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医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

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图像分类目标检测语义分割

共 103 个数据集

眼科眼底影像病理性近视图像分割医学分类

PALM — 病理性近视眼底多任务分割 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

1,200 张眼底彩照400/400/400 官方划分4 项任务多标签研究用途注册获取720 名受试者 / 1,200 只左眼眼底照

1,200 张眼底照 · 病理性近视分类＋病灶/视盘分割＋中央凹定位

iChallenge / Zhongshan Ophthalmic Center & Baidu（IEEE DataPort / FigShare 存档） url: https://palm.grand-challenge.org 1

医疗 NLP 与多模态Medical VQA影像问答

VQA-Med — 医学影像视觉问答年度评测 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

跨 7 个年度版本累计约 3.5 万 QA 对放射+内镜多模态竞赛注册后获取逐年评测协议完整匿名医学影像问答对（非患者级，约 3.5 万 QA 对/7 年版）

ImageCLEF 年度医学 VQA 挑战系列：2018-2024，多模态影像 + QA 对评测基准

ImageCLEF / CLEF url: https://www.imageclef.org/ 1

病理组织与全切片肿瘤学乳腺癌AI 医学影像挑战

TUPAC16 — 乳腺肿瘤增殖 WSI 评分挑战 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

约 821 张 WSI训练 500 + 测试 321注册后获取H&E SVS 全切片821 例 TCGA-BRCA + 73 例荷兰辅助有丝分裂病例

乳腺 WSI 肿瘤增殖评估标准挑战 · 821 张 WSI · 三大任务

Eindhoven 医学图像分析组 (IMAG/e) / Radboud DIAG url: https://tupac.grand-challenge.org/ 1

EHR理赔行政档案健康保险药物流行病学全人群队列

NHIRD — 台湾健保理赔全人群数据库 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

覆盖约 2,300 万参保人单项目≤10%人口可申请卫生福利资料科学中心审批制ICD-9-CMICD-10-CMLHID 1 百万抽样子集覆盖约 2,300 万中国台湾省参保人

覆盖 2,300 万中国台湾省参保人理赔档案，可串联 70+ 健康数据库

中国台湾卫生福利部统计处 / 卫生福利资料科学中心 url: https://dep.mohw.gov.tw/DOS/cp-5119-59201-113.html 1

外科手术内窥镜与 3D 重建手术视频实例分割

HeiCo — 结直肠腹腔镜手术器械分割 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

30 段结直肠腹腔镜视频14 类手术相位10,040 帧实例分割掩码CC BY-NC-SASynapse 申请获取30 例结直肠腹腔镜手术视频

30 段结直肠腹腔镜视频 + 14 相位 + >10,000 帧实例分割标注

DKFZ / Heidelberg University Hospital url: https://link.springer.com/article/10.1038/s41597-021-00882-2 1

生理信号睡眠分期EEG时序基准

MASS — 蒙特利尔睡眠研究档案 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

200 例整夜 PSG256 Hz 采样SS1-SS5 五子集EDF+ 格式需伦理批准申请AASMR&K 双分期手册200 名受试者（97 男 / 103 女）

200 例实验室 PSG 睡眠分期基准 · 5 子集 · 256 Hz · 引用 443+

Université de Montréal / CÉAMS (Centre d'études avancées en médecine du sommeil) url: https://borealisdata.ca/dataverse/MASS 2

临床电子病历初级保健 EHR流行病学队列风险预测处方药物流行病学

QResearch — 英国初级保健研究数据库 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

约 3,500 万累计患者1,500+ EMIS 诊所申请审核制可链接 HESONS 死亡记录回溯至 1989约 3,500 万累计患者（部分表述 4,000 万）

英国最大 EMIS 初级保健 EHR · 3,500 万+患者 · QRISK/QCovid 发源地

QResearch（University of Oxford & EMIS Health） url: https://www.qresearch.org/ 2

脑神经公共卫生神经科学参考图谱单细胞基因组学

BICCN — 哺乳动物脑细胞普查多模态图谱 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

数百万细胞 · 多模态跨小鼠狨猴人类运动皮层CC BY 4.0 开放NeMOBILDANDI 档案biccn.org 门户浏览运动皮层细胞普查图谱（细胞级数据，非患者队列）：小鼠/狨猴/人类供体数百万细胞

NIH BRAIN 计划跨物种运动皮层细胞普查图谱 · 数百万细胞 · 多模态

BRAIN Initiative Cell Census Network (BICCN) / BRAIN Cell Data Center (BCDC), Allen Institute url: https://www.biccn.org 2

药物警戒自发不良事件报告上市后安全监测真实世界证据

FAERS — 全球最大自发药物警戒库 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

FDA 公开免费下载季度非累计 ASCIIXMLMedDRA 编码七表 PRIMARYID 关联含重复报告需去重去标识化公开数千万条报告（含重复，FDA 仪表盘 2026-03 约 3,282 万条）

FDA 不良事件自发报告系统 · 累计报告 3,000 万+ · 公开免费

U.S. Food and Drug Administration (FDA) url: https://fis.fda.gov/extensions/FPD-QDE-FAERS/FPD-QDE-FAERS.html 3

医疗 NLP 与多模态病理图像视觉问答医学 AI 基准

PathVQA — 病理视觉问答基准数据集 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

4,998 张病理图像32,799 条问答对约 785 MB ParquetMIT 许证开放下载不适用（图像源自出版教科书与 PEIR 公共数字图书馆，不含患者信息）

4,998 张病理图像、32,799 条问答对的病理 VQA 开放基准

UCSD-AI4H（加州大学圣地亚哥分校 / 卡内基梅隆大学 / 北京工业大学） url: https://github.com/UCSD-AI4H/PathVQA 2

临床电子病历与重症监护初级保健 EHR药物警戒真实世界数据

THIN — 英国初级保健 EHR 数据库 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

约 1,970 万累计患者850+ 全科诊所5 张核心数据表Read code 层级编码申请审核 + 商业许可1994 年起纵向记录累计约 1,970 万患者（现役约 290 万）

覆盖约 6% 英国人口的 1,970 万人初级保健电子病历库

IQVIA（The Health Improvement Network / IQVIA Medical Research Data） url: https://www.the-health-improvement-network.com/ 2

公共卫生与脑神经脑影像影像遗传学多中心联盟荟萃分析

ENIGMA — 国际多中心脑影像遗传联盟 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

50 个活跃工作组43 国 200+ 机构GWAS 汇总 51,665 人26 种脑疾病协议公开共享汇总统计申请获取代表性 GWAS 汇总 30,717-51,665 名受试者

50 个工作组、43 国 200+ 机构的分布式脑影像遗传荟萃分析联盟

ENIGMA Consortium（USC Stevens 神经影像与信息学研究所） url: http://enigma.ini.usc.edu/ 2

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