帧手术图像36 类像素级标注960×540 RGB 图像3,550/534/586 官方划分开放获取50 名白内障手术患者（母数据集 CATARACTS，2015 年）

4,670 帧像素级标注白内障显微手术图像，36 类手术场景分割

Digital Surgery Ltd（现 Medtronic Digital Surgery） url: https://cataracts.grand-challenge.org/CaDIS/ 1

眼科影像医学图像分割血管分割公开基准数据集

DRIVE — 视网膜血管分割金标准 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

40 张 768×584 眼底彩照训练测试各 20 张双标注者像素级血管掩码约 40 MB ZIP注册后免费获取40 张图像（源自 400 名糖尿病受试者筛查人群）

40 张眼底彩照双标注血管分割基准，25 年被引近 4,000 次

Image Sciences Institute, University Medical Center Utrecht url: https://drive.grand-challenge.org/ 3

医疗 NLP 与多模态视觉问答放射影像临床决策支持

VQA-RAD — 放射学视觉问答基准 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

315 张放射影像3,515 个问答对11 类问题类型CC0 1.0 开放获取约 40 MB 归档315 例教学病例（每图对应唯一患者）

315 张放射影像与 3,515 个临床医生问答对

U.S. National Library of Medicine（NIH）Lister Hill National Center for Biomedical Communications url: https://osf.io/89kps/ 4

基因组学表观基因组血液学免疫学

BLUEPRINT — 欧盟血液表观基因组计划 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

约 3,500 个数据集2,558 个实验100+ 种细胞类型BigWigBigBedGTF 格式处理后数据开放下载约 200 名健康献血者队列（另有 AML、CLL、DLBCL 等血液病患者样本）

约 3,500 个造血与免疫细胞表观基因组数据集的欧洲参考图谱

BLUEPRINT Consortium（EU FP7，Radboud University 牵头） url: http://dcc.blueprint-epigenome.eu/ 3

肿瘤学病理组织全切片图像计算病理学核实例分割

Lizard — 49.5 万核实例分割病理数据集 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

495,179 个核实例4,981 个 256×256 patch约 700 MB（CoNIC patch 版）CC BY-NC-SA 4.0 免费下载16 个中心3 个国家不适用（图像区域级数据集，未随数据公开患者级元数据）

49.5 万像素级标注核实例的结肠 H&E 病理分割分类数据集

华威大学 Tissue Image Analytics 中心（联合英国多家 NHS 病理科） url: https://warwick.ac.uk/lizard-dataset 4

放射科影像断层扫描肺结节肺癌筛查计算机辅助检测

LUNA16 — 肺结节检测基准数据集 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

888 例 CT 扫描1,186 个标注结节551,065 个候选结节约 120 GB mhdrawCC BY 4.0 开放下载888 例胸部 CT 扫描（LIDC-IDRI 衍生队列）

888 例胸部 CT 与 1,186 个专家标注结节的肺结节检测公开基准

LUNA16 Grand Challenge（Radboud University Medical Center 等） url: https://luna16.grand-challenge.org/ 2

公共卫生队列研究脑神经神经影像健康老龄化

Cam-CAN — 跨寿命多模态脑影像队列 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

约 700 名影像受试者约 2,700 名家访队列MRI+MEG+认知行为BIDS 标准格式免费申请获取约 700 名影像受试者（另含约 2,700 名家访人群）

约 700 名 18-88 岁受试者的多模态 MRI、MEG 与认知行为开放队列

Cambridge Centre for Ageing and Neuroscience（剑桥大学 Cam-CAN 项目） url: https://camcan-archive.mrc-cbu.cam.ac.uk/dataaccess/ 5

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