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医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

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图像分类目标检测语义分割

共 1479 个数据集

医学影像公共卫生与流行病学X光影像图像分类评测基准COVID-19

“COVIDx CXR — 全球最大开放新冠胸片基准”

“30,386 张胸片”“16,648+ 名患者”“51+ 国多源聚合”“PNGJPEG 图像”“Kaggle 免费下载”“约 1.7 万名患者（训练 16,648 + 测试 378）”

“30,386 张胸片 / 1.7 万患者 / 51+ 国多源新冠 CXR 开放基准”

“滑铁卢大学 Vision and Image Processing 研究组 / DarwinAI Corp.（加拿大）” url: https://github.com/lindawangg/COVID-Net 49

基因组学与多组学儿科肿瘤学

TARGET — 儿童肿瘤基因组项目

约 6,363 名知情受试者WGSWESRNA-seqmiRNA-seq受控+开放获取dbGaP 申请肿瘤-正常配对约 6,363 名知情同意受试者（dbGaP v26）

NCI 儿科癌症多组学队列，约 6,000+ 例 WES/WGS/RNA-seq

National Cancer Institute — Center for Cancer Genomics url: https://www.cancer.gov/ccg/research/genome-sequencing/target 50

生理信号可穿戴传感步态与运动疾病监测

PAMAP2 — 穿戴式活动识别经典数据集

3,850,505 个样本9 名受试者18 种活动约 656 MB .dat100 Hz IMU + 9 Hz 心率9 名健康成人（8 男 1 女）

9 名受试者 / 18 种身体活动 · 3 IMU + 心率 · UCI 经典活动识别基准

UCI Machine Learning Repository / 达姆施塔特工业大学（TU Darmstadt, PAMAP 项目） url: https://archive.ics.uci.edu/ml/datasets/pamap2+physical+activity+monitoring 91

电子健康记录药物发现与化学医保理赔药物安全队列研究

NHIRD — 台湾健保理赔全人群数据库

覆盖约 2,300 万参保人单项目≤10%人口可申请卫生福利资料科学中心审批制ICD-9-CMICD-10-CMLHID 1 百万抽样子集覆盖约 2,300 万中国台湾省参保人

覆盖 2,300 万中国台湾省参保人理赔档案，可串联 70+ 健康数据库

中国台湾卫生福利部统计处 / 卫生福利资料科学中心 url: https://dep.mohw.gov.tw/DOS/cp-5119-59201-113.html 83

药物发现与化学虚拟筛选药物-靶点相互作用

DrugComb — 药物联用筛选平台

74 万+ 组合实验4,268 种药物288 个癌细胞系CSV 免费获取CC BY-NC 许可非临床患者数据：2320 个细胞系样本背景（组合数据中 288 个细胞系）

74 万+ 药物组合实验，芬兰赫尔辛基大学开源药物联用数据仓库

University of Helsinki, Research Program in Systems Oncology (Jing Tang lab) url: https://drugcomb.org 141

医疗NLP电子健康记录临床文本临床电子病历生物医学文献评测基准

MEDIQA — 医患对话病历摘要评测数据集

1,701 段模拟医患对话20 类病历章节标签207 段完整就诊对话（ACI-BENCH）CC BY 4.0 免费获取CSV 文本格式0 名真实患者（模拟对话构建，不含 PHI）

1,701 段医患对话与结构化病历摘要，MEDIQA 系列官方评测数据

美国国家医学图书馆（NLM/NIH）与 Microsoft 研究团队（MEDIQA 系列组织方） url: https://sites.google.com/view/mediqa-shared-tasks 91

药物发现与化学多模态化学信息学评测基准

TDC — 治疗科学机器学习基准平台

66 个 AI-ready 数据集22 个学习任务29 个公开排行榜pip 一键安装3 行代码加载代码 MIT 许可无患者数据 · 分子/蛋白实体级

66 个数据集 · 22 个学习任务 · 药物发现全管线基准

Harvard Medical School Zitnik Lab & MIT & Stanford 等 url: https://tdcommons.ai 90

多模态医学影像视觉问答

VQA-Med — 医学影像视觉问答年度评测

跨 7 个年度版本累计约 3.5 万 QA 对放射+内镜多模态竞赛注册后获取逐年评测协议完整匿名医学影像问答对（非患者级，约 3.5 万 QA 对/7 年版）

ImageCLEF 年度医学 VQA 挑战系列：2018-2024，多模态影像 + QA 对评测基准

ImageCLEF / CLEF url: https://www.imageclef.org/ 77

医学影像CT医学图像分割挑战赛数据集肿瘤学

KiTS23 — 肾脏肿瘤分割挑战赛数据集（MICCAI 2023）

599 例增强腹部 CT489 训练110 测试kidneytumorcyst 三类体素标注NIfTI .nii.gz 格式期相异构（皮髓质期为主+肾实质期新增）临床元数据随仓库更新599 例 CT 扫描（489 例训练公开标注 + 110 例测试官方持有标注）

599 例双期相 CT 肾脏/肿瘤/囊肿三类分割，Sørensen-Dice + Surface Dice 双指标 rank-then-aggregate 官方排名，MICCAI 2023 挑战赛

明尼苏达大学机器人研究所（MnRI）、Helmholtz Imaging（DKFZ）与克利夫兰诊所联合（M Health Fairview 2010-2022 回顾性队列；通讯作者 Nicholas Heller） url: https://kits23.kits-challenge.org/ 89

医学影像手术视频内窥镜影像医学图像分割

CholecSeg8k — 腹腔镜胆囊切除手术场景分割

8,080 帧视频帧13 类像素级掩码约 3GB PNG854×480 分辨率免费下载17 段手术视频片段（患者数未随数据集公开）

8,080 帧像素级标注的腹腔镜胆囊切除术语义分割数据集

台湾大学 CholecSeg8k 作者团队（底层数据：法国 CAMMA 组 Cholec80） url: https://www.kaggle.com/datasets/newslab/cholecseg8k 75

电子健康记录公共卫生与流行病学儿科脑影像队列研究

ABCD — 青少年脑发育纵向队列

约 100 TB 多模态11,878 名儿童21 个采集点随访至成年需 NDADAC 申请1.2 万名儿童（11,878 基线）

迄今最大青少年脑发育多模态纵向队列 · 11,878 名 · 随访至成年

Adolescent Brain Cognitive Development Consortium / NIMH Data Archive url: https://nda.nih.gov/abcd 79

生理信号电子健康记录时序数据重症监护

SICdb — 欧洲分钟级重症监护数据库

约 10GB 压缩分钟级解压约 240GB27,386 次 ICU 入院分钟级床旁信号GDPR 合规需 CITI 培训 + 逐案审批2.16 万名患者

全球粒度最高的公开 ICU 数据集之一 · 2.7 万次入院 · 分钟级信号

帕拉塞尔苏斯医科大学萨尔茨堡分校 & 萨尔茨堡大学医院（SALK） url: https://physionet.org/content/sicdb/ 99

定制数据集服务

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