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医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

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图像分类目标检测语义分割

共 1497 个数据集

医疗NLP临床文本电子健康记录重症监护评测基准

GPT-3.5 生成的低资源 ICD 编码出院摘要

合成数据文本数据无真实受试者：9,606 份文档全部由 GPT-3.5 生成；其编码组合源自 MIMIC-IV v2.2 真实出院摘要（上游约 25.7 万住院、4.1 万成年 ICU 患者，沿用 MIMIC-IV

爱丁堡大学团队用 gpt-3.5-turbo-0613 围绕 114 个低资源 ICD-10 编码生成的 9,606 份合成出院摘要，含提示词、原始输出与预测编码，用于缓解 MIMIC-IV 长尾码稀疏、增强神经编码模型，PhysioNet 凭证制发放

GPT-3.5（gpt-3.5-turbo-0613）基于 MIMIC-IV v2.2 / MIMIC-IV-Note v2.2 真实出院摘要的 ICD-10 编码组合生成的合成出院摘要：每条含作为生成依据的 ICD-10-CM/PCS 编码列表与描述、完整提示词、模型原始输出（含自编预测编码与出院状态预测）及增强实验用清洗版文本 30

医学影像病理图像医学图像分割挑战赛数据集皮肤癌

PUMA — 黑色素瘤全景分割数据集

310 张 40× H&E ROI PNG约 14.5 GB Zenodo 归档97,429 个公开标注核CC0 1.0 公开直链GeoJSON 双层标注310 张 ROI（155 原发 + 155 转移）

310 张 40× H&E ROI 的黑色素瘤核与组织全景分割基准

UMC Utrecht & TU Eindhoven（PUMA Challenge） url: https://puma.grand-challenge.org 52

医学影像病理图像乳腺癌肿瘤学

HEROHE — H&E WSI 免 IHC 预测 HER2 状态

["509 张 H&E WSI""训练 359/360 例 + 测试 150 例""MIRAX 格式""CC BY-NC-ND 3.0 开放获取"]约 509 名患者（一例一张全切片）

509 张乳腺 H&E 全切片，免 IHC 预测 HER2 阳性/阴性

name: "葡萄牙波尔图肿瘤研究所（IPO Porto）/ Ipatimup" url: "https://ecdp2020.grand-challenge.org" 63

生理信号脑电信号癫痫儿科

CHB-MIT 头皮 EEG 库 — 686 个文件里的癫痫发作标注体系

时序信号人工标注临床记录23 名患者（24 个录制段，chb17 分 a/b 两段；官方摘要写作「22 名受试者、23 例」），年龄 1.5–22 岁

982.9 小时 / 23 例患者 / 198 次发作 / 8 种通道组合

https://physionet.org/content/chbmit/1.0.0/ 158

医学影像眼科影像糖尿病视网膜病变

DDR — 糖尿病视网膜病变分级与分割数据集

13,673 张眼底图9,598 名患者757 张病灶精标6 级多专家分级开放直链下载9,598 名患者

中国最大公开眼底 DR 分级+病灶分割数据集 · 1.37 万图 · 9,598 名患者

南开大学智能计算系统研究室（NKiCS）/ OIA 联合机构 url: https://github.com/nkicsl/DDR-dataset 145

生理信号多模态心电信号影像-文本对齐心血管疾病重症监护

MIMIC-IV-ECG — 院内 12 导联心电图波形库

约 800,035 条 12 导联 ECG161,352 名患者500 Hz × 10 秒 WFDB解压约 90.4 GBODbL v1.0 开放获取161,352 名患者（官方口径约 16 万名）

80 万条 12 导联心电波形 · 16 万患者 · 可关联全院 EHR

MIT Laboratory for Computational Physiology / PhysioNet（BIDMC 采集） url: https://physionet.org/content/mimic-iv-ecg/1.0/ 97

公共卫生与流行病学医保理赔流行病学

HealthData.gov — 美国联邦健康开放数据门户

23,000+ 数据集Public Domain 许可REST API 免费覆盖美国 3.3 亿人口

美国HHS开放数据门户 · 23,000+数据集 · 全免费

美国卫生与公众服务部首席数据官办公室（HHS OCDO） url: https://healthdata.gov/ 128

电子健康记录神经科学神经退行性疾病队列研究临床电子病历阿尔茨海默病

NACC — 美国阿尔茨海默病国家协调中心队列

56,000+ 名受试者217,000+ 次临床评估37 个 ADRC 中心15,000+ 人有 MRIPETCSV 免费申请获取56,000+ 名受试者（20,000+ 名活跃随访）

56,000+ 受试者、37 个 ADRC、最长 20 年随访的阿尔茨海默病国家纵向数据库

National Alzheimer's Coordinating Center（NIA 资助，华盛顿大学托管） url: https://www.naccdata.org/ 126

医学影像手术视频医学图像分割

CaDIS — 白内障手术语义分割基准数据集

4,670 帧手术图像36 类像素级标注960×540 RGB 图像3,550/534/586 官方划分开放获取50 名白内障手术患者（母数据集 CATARACTS，2015 年）

4,670 帧像素级标注白内障显微手术图像，36 类手术场景分割

Digital Surgery Ltd（现 Medtronic Digital Surgery） url: https://cataracts.grand-challenge.org/CaDIS/ 79

医学影像病理图像医学图像分割结直肠癌肿瘤学

GlaS — 结直肠腺体实例分割基准

165 张 H&E 病理图像1,530 个腺体实例掩码16 位患者 T3T4 切片约 181 MB BMP注册后免费研究获取16 位患者（165 张图像，患者级人口学信息未公开）

165 张 H&E 病理图像，1,530 个腺体实例的 MICCAI 2015 分割基准

University of Warwick TIA Lab（Warwick-QU 数据集） url: https://warwick.ac.uk/fac/cross_fac/tia/data/glascontest/ 63

医学影像医学问答与基准图像分类病理图像结直肠癌评测基准

NCT-CRC-HE-100K — 结直肠癌组织学图像分类

约 24.2 GB TIFF（3 个 ZIP）100,000 张训练 patch7,180 张验证 patch9 类组织标签136 名患者（86 张源切片 + 50 名验证患者）

10 万张结直肠癌 H&E patch 的 9 类组织分类金标准

Zenodo — National Center for Tumor Diseases (NCT) Heidelberg / University Medical Center Mannheim url: https://zenodo.org/records/1214456 127

神经科学公共卫生与流行病学脑影像队列研究

FCP-1000 — 全球首个千例静息态功能连接组开放数据集

1,414 名健康志愿者35 个国际中心静息态 fMRI + T1 结构像NIfTIDICOM 格式注册后免费获取S3 匿名下载1,414 名健康志愿者（FCP Classic 托管 1,288 例）

1,414 名受试者、35 个国际中心的首个大规模静息态 fMRI 开放共享项目

INDI（International Neuroimaging Data-sharing Initiative）/ NITRC url: https://fcon_1000.projects.nitrc.org/ 105

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