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医学影像 AI-Ready 数据集

电子病历与文本数据集

病灶分割与标注数据集

共 1196 个数据集

Human Brain snRNA-seq Atlas — 1400 万核 · 31 脑区 · 2,239 例死后样本的 AD 单核转录组图谱
基因组学与多组学单细胞基因组学神经科学神经退行性疾病阿尔茨海默病转录组

Human Brain snRNA-seq Atlas — 1400 万核 · 31 脑区 · 2,239 例死后样本的 AD 单核转录组图谱

约 1400 万细胞核31 个脑区2,239 例死后样本GEO 内仅 6 例验证样本2,239 例深度表型化死后样本(GEO 归档仅 6 例 iPSC 验证样本)

GSE326002 / PRJNA1442802:CN·AD·CR·PART 四分组的人脑单核 RNA 测序最大规模自述图谱

NMSC Spatial Multi-omic Atlas — 免疫抑制非黑素瘤皮肤癌的空间多组学图谱
基因组学与多组学转录组单细胞基因组学皮肤癌肿瘤学

NMSC Spatial Multi-omic Atlas — 免疫抑制非黑素瘤皮肤癌的空间多组学图谱

原始数据多组学数据138 例患者 / 150 份标本(55 免疫正常 IC + 83 免疫抑制 IS);GEO 层:GSE316922 36 样本来自 30 例,GSE306129 论文口径 14 例 / GEO 口径

GSE306129 空间 ATAC 28 样本 x GSE316922 scRNA-seq 36 样本 的双层 GEO 资源:MD 安德森 138 例 BCC/cSCC 队列揭示「免疫抑制不是免疫细胞变少,而是巨噬细胞抗原呈递失灵 + 空间组织被拆散」

Inflammation Atlas — 首个炎症细胞图谱:634 万 PBMC / 1,047 例患者 / 19 种疾病
基因组学与多组学单细胞基因组学转录组COVID-19肿瘤学

Inflammation Atlas — 首个炎症细胞图谱:634 万 PBMC / 1,047 例患者 / 19 种疾病

原始数据人工标注1,047 例患者 + 健康对照(对照人数论文摘要未单列);19 种疾病;女性 56% / 男性 43%

CNAG 与 EPFL 联合构建的跨疾病外周血单细胞转录组图谱:15 个免疫谱系 × 64 个细胞状态,配 scANVI 生成模型与 XGBoost+d-SHAP 可解释分类器;处理后矩阵 CC BY 4.0 于 Zenodo 公开,原始测序走 GEO 公开 + EGA 受控双轨

Expression Atlas — 重新计算过的公共基因表达数据
基因组学与多组学转录组单细胞基因组学变异与注释

Expression Atlas — 重新计算过的公共基因表达数据

表达矩阵差异分析结果样本注释表不直接涉及患者个体(样本级元数据含年龄、性别、疾病等字段,属公开文献与数据库已发布信息)

EMBL-EBI 手工策展、统一重处理的 4,562 个转录组与蛋白组实验

GHDx — 全球健康数据的总目录与可获取性登记册
公共卫生与流行病学公共卫生统计全球健康调查数据

GHDx — 全球健康数据的总目录与可获取性登记册

目录元数据混合数据类型不涉及患者个体(目录层,条目指向外部数据集)

16 类数据、200 余国家地区、四级获取门槛的健康数据索引

Cellosaurus — 16.9 万细胞系的鉴定权威与误认档案
基因组学与多组学变异与注释知识图谱肿瘤学

Cellosaurus — 16.9 万细胞系的鉴定权威与误认档案

文本与本体数据人工标注不涉及患者个体(细胞系条目 169,026 个,含物种、性别、年龄与疾病标签)

16.9 万细胞系、904 物种、47 万条交叉引用的细胞系知识库

arXiv 预印本 — 326 万篇,医学影像模型的真正首发地
医疗NLP公共卫生与流行病学评测基准

arXiv 预印本 — 326 万篇,医学影像模型的真正首发地

3,226,976 篇1991 年至今eess.IV 医学影像元数据 CC0逐篇选许可Atom API每日约 1,000+ 篇不适用(学术预印本文献,无患者数据;部分论文含公开数据集上的实验,但数据集本身不在 arXiv 内)

