即取即用的 AI-Ready 医疗数据集库

千方医数集致力于为医疗 AI 研究人员找到合适的数据集,让你的 AI 感知模型能够更快地学习、更准确地运行,并无缝适应现实世界的环境。

数据标签

医学影像 AI-Ready 数据集

电子病历与文本数据集

病灶分割与标注数据集

共 1336 个数据集

Expression Atlas — 重新计算过的公共基因表达数据
基因组学与多组学转录组单细胞基因组学变异与注释

Expression Atlas — 重新计算过的公共基因表达数据

表达矩阵差异分析结果样本注释表不直接涉及患者个体(样本级元数据含年龄、性别、疾病等字段,属公开文献与数据库已发布信息)

EMBL-EBI 手工策展、统一重处理的 4,562 个转录组与蛋白组实验

GHDx — 全球健康数据的总目录与可获取性登记册
公共卫生与流行病学公共卫生统计全球健康调查数据

GHDx — 全球健康数据的总目录与可获取性登记册

目录元数据混合数据类型不涉及患者个体(目录层,条目指向外部数据集)

16 类数据、200 余国家地区、四级获取门槛的健康数据索引

Cellosaurus — 16.9 万细胞系的鉴定权威与误认档案
基因组学与多组学变异与注释知识图谱肿瘤学

Cellosaurus — 16.9 万细胞系的鉴定权威与误认档案

文本与本体数据人工标注不涉及患者个体(细胞系条目 169,026 个,含物种、性别、年龄与疾病标签)

16.9 万细胞系、904 物种、47 万条交叉引用的细胞系知识库

arXiv 预印本 — 326 万篇,医学影像模型的真正首发地
医疗NLP公共卫生与流行病学评测基准

arXiv 预印本 — 326 万篇,医学影像模型的真正首发地

3,226,976 篇1991 年至今eess.IV 医学影像元数据 CC0逐篇选许可Atom API每日约 1,000+ 篇不适用(学术预印本文献,无患者数据;部分论文含公开数据集上的实验,但数据集本身不在 arXiv 内)

它不是一个数据集,是一个每天新增一千多篇论文的开放档案:eess.IV(影像与视频处理)是医学影像方法的首发地,通常比期刊早 6–18 个月。元数据全部 CC0,正文许可由作者逐篇选择——这意味着你拿到的每一篇,可用范围都不一样,而这是把它当训练语料时最容易忽略的一处

UCDP 冲突数据 — 41.8 万起有组织暴力事件,记到村庄与单日
公共卫生与流行病学电子健康记录评测基准

UCDP 冲突数据 — 41.8 万起有组织暴力事件,记到村庄与单日

417,968 起事件126 个国家1989–2025,425.8 万死亡村庄级坐标单日精度CC BY 4.0,79 个数据集不适用(事件级聚合记录,不含个体身份;伤亡数为事件级估计,非个人记录)

它不是伤亡统计,是把「暴力」这件事拆成可核验的最小单元:某天、某个坐标、哪两方、死了多少人、依据什么来源。37 年、126 个国家、425.8 万条死亡记录。做冲突与健康研究时,这是唯一能让你把「战争」当作一个可测量的环境暴露变量接进模型的东西

世界银行开放数据 — 29,544 个指标,把「国家」变成一行
公共卫生与流行病学电子健康记录多模态评测基准

世界银行开放数据 — 29,544 个指标,把「国家」变成一行

29,544 个指标296 个国家与地区71 个数据源健康主题 658 指标1960 年至今CC BY 4.0v2 REST API不适用(国家与地区级聚合统计,无个体记录;个体级微数据在独立的 Microdata Library,另需申请)

它不是一个数据集,是 71 个数据源的统一检索层:每个指标都标了原始生产者(WHO、UNICEF、ILO、IMF),每条观测都带国家代码、年份、单位与小数位。做跨国健康公平研究时,你真正需要的那张表在这里是「国家 × 年份 × 指标」的三维点阵

