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数据标签

医学影像 AI-Ready 数据集

电子病历与文本数据集

病灶分割与标注数据集

共 1219 个数据集

ZCHSound — 浙江大学 1259 名儿童先心病心音数据库:五分类智能听诊基准
生理信号心血管疾病儿科医学问答与基准评测基准语音信号

ZCHSound — 浙江大学 1259 名儿童先心病心音数据库:五分类智能听诊基准

原始数据人工标注1259 名儿童受试者(941 名高质量 clean 子集 + 318 名新生儿 noisy 子集;共 1259 条录音)

浙大儿院牵头三中心采集 1259 名 2 天至 14 岁儿童的单听诊点心音(PCG),含 941 名高质量与 318 名新生儿低质量双子集,五类 CHD 诊断标签由双专家共识确认,配套正常/ASD/PDA/PFO/VSD 五分类、四任务基准与 84 维时频特征,随机森林基线 F1 达 90.3%

HRA Knowledge Graph — 人体参考图谱 RDF 知识图谱:解剖-细胞-标志物主干
基因组学与多组学知识图谱单细胞基因组学多模态

HRA Knowledge Graph — 人体参考图谱 RDF 知识图谱:解剖-细胞-标志物主干

知识图谱本体与术语参考数据元数据人工标注HRApop v1.1 汇聚 175 位捐献者(男 92 / 女 83)的组织块与数据集;本体层本身不含患者个体,hra-pop-full 扩展层含 32,047 个供体实体(跨门户去重前口径)

NIH HuBMAP 主导、Indiana 大学 CNS 维护的 HRA 知识图谱:v2.2 发布 10,064,033 节点 / 171,250,177 边 / 125.84 GB,13 类数字对象经 Uberon 与细胞本体对齐;v2.5 起每年 6-15 与 12-15 双发,CC BY 4.0 全开放,SPARQL 与 Zenodo 双入口

MedVAL-Bench 医学文本校验基准
医疗NLP临床文本医学问答评测基准

MedVAL-Bench 医学文本校验基准

文本数据人工标注指令数据840 条医师标注输出(12 位医师;MIMIC 派生 310 条需认证获取,公开镜像 530 条)

840 条医师标注的 LM 医学输出校验基准——12 位内科与放射科医师按 10 类错误与 4 级风险分级,专测「判断一段医学表述是否站得住脚」而非「会不会写」

VTaC — ICU 床旁监护仪室性心动过速报警专家双标注基准
生理信号心电信号重症监护评测基准

VTaC — ICU 床旁监护仪室性心动过速报警专家双标注基准

人工标注生理波形原始数据5,037 条 VT 报警事件 / 2,260 名患者波形记录(train 1,808 / val 226 / test 226);底层池 2,376 名患者、20,158 条连续波形记录(2013-

三所美国医院 ICU 触发的 5,037 条室性心动过速(VT)报警:每条由至少两名专家独立标注真假、三厂商多模态波形(ECG+PPG/PLETH+ABP,250 Hz),假报警占 71.39%——继 PhysioNet Challenge 2015 之后报警疲劳研究最大规模的公开基准,NeurIPS 2023 Datasets & Benchmarks 发表

RadNLI 放射报告自然语言推理数据集
医疗NLP医学问答与基准电子健康记录多模态

RadNLI 放射报告自然语言推理数据集

文本数据人工标注无独立受试者队列:句对文本源自 MIMIC-CXR 验证集报告,沿用 MIMIC-CXR 口径(验证集约 1,000 余例检查、数百名患者);数据集本身只含去标识化的报告句子与推理标签

斯坦福团队在 PhysioNet 发布的放射学报告域自然语言推理评测集:句对采自 MIMIC-CXR 验证集报告,由医学专家与计算机科学专家双向标注三类推理标签,用于评估放射报告生成的事实一致性

