即取即用的 AI-Ready 医疗数据集库

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医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

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图像分类目标检测语义分割

共 1598 个数据集

医学影像医学问答与基准内窥镜影像医学图像分割手术视频评测基准

PolypGen 多中心息肉检测与分割数据集

8,037 帧结肠镜图像3,447 个像素级息肉实例300+ 名患者5 国 6 中心CC BY 4.0 免费获取300+ 名患者（6 中心每中心至少 50 名，官方未公布确切总数）

横跨 5 国 6 中心的 8,037 帧结肠镜息肉数据集，专为跨中心泛化评估而建

University of Oxford / SimulaMet / EndoCV2021 Consortium（Synapse 托管） url: https://www.synapse.org/#!Synapse:syn26376615/wiki/613312 84

医学影像医学问答与基准医学图像分割眼科影像评测基准

DRIVE — 视网膜血管分割金标准

40 张 768×584 眼底彩照训练测试各 20 张双标注者像素级血管掩码约 40 MB ZIP注册后免费获取40 张图像（源自 400 名糖尿病受试者筛查人群）

40 张眼底彩照双标注血管分割基准，25 年被引近 4,000 次

Image Sciences Institute, University Medical Center Utrecht url: https://drive.grand-challenge.org/ 86

医学影像医学图像分割图像分类病理图像眼科影像

PALM — 病理性近视眼底多任务分割

1,200 张眼底彩照400/400/400 官方划分4 项任务多标签研究用途注册获取720 名受试者 / 1,200 只左眼眼底照

1,200 张眼底照 · 病理性近视分类＋病灶/视盘分割＋中央凹定位

iChallenge / Zhongshan Ophthalmic Center & Baidu（IEEE DataPort / FigShare 存档） url: https://palm.grand-challenge.org 87

医学影像挑战赛数据集眼科影像糖尿病视网膜病变

DeepDRiD — 眼底图像质量评估与DR分级挑战赛

2,000 张常规眼底图 + 256 张超广角500 例 + 128 例患者四维图像质量标注CC-BY-SA 免费获取628 例患者（500 例常规 + 128 例超广角）

ISBI 2020 眼底图像质量评估 + DR 分级双任务挑战数据集（2,000 张常规眼底图 / 500 例）

上海交通大学附属第六人民医院 & 上海交通大学 url: https://github.com/deepdrdoc/DeepDRiD 66

基因组学与多组学测序数据转录组

FANTOM5 — 哺乳动物转录调控元件图谱

2,832 个 CAGE 样本201,802 个人类 CAGE 峰65,423 个增强子CC BY 4.0 开放获取核心表达表 4.1 GB2,832 个样本（1,816 人 + 1,016 小鼠，phase 1+2）

975 人类样本启动子图谱 + 43,011 增强子，CAGE 单碱基分辨率转录调控参考

FANTOM Consortium / RIKEN Center for Integrative Medical Sciences url: https://fantom.gsc.riken.jp/5/ 70

医学影像CT医学图像分割肿瘤学肺癌

LCTSC — 肺癌放疗 CT 正常器官勾画挑战

60 例胸部放疗 CT5 类正常器官勾画5.15GB DICOMCC BY 3.0 公开60 例患者

60 例胸部放疗 CT + 5 类正常器官勾画，TCIA 公开基准

The Cancer Imaging Archive (TCIA) url: https://www.cancerimagingarchive.net/collection/lctsc/ 81

生理信号电子健康记录重症监护临床电子病历

MC-MED — 斯坦福急诊多模态监护基准

118,385 次急诊就诊70,545 名患者83,623 次就诊含波形7 张主表约 5,800 万行CSV + WFDB 格式7.05 万名患者 / 11.84 万次急诊就诊

118,385 次急诊就诊的 EHR、生命体征与波形多模态基准

斯坦福大学医学院（Stanford Health Care / STARR）与 Nightingale Open Science、PhysioNet 联合托管 url: https://physionet.org/content/mc-med/1.0.1/ 56

生理信号电子健康记录可穿戴传感心电信号重症监护

PulseDB — 无袖带血压估计基准波形库

约 5,245,454 段 10 秒波形5,361 名受试者约 213.4 GB 压缩包MAT v7.3 格式官方 Calib 与 CalibFree 划分5,361 名受试者（MIMIC-III 2,423 + VitalDB 2,938）

5,361 名受试者、524 万段 PPG/ECG/ABP 配对波形的血压估计基准库

Rutgers University Integrated Systems and NeuroImaging Laboratory（PulseDB 官方仓库） url: https://github.com/pulselabteam/PulseDB 88

医学影像病理图像乳腺影像图像分类肿瘤学乳腺癌

BACH — 乳腺癌组织学图像挑战赛数据集

约 13.4 GB（Zenodo 两包）500 张显微图像 + 40 张 WSI四分类完全均衡像素级 WSI 标注CC BY-NC-NDZenodo 免费下载500 张显微图像 + 40 张全切片

ICIAR 2018 乳腺癌组织学挑战赛 · 500 张 H&E 显微图像 + 40 张 WSI

INESC TEC & i3S（IPATIMUP/INEB），葡萄牙波尔图大学 url: https://iciar2018-challenge.grand-challenge.org/ 126

医学问答与基准医疗NLP医学考试医学问答

HeadQA — 西班牙医学考试问答数据集

6,765 道多选题西英双语约 159MB（含图像）MIT 许可含图像题免费获取6,765 道考题

6,765 道西班牙医疗国考真题 · 西英双语 · 多语言 LLM 基准

拉科鲁尼亚大学 CITIC（Vilares & Gómez-Rodríguez） url: http://aghie.github.io/head-qa 66

医学影像公共卫生与流行病学COVID-19X光影像

MIDRC-RICORD — RSNA 新冠开放影像数据库

约 32.6 GB DICOM 影像588 例患者240 例胸部 CT998 张新冠阳性胸片MD.ai JSON 专家标注CC BY-NC 4.0588 例患者（1A 110 例 + 1B 117 例 + 1C 361 例）

RSNA 与 STR 多国专家标注新冠胸片与 CT 开放库，1,238 项检查

RSNA / MIDRC 联盟（NIBIB 资助），TCIA 托管 url: https://www.rsna.org/covid-19/covid-19-ricord 70

医学影像眼科影像医学图像分割皮肤影像骨骼肌肉影像

CHASE_DB1 — 儿童视网膜血管分割基准

28 幅儿童眼底图像56 幅人工血管掩膜999×960 JPGPNG约 2.4 MB ZIPCC BY 4.0 开放获取14 名儿童（双眼 28 幅图像）

28 幅儿童眼底图像 × 双观察者标注的视网膜血管分割参考基准

Kingston University London 与 St George's, University of London url: https://researchinnovation.kingston.ac.uk/en/datasets/chasedb1-retinal-vessel-reference-dataset-4 73

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