即取即用的 AI-Ready 医疗数据集库

千方医数集致力于为医疗 AI 研究人员找到合适的数据集，让你的 AI 感知模型能够更快地学习、更准确地运行，并无缝适应现实世界的环境。

医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

按任务类型浏览

图像分类目标检测语义分割

共 1414 个数据集

药物发现与化学虚拟筛选肿瘤学

NCI-ALMANAC — 抗癌药联用筛选数据库

104 种 FDA 抗癌药5,232 个药物对60 个 NCI-60 细胞系2,809,671 个剂量组合观测免费公开下载不适用（体外细胞系数据，无人类受试者）

104 种 FDA 抗癌药 × 5,232 药物对 × NCI-60，281 万剂量组合点

美国国家癌症研究所（NCI）Developmental Therapeutics Program（DTP） url: https://dtp.cancer.gov/ncialmanac 67

电子健康记录重症监护时序数据

MIMIC-IV-ED — 急诊科临床数据库

约 0.5GB CSV42.5 万次急诊就诊2011-2019 年数据星型 6 表结构需 CITI 培训Demo 免认证21 万名患者

全球最大公开急诊科 EHR 数据库 · 42.5 万就诊 · MIMIC-IV 官方急诊模块

MIT 计算生理学实验室 & 贝斯以色列女执事医疗中心 url: https://physionet.org/content/mimic-iv-ed/ 130

基因组学与多组学测序数据微生物组队列研究

American Gut Project — 全球最大公民科学微生物组参考库

15,096 个微生物组样本11,336 名参与者16S V4 测序 + 问卷元数据开放获取11,336 名参与者（15,096 个样本，截至 2017-05）

11,336 名公民科学家贡献 15,096 个 16S 样本的开放人类微生物组参考库

UC San Diego Knight Lab / The Microsetta Initiative url: https://microsetta.ucsd.edu/ 52

医疗NLP药物发现与化学知识图谱代谢组学化学信息学

ChEBI — 生物医学化学实体本体

201,471 条实体（release 244）61,961 条全人工整理>439,000 条跨库交叉引用OWLOBOSDFSQL 开放下载CC BY 4.0 免费获取不适用（化学实体本体，非患者数据）

超 20 万条目手工整理化学实体本体，小分子 AI 研究的语义底座

EMBL-EBI（欧洲生物信息学研究所） url: https://www.ebi.ac.uk/chebi/ 75

药物发现与化学药物-靶点相互作用化学信息学

DrugBank 药物知识库

11,891 药物141 万 DDI4,939 靶点序列MSNMR 光谱学术许可免费不适用（药物知识库；无患者数据）

11,891 药物 · 141 万 DDI · 4,939 靶点序列：成药知识的黄金标准库

https://go.drugbank.com/ 80

基因组学与多组学蛋白质组学变异与注释肿瘤学

VDJdb — TCR 抗原特异性策展库

约 30 MB TSV13 万+ 条记录CC BY-NC 4.0免费开放下载不适用（分子序列级策展库，非患者队列）

10 万+ TCR-表位配对，4 级置信度评分

Institute of Bioorganic Chemistry, Russian Academy of Sciences / Pirogov Russian National Research Medical University url: https://vdjdb.cdr3.net/ 57

电子健康记录神经科学脑影像队列研究阿尔茨海默病

ADNI — 阿尔茨海默病纵向多模态队列

2,500+ 参与者20+ 年随访MRI + PET + CSF + 基因免费申请获取2,500+ 名参与者

全球最大AD纵向多模态队列 · 2,500+参与者

Alzheimer''''s Disease Neuroimaging Initiative (ADNI, PI: Michael W. Weiner, M.D.) url: https://adni.loni.usc.edu/ 113

基因组学与多组学微生物组测序数据

MGnify — 微生物组分析平台

近 50 万次分析301,808 个基因组REST API + FTP蛋白库 CC0 1.0不适用（样本级平台，非患者级队列）

EMBL-EBI 宏基因组分析平台 · 近 50 万次分析 · 301,808 个基因组

EMBL-EBI（欧洲分子生物学实验室-欧洲生物信息学研究所） url: https://www.ebi.ac.uk/metagenomics/ 37

药物发现与化学化学信息学知识图谱肿瘤学

TTD — 治疗靶点数据库

3,798 个治疗靶点40,398 种药物306,247 条靶点-疾病关联44,649 份 FDA 说明书免注册直接下载3,798 个治疗靶点（疾病关联覆盖 2,912 个靶点）

3,798 个治疗靶点 × 40,398 种药物的药物-靶点-疾病关联知识库

浙江大学药学院 IDRB 组 × 新加坡国立大学 BIDD 组（Innovative Drug Research and Bioinformatics Group / Bioinformatics and Drug Design Group） url: https://idrblab.org/ttd/ 52

医学影像眼科影像医学图像分割神经退行性疾病

ROSE — OCTA 视网膜血管分割基准数据集

229 张 OCTA 图像304×304 与 840×840 像素中心线+像素双级标注Zenodo CC BY 免费获取ROSE-1 39 名受试者；ROSE-2 112 只眼

229 张人工标注 OCTA 图像，SVC/DVC 双层微血管中心线与像素双级标注

中国科学院宁波材料技术与工程研究所（NIMTE, CAS）iMED-Lab url: https://imed.nimte.ac.cn/dataofrose.html 83

公共卫生与流行病学队列研究基因组学与多组学

All of Us 研究计划

74.7 万参与者53.5 万全基因组86% 代表性不足EHR 整合多组学 CDRv9747,000+ 参与者数据可用（匿名化；总注册超 88.3 万）

74.7 万参与者 · 53.5 万全基因组 · 86% 代表性不足社区：世界最大基因组+健康整合库

https://allofus.nih.gov/ 86

生理信号电子健康记录睡眠信号队列研究

NSRR — 全球最大开放睡眠研究数据共享平台

50 个数据集9 TB+ 在线数据约 47,841 名个体EDF+XML+CSV 三层格式DAUA 免费申请获取约 47,841 名个体（50 个数据集，截至 2024-01）

50 个数据集 · 9 TB+ 睡眠数据 · 近 4.8 万名受试者

National Sleep Research Resource（NHLBI 资助，Brigham and Women's Hospital 运营） url: https://sleepdata.org 122

定制数据集服务

无法找到所需数据？我们提供个性化的临床数据采集与高精度人工标注服务，满足您的特定算法研发需求。