BACE — 1,522 条抑制剂,一个靶点,两类标签
药物发现与化学化学信息学分子性质预测虚拟筛选评测基准

BACE — 1,522 条抑制剂,一个靶点,两类标签

1,522 条记录1,513 个唯一 SMILES595 列描述符pIC50 + 二分类单一靶点scaffold 划分9 条重复 SMILES不适用(体外化合物活性数据,无个体;全部为文献报道的体外实验结果)

它是深度学习药物发现里被引用最多的「入门靶点」:人类 β-分泌酶 1(BACE-1),阿尔茨海默病最热的一个靶点。整张表只有 1,513 个唯一分子,却同时给 IC50 连续值和 0/1 活性标签。它的价值不在规模,在于「同一批化合物、两种建模口径」——而它最锋利的地方,是那 9 条重复的 SMILES

QMOF — 20,372 个金属有机框架,四种泛函的带隙
药物发现与化学化学信息学量子化学分子性质预测虚拟筛选

QMOF — 20,372 个金属有机框架,四种泛函的带隙

20,372 个 MOF231 万原子79 种元素四档泛函带隙DDEC6CM5Bader 电荷CC BY 4.0需注册 CSD 才能取初始结构不适用(材料化学数据库,无生物个体;结构来源中 0 个涉及人体样本)

它是第一个把周期性 DFT 系统性地做在 MOF 上的公开库:500 个原子的大晶胞、170 CPU 年的算力、四种泛函的同一批结构。它最锋利的地方不是规模,而是那组「PBE 带隙双峰、HSE06 变单峰」的对照——同一批材料,换个泛函,结论会翻转

HMD — 41 个国家的死亡率,能一路算到 1751 年
公共卫生与流行病学死亡登记公共卫生统计流行病学全球健康

HMD — 41 个国家的死亡率,能一路算到 1751 年

41 个国家地区回溯至 1751 年单岁年龄STMF 38 国周数据HCD 18 国死因CC BY 4.0需注册不适用(国家级聚合统计,非个体级记录;最小统计单元为年龄×年份×性别的暴露人年)

同一个方法协议做了 26 年:把各国统计局口径不一的出生数、死亡数、人口数,重建成年龄×年份×性别的单岁标准网格。瑞典那条序列从 1751 年开始,跨越 274 年没有断过——这是全人类最长的一条连续死亡记录

Europe PMC — 4,911 万条生命科学文献,1.3 亿条机器标注
医疗NLP生物医学文献知识图谱命名实体识别公共卫生与流行病学

Europe PMC — 4,911 万条生命科学文献,1.3 亿条机器标注

4,911 万条文献1,244 万条全文835 万条开放获取13 亿条标注34 个预印本服务器开放式 REST无需注册不适用(文献书目库,个体患者数据仅以论文内聚合形式出现)

它不是 PubMed Central 的欧洲镜像:多了预印本、专利、Agricola,多了一整套资助方反查,还多了 13 亿条文本挖掘标注——这是目前唯一能「按钱查论文、按论文查数据」的公开文献基础设施

TCMSP — 502 味药材、13,729 个化合物,每个都带五项成药性打分
药物发现与化学基因组学与多组学公共卫生与流行病学

TCMSP — 502 味药材、13,729 个化合物,每个都带五项成药性打分

502 味药材13,729 个化合物3,339 个靶点867 种疾病OBDL 双达标 2,583ODbL 许可老版 2.3 免费不适用(化合物与靶点参考库,无患者数据)

免费的老版 2.3 只有 502 味药材和 13,729 个化合物,但每一个化合物都配齐 OB、DL、Caco-2、BBB、溶解度——这是网络药理学十年来的筛选口径本身

CPIC — 把基因型翻译成剂量的那一层
基因组学与多组学电子健康记录医学问答与基准

CPIC — 把基因型翻译成剂量的那一层

132 个基因324 种药物29 部指南2,115 条推荐112,820 条双倍型开放式 REST无需注册不适用(指南与推荐表,无真实患者记录)

132 个基因、324 种药、29 部指南、2,115 条推荐:它不做研究,只做一件事——把文献里的证据定级,然后落成一句「该加量、减量、还是换药」

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