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医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

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图像分类目标检测语义分割

共 219 个数据集

消化道内镜内窥镜影像医学图像分类AI 辅助诊断

GastroVision — 胃肠道内镜多类影像分类 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

约 1.8GB JPG 图像8,000 张 27 类上下消化道内镜免费开放获取CC BY 4.08,000 张内镜图像（非患者级数据）

8,000 张上下消化道内镜图像 · 27 类 · 多中心开放访问

OSF GastroVision Project url: https://osf.io/84e7f/ 3

糖尿病视网膜病变眼底影像专科影像DR 分级

DDR — 糖尿病视网膜病变分级与分割数据集 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

13,673 张眼底图9,598 名患者757 张病灶精标6 级多专家分级开放直链下载9,598 名患者

中国最大公开眼底 DR 分级+病灶分割数据集 · 1.37 万图 · 9,598 名患者

南开大学智能计算系统研究室（NKiCS）/ OIA 联合机构 url: https://github.com/nkicsl/DDR-dataset 4

医患对话中文NLP儿科医学语言理解

IMCS-21 — 中文医患多轮对话基准 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

4,116 条儿科对话164,731 句10 种儿科疾病5 任务多级标注GitHub 公开测试集走 CBLUE 天池非患者数据，对话语料（4,116 条儿科问诊记录）

4,116 条儿科医患对话 · 5 任务多级标注 · 中文医疗对话理解基准

复旦大学（魏忠钰）等 + GitHub lemuria-wchen/imcs21 url: https://github.com/lemuria-wchen/imcs21 6

临床电子病历与重症监护 EHR & ICU真实世界数据新冠队列Long COVID

N3C 美国新冠队列协作平台 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

OMOP CDM 5.3.1约 225 亿行700 万+ COVID 阳性84 个医疗系统飞地内 SQLPythonR 分析申请审核获取约 2,285 万名患者（Release 184，截至 2024-10）

美国最大新冠 EHR 队列 · 2,285 万患者 · OMOP 飞地协作分析

National Center for Advancing Translational Sciences (NCATS), NIH url: https://ncats.nih.gov/n3c 4

神经影像自闭症谱系障碍公共卫生与脑神经静息态 fMRI多中心联盟

ABIDE — 自闭症脑成像多中心联盟开放数据集 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

约 2,226 个影像数据集539+521 名 ASD 受试者rs-fMRI + T1 + 73 字段表型CC BY-NC-SA 开放获取2,156 名独立受试者（官网口径 2,226 个数据集）

17+19 站点 2,226 个 rs-fMRI/T1 自闭症脑影像开放数据

ABIDE Consortium（NYU Langone / Nathan S. Kline Institute / Child Mind Institute） url: http://fcon_1000.projects.nitrc.org/indi/abide/ 2

“放射科影像”“胸部X光”“传染病”“图像分类”“开放基准”

“COVIDx CXR — 全球最大开放新冠胸片基准 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集”

“30,386 张胸片”“16,648+ 名患者”“51+ 国多源聚合”“PNGJPEG 图像”“Kaggle 免费下载”“约 1.7 万名患者（训练 16,648 + 测试 378）”

“30,386 张胸片 / 1.7 万患者 / 51+ 国多源新冠 CXR 开放基准”

“滑铁卢大学 Vision and Image Processing 研究组 / DarwinAI Corp.（加拿大）” url: https://github.com/lindawangg/COVID-Net 3

肿瘤学病理组织与全切片结直肠癌腺体实例分割公开数据集

GlaS — 结直肠腺体实例分割基准 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

165 张 H&E 病理图像1,530 个腺体实例掩码16 位患者 T3T4 切片约 181 MB BMP注册后免费研究获取16 位患者（165 张图像，患者级人口学信息未公开）

165 张 H&E 病理图像，1,530 个腺体实例的 MICCAI 2015 分割基准

University of Warwick TIA Lab（Warwick-QU 数据集） url: https://warwick.ac.uk/fac/cross_fac/tia/data/glascontest/ 3

基因组学生物银行队列医院病例登记GWASPheWAS

BioBank Japan — 日本最大医院型生物银行 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

约 270,000 名患者 51 种疾病DNA 80 万管 · 血清 170 万管SNP 分型 27 万人 · WGS 1.6 万人NBDC 申请制受控获取约 270,000 名患者（51 种疾病，截至 2026-09）

27 万日本患者的基因组-临床随访医院队列 · 51 种疾病 220 深表型 GWAS

BioBank Japan（东京大学医科学研究所 IMSUT 主持，日本生物银行协作医院群） url: https://biobankjp.org/en/ 4

药物发现与化学信息学毒理学化学安全评估

EPA ToxCast — 化学物体外高通量毒性筛选 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

9,559 种化学物1,496 个检测终点26 个 assay 来源MySQLCSV 开放下载美国公共领域非患者数据，化学物毒性数据

9,559 种化学物 × 1,496 个体外检测终点的开放 HTS 毒性活性数据库

U.S. EPA 国家计算毒理学与暴露中心（ToxCast/Tox21 计划） url: https://www.epa.gov/comptox-tools/exploring-toxcast-data 5

外科手术与内窥镜胶囊内镜小肠病变检测计算机辅助诊断

CAD-CAP — 小肠胶囊内镜 AI 图像库 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

约 25,124 张标注帧4,174 例检查视频每帧 ±25 帧邻接序列申请获取PillCam SB3 单设备4,174 例小肠胶囊内镜检查（1,480 例含病灶、206 例正常对照）

12 家法国中心 4,174 例检查提炼约 25,000 张标注帧

CAD-CAP 法国多中心联盟（Sorbonne 大学 / AP-HP 圣安东尼医院 / ETIS） url: https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC7035135/ 6

专科影像眼科眼底彩照病灶分割公开数据集

IDRiD — 像素级病灶标注眼底数据集 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

516 张眼底彩照81 张像素级病灶掩码4288×2848 JPGCC BY 4.0 开放获取2009-2017 采集516 张图像（自数千次检查精选，患者级人数未公开）

516 张眼底彩照，像素级 DR 病灶分割与分级标注

IEEE DataPort（SGGS IE&T Nanded 等） url: https://ieee-dataport.org/open-access/indian-diabetic-retinopathy-image-dataset-idrid 6

医疗 NLP评测基准中文文本信息抽取

CBLUE 中文生物医学语言理解评测基准 — 18 任务医疗 NLP 评测基准 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

约 195MB ZIP18 个子任务约 34 万条标注样本CC BY-NC-SA 4.0天池实名申请获取非患者数据，评测语料

首个中文医疗 NLP 多任务评测基准：18 个子任务、约 34 万条标注样本、天池长期打榜

中国中文信息学会医疗健康与生物信息处理专业委员会（CHIP）× 阿里云天池 url: https://tianchi.aliyun.com/cblue 3

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