MIMIC-III 出院小结问题性阿片使用标注集
医疗NLP临床文本电子健康记录重症监护命名实体识别真实世界数据

MIMIC-III 出院小结问题性阿片使用标注集

人工标注文本数据去标识化数据100 名患者(来源为 MIMIC-III 中 762 名带 ICD-9 OUD 相关编码患者中的随机样本);137 份出院小结

100 名 ICU 患者、137 份出院小结、3,270 条句级与患者级标注,33 类阿片使用及相关语境标注模式,PhysioNet 认证访问

ECHOVIEW 超声心动图切面分类标注
医学影像多模态图像分类心血管疾病

ECHOVIEW 超声心动图切面分类标注

机器学习标注影像数据463 名患者(BIDMC,2017-2019)

MIMIC-IV-ECHO 派生切面分类标注:463 名患者 717 项检查的经胸超声视频逐段输出 23 类视图概率,机器学习预标注而非人工金标准

The Human Sleep Project — 12 万夜五中心真实临床多导睡眠图全生命周期数据集
生理信号睡眠信号脑电信号临床电子病历真实世界数据队列研究

The Human Sleep Project — 12 万夜五中心真实临床多导睡眠图全生命周期数据集

原始数据人工标注临床数据信号数据90,166 名唯一患者(摘要口径 more than 90,000)

HSP v3.0:90,166 名患者、119,234 条整夜记录、5 个美国学术医疗中心的临床 PSG(115,129)与家庭睡眠呼吸监测(4,105),BIDS 1.7.0 结构 + 22 类 ICD-10 诊断链接 + 人工与 CAISR 自动双标注,受 DUA 资质访问

KNOAP2020 膝骨关节炎发病预测挑战赛
医学影像MRIX光影像骨骼肌肉影像挑战赛数据集队列研究

KNOAP2020 膝骨关节炎发病预测挑战赛

影像数据临床数据标签数据453 膝(242 人);测试集 423、训练集 30;上游 PROOF 试验 407 名超重/肥胖女性

PROOF 队列 423 膝盲测、30 膝带标签:1.0–1.5T MRI 双序列 + 数字化 X 线 + 13 项临床因素预测 6.5 年新发

Medical-CXR-VQA 胸片问答数据集
医学影像X光影像视觉问答评测基准多模态

Medical-CXR-VQA 胸片问答数据集

人工标注影像数据文本数据原始数据215,547 项胸部影像研究(源自 MIMIC-CXR,患者级数量以 MIMIC-CXR 口径为准);问答对 780,014 条

基于 MIMIC-CXR 报告、经微调 LLM 流水线构建的大规模胸部 X 光视觉问答数据集——215,547 项影像研究上生成 780,014 个临床问答对,覆盖存在、异常、位置、级别、视图、类型六类问题,配套可解释关系图 VQA 方法与放射科医生双评质检

GPT-3.5 生成的低资源 ICD 编码出院摘要
医疗NLP临床文本电子健康记录重症监护评测基准

GPT-3.5 生成的低资源 ICD 编码出院摘要

合成数据文本数据无真实受试者:9,606 份文档全部由 GPT-3.5 生成;其编码组合源自 MIMIC-IV v2.2 真实出院摘要(上游约 25.7 万住院、4.1 万成年 ICU 患者,沿用 MIMIC-IV

爱丁堡大学团队用 gpt-3.5-turbo-0613 围绕 114 个低资源 ICD-10 编码生成的 9,606 份合成出院摘要,含提示词、原始输出与预测编码,用于缓解 MIMIC-IV 长尾码稀疏、增强神经编码模型,PhysioNet 凭证制发放

PUMA — 黑色素瘤全景分割数据集
医学影像病理图像医学图像分割挑战赛数据集皮肤癌

PUMA — 黑色素瘤全景分割数据集

310 张 40× H&E ROI PNG约 14.5 GB Zenodo 归档97,429 个公开标注核CC0 1.0 公开直链GeoJSON 双层标注310 张 ROI(155 原发 + 155 转移)

310 张 40× H&E ROI 的黑色素瘤核与组织全景分割基准

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