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医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

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图像分类目标检测语义分割

共 1224 个数据集

医学影像病理图像医学图像分割结直肠癌肿瘤学

GlaS — 结直肠腺体实例分割基准

165 张 H&E 病理图像1,530 个腺体实例掩码16 位患者 T3T4 切片约 181 MB BMP注册后免费研究获取16 位患者（165 张图像，患者级人口学信息未公开）

165 张 H&E 病理图像，1,530 个腺体实例的 MICCAI 2015 分割基准

University of Warwick TIA Lab（Warwick-QU 数据集） url: https://warwick.ac.uk/fac/cross_fac/tia/data/glascontest/ 62

医学影像医学问答与基准图像分类病理图像结直肠癌评测基准

NCT-CRC-HE-100K — 结直肠癌组织学图像分类

约 24.2 GB TIFF（3 个 ZIP）100,000 张训练 patch7,180 张验证 patch9 类组织标签136 名患者（86 张源切片 + 50 名验证患者）

10 万张结直肠癌 H&E patch 的 9 类组织分类金标准

Zenodo — National Center for Tumor Diseases (NCT) Heidelberg / University Medical Center Mannheim url: https://zenodo.org/records/1214456 118

神经科学公共卫生与流行病学脑影像队列研究

FCP-1000 — 全球首个千例静息态功能连接组开放数据集

1,414 名健康志愿者35 个国际中心静息态 fMRI + T1 结构像NIfTIDICOM 格式注册后免费获取S3 匿名下载1,414 名健康志愿者（FCP Classic 托管 1,288 例）

1,414 名受试者、35 个国际中心的首个大规模静息态 fMRI 开放共享项目

INDI（International Neuroimaging Data-sharing Initiative）/ NITRC url: https://fcon_1000.projects.nitrc.org/ 100

药物发现与化学医学问答与基准分子对接化学信息学药物-靶点相互作用评测基准

KIBA — 激酶抑制剂结合亲和力基准数据集

246,088 个 KIBA scores52,498 个化合物467 个激酶靶点基准版 118,254 对相互作用29.8 MB ZIP开放免费下载不适用（化合物-靶标对数据：基准版 118,254 对相互作用）

52,498 化合物 × 467 激酶、246,088 个整合亲和力分数的开放药物发现基准

University of Helsinki — Institute for Molecular Medicine Finland (FIMM) url: https://zenodo.org/records/5105698 48

医学影像X光影像结核病

Shenzhen TB CXR Set — 深圳结核病胸片基准

662 张 PNG 胸片约 3.8 GB免费直接下载双肺掩膜+19 类病灶像素级标注662 例受检者（约 2012 年，深圳市第三人民医院门诊）

662 张深圳临床常规胸片：326 正常 vs 336 结核，含肺掩膜

National Library of Medicine（NLM/NIH）× 深圳市第三人民医院 url: https://data.lhncbc.nlm.nih.gov/public/Tuberculosis-Chest-X-ray-Datasets/Shenzhen-Hospital-CXR-Set/index.html 85

生理信号公共卫生与流行病学心电信号卫生服务研究心血管疾病时序数据

CODE-15% — 巴西远程医疗 12 导联心电图

345,779 条 12 导联 ECG233,770 名患者46.3 GB HDF5CC BY 4.0 开放233,770 名患者

34.5 万条 12 导联 ECG · 23.4 万患者 · 六类异常二元标签

Telehealth Network of Minas Gerais (UFMG) url: https://zenodo.org/records/4916206 108

基因组学与多组学测序数据表观基因组

190 万+免疫表位、804 万+实验记录的全球最大免疫表位开放数据库

NIAID / La Jolla Institute for Immunology (LJI) url: https://www.iedb.org 59

基因组学与多组学测序数据蛋白质组学

KEGG 京都基因与基因组百科全书

KEGG通路数据库pathwayKEGG Orthology代谢重建通路富集KGML基因组注释0（通路与基因组知识库，不含患者级数据）

13 个数据库 × 6,782 条通路 × 约 1.1 万物种基因组的三十年生物系统知识库

Kanehisa Laboratories（京都大学生物信息中心）；https://www.kegg.jp/ 69

生理信号可穿戴传感心血管疾病睡眠信号队列研究

MESA Sleep — 多民族居家睡眠监测金标准

385 GB EDF+XML+CSV10,364 个文件665 个变量2,237 名受试者免费签署 DUA 获取2,237 名受试者（PSG 2,166 例完成）

2,237 人多民族居家 PSG + 7 天活动计睡眠数据集

美国国家睡眠研究资源（NSRR，sleepdata.org） url: https://sleepdata.org/datasets/mesa 112

医学影像CTMRI医学图像分割

Medical Segmentation Decathlon — 十任务通用医学影像分割基准

约 72.5GB 大小2,633 例 3D 体素数据10 个分割任务CC-BY-SA 4.0 开放免费获取 2,633 例扫描

King''''s College London + Memorial Sloan Kettering + German Cancer Research Center 等 url: http://medicaldecathlon.com/ 161

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