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医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

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图像分类目标检测语义分割

共 230 个数据集

化学信息学药物发现虚拟筛选分子机器学习基准数据集

LIT-PCBA — 真实实验来源虚拟筛选基准 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

15 个靶标集约 41.5 万化合物PubChem 试验来源AVE 去偏划分免费下载约 41.5 万个化合物（7,844 活性 + 407,381 非活性，论文口径）

15 靶标 41.5 万化合物：PubChem 真实高通量筛选实验衍生的无偏虚拟筛选基准

Laboratoire d'Innovation Thérapeutique, UMR 7200 CNRS–Université de Strasbourg url: http://drugdesign.unistra.fr/LIT-PCBA/ 9

医学影像内窥镜息肉分割计算机视觉

ETIS-Larib — 息肉分割最难公开基准 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

196 张 1225×966 PNG 图像196 张 BMP 像素级 mask44 个息肉34 个序列注册后开放下载患者数未公开（34 个视频序列、44 个独特息肉）

196 张高分辨率结肠镜图像、像素级息肉 mask 的困难样本分割基准

Lariboisière 医院（AP-HP, 巴黎）与 ETIS 实验室（ENSEA, CY Cergy-Pontoise 大学） url: https://polyp.grand-challenge.org/ETISLarib/ 5

心电图时序信号远程医疗心律失常

CODE-15% — 巴西远程医疗 12 导联心电图 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

345,779 条 12 导联 ECG233,770 名患者46.3 GB HDF5CC BY 4.0 开放233,770 名患者

34.5 万条 12 导联 ECG · 23.4 万患者 · 六类异常二元标签

Telehealth Network of Minas Gerais (UFMG) url: https://zenodo.org/records/4916206 9

皮肤病医学影像多模态临床数据开放数据

PAD-UFES-20 — 智能手机皮肤癌筛查数据集 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

2,298 张临床照片1,373 名患者6 类诊断3.35 GB PNG+CSVCC BY 4.0 开放1,373 名患者

2,298 张智能手机临床照片 + 1,373 名患者临床特征，6 类皮肤病变多模态基准

Universidade Federal do Espírito Santo (UFES) — LABCIN & PAD url: https://data.mendeley.com/datasets/zr7vgbcyr2 5

临床文本机器阅读理解问答病例报告UMLS 标注

CliCR — 临床病例报告阅读理解 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

104,919 个查询11,846 份病例报告JSON（traindevtest 1.0）邮件申请研究用途约 1.2 万名患者（对应 11,846 份已发表病例报告）

10.5 万完形填空查询 · 1.2 万份病例报告 · 人机 F1 差距 20 点的临床 MRC 基准

安特卫普大学 CLiPS 研究中心（University of Antwerp） url: https://github.com/clips/clicr 6

医学影像数字病理结直肠癌H&E 图像分类基础模型评测

NCT-CRC-HE-100K — 结直肠癌组织学图像分类 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

约 24.2 GB TIFF（3 个 ZIP）100,000 张训练 patch7,180 张验证 patch9 类组织标签136 名患者（86 张源切片 + 50 名验证患者）

10 万张结直肠癌 H&E patch 的 9 类组织分类金标准

Zenodo — National Center for Tumor Diseases (NCT) Heidelberg / University Medical Center Mannheim url: https://zenodo.org/records/1214456 7

医学影像胸部X光肺结节计算机辅助诊断

JSRT — 胸部X光肺结节检测经典基准 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

247 张 PA 胸片2048×2048 像素 12-bit约 2.1 GB 原始数据免费学术使用247 例检查（每例 1 张 PA 胸片）

247 张 PA 胸片、12-bit 高灰阶、五档难度的经典肺结节检测公开基准

Japanese Society of Radiological Technology（日本放射技术学会） url: http://db.jsrt.or.jp/eng.php 6

重症监护电子健康记录COVID-19多院区MIMIC 兼容

NWICU — 芝加哥多院区 COVID 时代 ICU EHR AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

约 597MB CSV.GZ25,342 名患者28,566 次 ICU 住院12 张表凭证化申请25,342 名患者

25,342 名患者、28,566 次 ICU 住院的芝加哥多院区 ICU EHR 数据库

MIT Laboratory for Computational Physiology × Northwestern University（PhysioNet 托管） url: https://physionet.org/content/nwicu-northwestern-icu/ 7

流行病学队列老年医学公共卫生调查数据纵向研究

CHARLS — 中国老龄健康与养老全国追踪队列 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

基线 17,708 人2018 追访 19,816 人5 轮追踪 2011-2020,28 省 150 县 450 村社区Stata .dta 免费实名申请静脉血 9 类生物标志物约 1.9 万名 45 岁以上受访者(基线 17,708;2018 追访 19,816)

覆盖 28 省 150 县 450 村、1.9 万 45 岁以上受访者的 5 轮全国老龄追踪队列

北京大学国家发展研究院 CHARLS 项目组 url: https://charls.pku.edu.cn/ 9

心电信号心律失常PhysioNet公开基准时序数据

Chapman-Shaoxing — 12 导联心律失常 ECG AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

约 2.8 GB（figshare 六文件扩展版 5.1 GB）10,646 例 12 导联 ECG（扩展版 45,152 例）500 Hz × 10 秒 × 12 导联10,646 名患者（扩展版 45,152 名）

10,646 例 12 导联静息 ECG 的心律失常分类公开基准

Chapman University & Shaoxing People's Hospital（PhysioNet 托管） url: https://physionet.org/content/ecg-arrhythmia/1.0.0/ 7

医学影像内镜图像息肉分割公开基准计算机视觉

CVC-ColonDB — 结肠镜息肉分割经典基准 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

380 帧结肠镜图像15 段检查序列574×500 像素像素级二值息肉 mask原始版含 1,706 个文件（4 组）研究用途免费获取15 例结肠镜检查（各文献记载 13–15 例不一）

380 帧专家标注结肠镜息肉分割图像，源自 15 段检查序列的单中心经典基准

Computer Vision Center, Universitat Autònoma de Barcelona（CVC-UAB） url: http://mv.cvc.uab.es/projects/colon-qa/cvc-colondb 8

皮肤影像3D 全身摄影癌症筛查类别不平衡

SLICE-3D — ISIC 2024 3D 全身照相皮损数据集 | 千方病案医数集

401,059 张皮损裁剪图1,042 名患者恶性率仅 0.1%约 1.2GB 图像CC-BY-NCCC-BY 双许可Kaggle 8 万美元竞赛1,042 名患者 · 40.1 万张皮损图

全球最大 3D-TBP 皮肤癌筛查数据集 · 40.1 万皮损裁剪 · 约 1:1,000 极端不平衡

国际皮肤影像协作组（ISIC）& 纪念斯隆凯特琳癌症中心（MSK） url: https://challenge2024.isic-archive.com/ 7

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