它不是一个数据集,是一个每天新增一千多篇论文的开放档案:eess.IV(影像与视频处理)是医学影像方法的首发地,通常比期刊早 6–18 个月。元数据全部 CC0,正文许可由作者逐篇选择——这意味着你拿到的每一篇,可用范围都不一样,而这是把它当训练语料时最容易忽略的一处

UCDP 冲突数据 — 41.8 万起有组织暴力事件,记到村庄与单日
公共卫生与流行病学电子健康记录评测基准

UCDP 冲突数据 — 41.8 万起有组织暴力事件,记到村庄与单日

417,968 起事件126 个国家1989–2025,425.8 万死亡村庄级坐标单日精度CC BY 4.0,79 个数据集不适用(事件级聚合记录,不含个体身份;伤亡数为事件级估计,非个人记录)

它不是伤亡统计,是把「暴力」这件事拆成可核验的最小单元:某天、某个坐标、哪两方、死了多少人、依据什么来源。37 年、126 个国家、425.8 万条死亡记录。做冲突与健康研究时,这是唯一能让你把「战争」当作一个可测量的环境暴露变量接进模型的东西

OECD 健康统计 — 86 个 dataflow,把「卫生系统」拆成可比的零件
公共卫生与流行病学电子健康记录评测基准

OECD 健康统计 — 86 个 dataflow,把「卫生系统」拆成可比的零件

86 个 dataflow18 组 DSD51 个经济体1960–2024SDMX 3.0CC BY 4.0卫生系统绩效不适用(国家与地区级聚合统计;PaRIS 患者报告指标调查在独立的 dataflow,为抽样调查聚合结果,不含个体记录)

它不是一份数据,是一套 SDMX 3.0 的机器可读接口:生命 expectancy、医疗支出与筹资、医生护士密度、病床与 ICU、住院与手术量、癌症与传染病死亡、可避免死亡、药品市场——全部放在同一套维度模型下。做卫生系统比较研究时,你真正需要的那张「国家 × 年 × 指标」表,这里有 18 组数据流等着被拼起来

世界银行开放数据 — 29,544 个指标,把「国家」变成一行
公共卫生与流行病学电子健康记录多模态评测基准

世界银行开放数据 — 29,544 个指标,把「国家」变成一行

29,544 个指标296 个国家与地区71 个数据源健康主题 658 指标1960 年至今CC BY 4.0v2 REST API不适用(国家与地区级聚合统计,无个体记录;个体级微数据在独立的 Microdata Library,另需申请)

它不是一个数据集,是 71 个数据源的统一检索层:每个指标都标了原始生产者(WHO、UNICEF、ILO、IMF),每条观测都带国家代码、年份、单位与小数位。做跨国健康公平研究时,你真正需要的那张表在这里是「国家 × 年份 × 指标」的三维点阵

Matbench — 13 个材料任务,给算法排座次
药物发现与化学化学信息学分子性质预测评测基准量子化学

Matbench — 13 个材料任务,给算法排座次

13 个任务408,062 条样本五折嵌套交叉验证10 个原始来源modified BSD划分文件随包分发不适用(无机材料数据库,无生物个体;13 个任务中 0 个涉及人体样本)

它本身不是一个材料数据库,而是一份「考卷」:13 道题、10 个原始数据来源、40.8 万条样本,五折嵌套交叉验证、随机种子写死、划分文件随包分发。它的价值在于把「我的模型更好」这句话变成可复核的分数——代价是,你必须接受它的清洗口径与划分方式,而不是自己那套

HMD — 41 个国家的死亡率,能一路算到 1751 年
公共卫生与流行病学死亡登记公共卫生统计流行病学全球健康

HMD — 41 个国家的死亡率,能一路算到 1751 年

41 个国家地区回溯至 1751 年单岁年龄STMF 38 国周数据HCD 18 国死因CC BY 4.0需注册不适用(国家级聚合统计,非个体级记录;最小统计单元为年龄×年份×性别的暴露人年)

同一个方法协议做了 26 年:把各国统计局口径不一的出生数、死亡数、人口数,重建成年龄×年份×性别的单岁标准网格。瑞典那条序列从 1751 年开始,跨越 274 年没有断过——这是全人类最长的一条连续死亡记录

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