即取即用的 AI-Ready 医疗数据集库

千方医数集致力于为医疗 AI 研究人员找到合适的数据集，让你的 AI 感知模型能够更快地学习、更准确地运行，并无缝适应现实世界的环境。

医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

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图像分类目标检测语义分割

共 1638 个数据集

基因组学与多组学医疗NLP

HGNC 基因命名数据库

44,476 已批准符号19,294 蛋白编码稳定 HGNC ID15+ 外部资源映射完全开放不适用（基因命名标准资源；无患者数据）

44,476 个已批准符号 · 19,294 蛋白编码基因 · 稳定 HGNC ID：人类基因命名的全球权威标准

https://www.genenames.org/ 67

药物发现与化学药物-靶点相互作用化学信息学虚拟筛选

ChEMBL 生物活性数据库

280 万化合物2,400 万活性17,803 靶点CC-BY-SA 开放pChEMBL 标准化不适用（化合物活性数据库；无患者数据）

280 万化合物 · 2,400 万活性 · 17,803 靶点：药物发现的活性数据公共底座

https://www.ebi.ac.uk/chembl/ 114

药物发现与化学医学影像化学信息学虚拟筛选基因组学与多组学

JUMP Cell Painting — 化学与基因扰动形态学画像数据集

136,000 种扰动超 15 亿细胞 profile12 数据生成中心5 通道 Cell Painting超 250 TB体外 U2OS 细胞系（非患者数据）；pilot 含 A549

136,000 种化学与遗传扰动 · 12 中心 · 5 通道 Cell Painting · 超 15 亿细胞的世界最大公共药物发现影像资源

https://registry.opendata.aws/cellpainting-gallery/ 68

多模态医学影像医学问答与基准医疗NLP

GMAI-MMBench — 通用医疗多模态评测基准

284 源数据集约 26K 选择题38 模态 18 科室4 级感知粒度NeurIPS 2024 D&B题目源自 284 个脱敏医学数据集（公开 268 + 医院合作 16）

284 源数据集 · 38 模态 · 26K 选择题 · 4 级感知粒度的 LVLM 医疗能力标尺

https://huggingface.co/datasets/OpenGVLab/GMAI-MMBench 45

医学影像病理图像图像分类肿瘤学

PANDA — 前列腺癌 Gleason 分级挑战数据集

10,616 张穿刺活检 WSIISUP 0-5 + 像素级 mask双中心 383 GBCC BY-NC-SA 4.0约 1.1 万例前列腺穿刺活检（回顾性、脱敏）；slide 级分析

10,616 张穿刺活检 WSI、ISUP 0-5 六级、双中心像素级 mask 的病理 AI 基准

https://www.kaggle.com/competitions/prostate-cancer-grade-assessment 65

医疗NLP知识图谱临床文本命名实体识别

UMLS — 统一医学语言系统

344 万概念1370 万名称199 源词表集成125 语义类型 + 54 关系半年发布 · UMLS License 免费签署术语集成体系本身不含患者数据；服务于全球 EHR 与文献系统的概念归一

344 万概念、1370 万名称、199 源词表的跨词表集成枢纽与 NLP 基础设施

https://www.nlm.nih.gov/research/umls/ 66

医疗NLP临床文本公共卫生与流行病学真实世界数据评测基准

ClinicalTrials.gov — 临床试验注册与结果数据库

601,897 项注册研究80,028 项已发布结果API v2 + AACT PostgreSQL 40+ 表226 国家与地区 · 每日刷新注册记录覆盖受试者规模不一（单项研究 1 人至 30 万人），全库累计入组受试者逾 6 千万人次

60 万+ 项注册研究的全球最大临床试验注册库，AACT 40+ 表结构化镜像与 API v2 全量获取

https://clinicaltrials.gov/ ；AACT：https://aact.ctti-clinicaltrials.org/ 102

医学影像CTMRIPET肿瘤学

影像数据公地 IDC — NCI 云端肿瘤影像公地

99.27 TB DICOM176 个集合85,682 例病例约 103 万图像序列免注册开放获取85,682 例病例（截至 2026-04，Data Release 24.0）

NCI 云端 DICOM 肿瘤影像库 · 176 集合 99.27 TB · 8.5 万余例病例

美国国家癌症研究所（NCI） url: https://portal.imaging.datacommons.cancer.gov/ 65

医学影像乳腺影像X光影像图像分类乳腺癌

CMMD — 中国乳腺钼靶良恶性分类

5,202 幅 DICOM 图像1,775 名患者22.86 GB 影像CC BY 4.0 开放获取活检病理证实标注1,775 名患者

1,775 名患者 5,202 幅钼靶图像，活检证实良恶性与分子亚型标注

The Cancer Imaging Archive（TCIA） url: https://www.cancerimagingarchive.net/collection/cmmd/ 54

基因组学与多组学单细胞基因组学医学影像病理图像肿瘤学

HuBMAP — 人体生物分子图谱计划

5,032 个数据集（2025-10）310 位捐献者22 种数据类型27 个器官大类CC BY 4.0 开放许可AnnDataOME-TIFF310 位捐献者（健康成人组织）

NIH 单细胞分辨率健康人体空间图谱 · 5,032 个数据集 · 310 位捐献者 · 27 个器官大类

NIH HuBMAP Consortium url: https://portal.hubmapconsortium.org/ 69

医学影像图像分类儿科

FETAL_PLANES_DB — 胎儿标准切面分类基准

约 2.1GB ZIP12,400 张超声切面1,792 名患者CC BY 4.0 开放获取6 类切面1,792 名孕妇

12,400 张二维超声标准切面 · 1,792 名患者 · 首个比肩人类技师的切面分类基准

BCNatal（巴塞罗那母胎与新生儿医学中心） url: https://zenodo.org/records/3904280 50

医学影像公共卫生与流行病学病理图像

NIH Malaria — 疟疾血涂片细胞图像

["27,558 张细胞图像""200 例患者""337 MB""PNG 单细胞裁剪""免费开放获取"]200 例患者（150 例恶性疟感染 + 50 例未感染）

2.7 万张薄血涂片单细胞图像 · 200 例患者 · 疟疾自动诊断奠基基准

name: "U.S. National Library of Medicine, Lister Hill National Center for Biomedical Communications (LHNCBC)" url: "https://lhncbc.nlm.nih.gov/LHC-research/LHC-projects/image-processing/malaria-datasheet.html" 60

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