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共 230 个数据集

CIMA — 结直肠癌免疫微环境 CODEX 高维空间成像数据集 | 千方医数集

空间生物学结直肠癌免疫微环境高维成像CODEX

CIMA — 结直肠癌免疫微环境 CODEX 高维空间成像数据集 | 千方医数集

TIFF 56 通道细胞空间坐标258K 细胞CC BY 4.0约 2TB35 名结直肠癌患者

斯坦福大学 Nolan 实验室 + 伯尔尼大学病理研究所, TCIA 公开归档 50

CytoImageNet — 微观成像领域大规模弱标签预训练数据集 | 千方医数集

生物图像分析迁移学习显微成像预训练数据集药物发现

CytoImageNet — 微观成像领域大规模弱标签预训练数据集 | 千方医数集

显微镜图像PNG 灰度弱标签荧光明场无患者数据，细胞/微生物/显微结构图像

BBBC + IDR + Recursion + Kaggle + CIL 5 大数据库 40 个公开数据集 27

MoNuSeg — 多器官细胞核分割基准数据集 | 千方医数集

计算病理学细胞核分割H&E实例分割多器官基准数据集

MoNuSeg — 多器官细胞核分割基准数据集 | 千方医数集

显微镜图像TIFXML 标注TCGA 来源约 97 MB44 张图像（来自约 44 名独特患者）

TCGA (The Cancer Genome Atlas)，18 家医院多中心 42

ANHIR (自动非刚性组织学图像配准) — 数字病理配准基准数据集 | 千方医数集

数字病理全切片图像挑战赛

ANHIR (自动非刚性组织学图像配准) — 数字病理配准基准数据集 | 千方医数集

355 张全切片图像481 个配准对18 种染色约 50GB 大小多物种 (小鼠/人类)

CTU Prague / grand-challenge.org · https://anhir.grand-challenge.org/ 21

BCNB (早期乳腺癌芯针活检) — 计算病理多示例学习数据集 | 千方医数集

数字病理乳腺癌多示例学习全切片图像腋窝淋巴结芯针穿刺

BCNB (早期乳腺癌芯针活检) — 计算病理多示例学习数据集 | 千方医数集

1058 名患者约 33 GBJPG WSI13 项临床特征1058 名

北京邮电大学 & 北京朝阳医院 (bcnb.grand-challenge.org) 36

PANDA (前列腺癌 Gleason 分级挑战赛) — 数字病理 AI 数据集 | 千方医数集

数字病理前列腺癌挑战赛全切片图像Gleason 分级多示例学习

PANDA (前列腺癌 Gleason 分级挑战赛) — 数字病理 AI 数据集 | 千方医数集

约 12625 张 WSI约 240 GBKaggle 平台ISUP 0-5 级2,113 名 (训练集)

Radboud University Medical Center (panda.grand-challenge.org) 37

TIGER (肿瘤浸润淋巴细胞计算挑战赛) — 乳腺癌病理 AI 数据集 | 千方医数集

数字病理乳腺癌挑战赛细胞检测组织分割预后分析

TIGER (肿瘤浸润淋巴细胞计算挑战赛) — 乳腺癌病理 AI 数据集 | 千方医数集

370+ 张 WSI约 2.6 GB (ROI 级)AWS Open Data 托管HER2+TNBC3,708 名 (临床验证)

Radboud University Medical Center (tiger.grand-challenge.org) 32

TCGA 癌症基因组图谱 AI-Ready 数据集 | 千方医数集

多组学数据基因组学转录组学表观组学蛋白质组学

TCGA 癌症基因组图谱 AI-Ready 数据集 | 千方医数集

约 2.5 PB 规模约 20000 个样本33 种癌症类型7 种分子表征平台11000+ 名患者11,000+ 名患者

美国国家癌症研究所 (NCI) https://portal.gdc.cancer.gov/ 33

fastMRI — 全球最大的原始 k 空间 MRI 重建数据集 | 千方医数集

MRI重建k空间膝部MRI脑部MRI前列腺MRI乳腺MRI

fastMRI — 全球最大的原始 k 空间 MRI 重建数据集 | 千方医数集

约 1.45 TB HDF58876+ 例全采样20000+ 例 DICOM12+ 扫描仪代码 MIT 开源8,876+ 人

NYU Langone Health CAI2R + Meta AI Research (FAIR) · https://fastmri.med.nyu.edu/ 37

MedPix — NLM 放射影像教学数据库 AI-Ready Wikipedia | 千方医数集

多模态医学教育CT影像MRI影像

MedPix — NLM 放射影像教学数据库 AI-Ready Wikipedia | 千方医数集

约 5.9 万张图像约 1.2 万病例约 322 MB (MedPix-2.0)约 1.2 万人 / 2,050 例

NLM (https://medpix.nlm.nih.gov/) / University of Palermo (https://github.com/CHILab1/MedPix-2.0) 52

OASIS 脑影像系列数据集 | 千方医数集

神经影像脑MRIPET成像病例随访

OASIS 脑影像系列数据集 | 千方医数集

1378 名参与者~2842 次 MR 扫描~2157 次 PET 扫描约 2-5 TB 大小2,607 名参与者

华盛顿大学 Knight ADRC | https://sites.wustl.edu/oasisbrains/ 42

RSNA Series — RSNA 年度 AI 挑战赛系列数据集 AI-Ready Wikipedia | 千方医数集

医学影像放射学AI竞赛数据集多模态

RSNA Series — RSNA 年度 AI 挑战赛系列数据集 AI-Ready Wikipedia | 千方医数集

12 项挑战11 年编年约 360 万张影像400+ 名放射科专家累计 10 万+ 名患者

Radiological Society of North America 43

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