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医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

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图像分类目标检测语义分割

共 1602 个数据集

医学影像病理图像乳腺影像图像分类肿瘤学乳腺癌

BACH — 乳腺癌组织学图像挑战赛数据集

约 13.4 GB（Zenodo 两包）500 张显微图像 + 40 张 WSI四分类完全均衡像素级 WSI 标注CC BY-NC-NDZenodo 免费下载500 张显微图像 + 40 张全切片

ICIAR 2018 乳腺癌组织学挑战赛 · 500 张 H&E 显微图像 + 40 张 WSI

INESC TEC & i3S（IPATIMUP/INEB），葡萄牙波尔图大学 url: https://iciar2018-challenge.grand-challenge.org/ 126

医学问答与基准医疗NLP医学考试医学问答

HeadQA — 西班牙医学考试问答数据集

6,765 道多选题西英双语约 159MB（含图像）MIT 许可含图像题免费获取6,765 道考题

6,765 道西班牙医疗国考真题 · 西英双语 · 多语言 LLM 基准

拉科鲁尼亚大学 CITIC（Vilares & Gómez-Rodríguez） url: http://aghie.github.io/head-qa 66

医学影像公共卫生与流行病学COVID-19X光影像

MIDRC-RICORD — RSNA 新冠开放影像数据库

约 32.6 GB DICOM 影像588 例患者240 例胸部 CT998 张新冠阳性胸片MD.ai JSON 专家标注CC BY-NC 4.0588 例患者（1A 110 例 + 1B 117 例 + 1C 361 例）

RSNA 与 STR 多国专家标注新冠胸片与 CT 开放库，1,238 项检查

RSNA / MIDRC 联盟（NIBIB 资助），TCIA 托管 url: https://www.rsna.org/covid-19/covid-19-ricord 70

医学影像眼科影像医学图像分割皮肤影像骨骼肌肉影像

CHASE_DB1 — 儿童视网膜血管分割基准

28 幅儿童眼底图像56 幅人工血管掩膜999×960 JPGPNG约 2.4 MB ZIPCC BY 4.0 开放获取14 名儿童（双眼 28 幅图像）

28 幅儿童眼底图像 × 双观察者标注的视网膜血管分割参考基准

Kingston University London 与 St George's, University of London url: https://researchinnovation.kingston.ac.uk/en/datasets/chasedb1-retinal-vessel-reference-dataset-4 73

基因组学与多组学变异与注释罕见病

ClinVar — 全球最大临床变异注释数据库

455.7 万唯一变异695.5 万提交记录3,512 家提交者0-4 星评审体系月度发布完全免费开放455 万个变异记录

变异-表型解读的全球事实标准 · 455 万唯一变异 · 3,512 家提交者

美国国家生物技术信息中心（NCBI）/ 美国国立卫生研究院（NIH） url: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/clinvar/ 86

医学影像眼科影像图像分类

RFMiD — 视网膜多病种眼底图像数据集

3,200 张眼底彩照45+ 病种多标签CC-BY 4.0竞赛托管获取3,200 张眼底图像（图像级，非独立患者计数）

3,200 张眼底彩照 · 45+ 病种多标签标注 · 罕见病长尾筛选

RIADD Grand Challenge (Grand Challenge in Biomedical Image Analysis) url: https://riadd.grand-challenge.org/ 80

医学影像手术视频眼科影像

CATARACTS — 白内障手术视频基准

50 台白内障手术117.8 GB Full HD 视频21 类器械逐帧标注18+1 类手术阶段标注免费开放获取50 名白内障患者（38 女 / 12 男，平均 61 岁）

50 台白内障手术、9 小时 Full HD 显微镜视频、21 类器械与 18 类手术阶段逐帧标注

布雷斯特大学医院（CHU de Brest）× LaTIM / Inserm UMR 1101 url: https://ieee-dataport.org/open-access/cataracts 63

医学影像病理图像医学图像分割结直肠癌肿瘤学

CRAG — 结直肠腺癌腺体实例分割基准

213 张 H&E 病理图像38 位患者全切片实例级腺体掩码约 2.2 GB PNG免费研究获取（须引用）38 位患者（38 张 WSI 每例 1 张，年龄与性别未公布）

213 张 H&E 病理图像、38 位患者，GlaS 姊妹腺体实例分割基准

University of Warwick TIA Centre（Colorectal Adenocarcinoma Gland Dataset） url: https://warwick.ac.uk/fac/cross_fac/tia/data/mildnet/ 67

图像分类病理图像结直肠癌

MHIST — 结直肠息肉 H&E 组织学二分类

3,152 张 H&E patch224×224 PNGHP vs SSA 二分类约 354 MB免费申请获取未公布（3,152 张 patch 源自 328 张 WSI，患者级信息已脱敏剥离）

3,152 张 7 位病理学家多数投票标注的结直肠息肉 H&E 二分类基准

Dartmouth College BMIRDS & Dartmouth-Hitchcock Medical Center url: https://bmirds.github.io/MHIST/ 52

生理信号时序数据睡眠信号脑电信号

MASS — 蒙特利尔睡眠研究档案

200 例整夜 PSG256 Hz 采样SS1-SS5 五子集EDF+ 格式需伦理批准申请AASMR&K 双分期手册200 名受试者（97 男 / 103 女）

200 例实验室 PSG 睡眠分期基准 · 5 子集 · 256 Hz · 引用 443+

Université de Montréal / CÉAMS (Centre d'études avancées en médecine du sommeil) url: https://borealisdata.ca/dataverse/MASS 82

公共卫生与流行病学调查数据公共卫生统计

BRFSS — 全球最大健康行为电话调查

433,323 条访谈（2023 年）345 个变量（XPT）ASCIIXPT 免费Public Domain433,323 名成人受访者（2023 年，历年 40 万+/年）

CDC 主持、每年 40 万+ 成人访谈、覆盖美国 50 州的健康行为监测金矿

U.S. Centers for Disease Control and Prevention（CDC） url: https://www.cdc.gov/brfss/annual_data/annual_data.htm 51

基因组学与多组学药物发现与化学化学信息学蛋白质组学评测基准

PLINDER — 44.9 万蛋白-配体系统评测资源

449,383 个蛋白-配体系统750+ 维注释系统约 300GB 压缩（不含 scores）免费开放下载非患者数据，结构生物学数据集

449,383 个蛋白-配体系统，750+ 维注释与防泄漏划分

PLINDER 项目组（巴塞尔大学 & SIB、VantAI/Proxima、NVIDIA、MIT CSAIL） url: https://www.plinder.sh 76

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