即取即用的 AI-Ready 医疗数据集库

千方医数集致力于为医疗 AI 研究人员找到合适的数据集，让你的 AI 感知模型能够更快地学习、更准确地运行，并无缝适应现实世界的环境。

医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

按任务类型浏览

图像分类目标检测语义分割

共 1578 个数据集

医学影像公共卫生与流行病学脑影像

ENIGMA — 国际多中心脑影像遗传联盟

50 个活跃工作组43 国 200+ 机构GWAS 汇总 51,665 人26 种脑疾病协议公开共享汇总统计申请获取代表性 GWAS 汇总 30,717-51,665 名受试者

50 个工作组、43 国 200+ 机构的分布式脑影像遗传荟萃分析联盟

ENIGMA Consortium（USC Stevens 神经影像与信息学研究所） url: http://enigma.ini.usc.edu/ 78

医学影像目标检测CT

DeepLesion — 大规模CT病灶检测数据集

约220GB（56个zip）32,735个病灶4,427名患者免费无限制使用4,427名患者

NIH 临床中心影像生物标志物与计算机辅助诊断实验室 198

药物发现与化学化学信息学虚拟筛选

ZINC — 全球最大可购买化合物虚拟筛选数据库

375亿化合物 · 150+供应商化合物

375亿化合物 · 150+供应商 · 超大规模对接 · UCSF · 免费使用

是由加州大学旧金山分校（UCSF）制药化学系 Irwin & Shoichet 实验室开发和维护的免费化合物数据库 150

医学影像多模态手术视频眼科影像

Cataract-101 — 白内障手术视频阶段数据集

101 台手术视频10 阶段标注约 8.3 GB 压缩包CC BY-NC 4.0 免费下载720×540 显微视频101 台白内障手术（去标识视频）

101 台手术显微视频 · 10 阶段标注 · 4 名外科医生双经验级

Multimedia Systems Group, Institute of Information Technology (ITEC), Alpen-Adria-Universität Klagenfurt url: https://ftp.itec.aau.at/datasets/ovid/cat-101 61

药物发现与化学化学信息学药物安全虚拟筛选

DrugBank — 药物与药物靶点知识库

约 1.2 万药物条目约 141 万药物-药物相互作用约 4900 靶点药物知识库，非患者数据集

1.2万药物 · 140万药物相互作用 · 4900靶点 · 11监管区 · 20年持续运营

University of Alberta & OMx Personal Health Analytics | https://go.drugbank.com 99

医学影像基因组学与多组学影像-文本对齐

MultiMedBench — 谷歌医学多任务多模态基准

14 项任务12 个数据集超 100 万样本7 种数据模态许可证混合（部分需 CITI 认证）无统一打包下载Google Research 发布超 100 万样本（12 个去标识化数据集）

Med-PaLM M 配套评测基准 · 14 任务 12 数据集 7 模态 · 超 100 万样本

Google Research & Google DeepMind url: https://research.google/pubs/towards-generalist-biomedical-ai/ 97

医学影像生理信号手术视频内窥镜影像步态与运动

CholecT50 — 腹腔镜手术动作三元组数据集

50 段手术视频约 100,900 标注帧151,000 三元组实例约 13,000 边界框CC BY-NC-SA 4.0 申请获取50 段腹腔镜胆囊切除术视频（约 100,900 个标注帧）

50 段腹腔镜胆囊切除视频、约 10.1 万帧、100 类器械-动词-目标三元组

CAMMA 研究组（ICube, University of Strasbourg / IHU Strasbourg） url: https://camma.u-strasbg.fr/datasets/ 92

药物发现与化学分子对接化学信息学

PDBbind — 蛋白-配体结合亲和力数据库

约 4GB（v2020 免费版）23,496 个复合物KdKiIC50 实验值注册免费获取CASF 金标准基准每年更新（v2021+ 商业版）2.3 万+ 复合物

蛋白-配体亲和力金标准数据库 · 2.3 万复合物 · CASF 基准发源地

复旦大学药学院王任小团队（PDBbind-CN / PDBbind+） url: http://www.pdbbind.org.cn/ 197

电子健康记录基因组学与多组学GWAS医疗登记队列研究

FinnGen — 芬兰全国基因组与健康队列

519,972 名参与者21,311,644 个插补变异2,755 个公开疾病终点汇总统计免费下载519,972 名参与者（R13 总基因型个体，截至 2026-09）

52 万芬兰生物银行个体的基因组-全国登记联动队列 · 2,755 个疾病终点 GWAS

FinnGen（芬兰生物银行公私合作伙伴项目，THL / 赫尔辛基大学 FIMM / Broad Institute） url: https://www.finngen.fi/en 81

药物发现与化学医学影像分子性质预测化学信息学病理图像肿瘤学

NCI-60 — 60 系肿瘤药筛金标准

60 条人类肿瘤细胞系10 万+ 化合物筛选史约 511 MB 压缩下载包GI50TGILC50 五剂量终点免费开放下载60 条细胞系（非患者数据，9 大癌种组织来源）

60 个人类肿瘤细胞系 × 10 万+ 化合物的 36 年抗癌药筛全景

美国国家癌症研究所发展治疗学计划（NCI/DTP） url: https://dctd.cancer.gov/drug-discovery-development/assays/high-throughput-screening-services/nci60 57

基因组学与多组学肿瘤学蛋白质组学

CPTAC — 癌症蛋白质基因组多组学

约 70 TB（PDC 全库）10 癌种 1,073 例肿瘤6,644 名受试者开放+受控申请获取6,644 名受试者（dbGaP CPTAC-3 v17）

10 大癌种 1,073 例肿瘤的蛋白组×基因组×影像配对多组学公共数据

美国国家癌症研究所（NCI）CPTAC 联盟 / 蛋白质组数据共享平台 PDC url: https://pdc.cancer.gov 90

电子健康记录重症监护临床电子病历

MIMIC-BR — 巴西 ICU 匿名化 OMOP 临床数据库

约 2.88 万名成人患者11 张 OMOP-CDM 核心表约 408 万行结构化记录CSV + ATHENA 词汇表免费申请审核获取2.88 万名成人患者（28,799）

2.88 万名成人患者、3.42 万次住院的巴西首个公开 ICU 匿名化 EHR 数据库

Hospital Israelita Albert Einstein（PhysioNet 托管） url: https://physionet.org/content/mimic-br/1.0.1/ 103

定制数据集服务

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