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医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

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图像分类目标检测语义分割

共 1670 个数据集

生理信号心电信号重症监护时序数据

颅脑创伤床旁的三根管线 — CHARIS 颅内压监护波形库

时序信号波形元数据原始数据链接13 名患者 / 13 条记录

13 名患者 / 50 Hz 三通道 / 1.6 GB 开放下载

https://physionet.org/content/charisdb/1.0.0/ 15

生理信号心电信号心血管疾病

室颤之前的那段前奏 — CUDB 室性心律失常库

时序信号波形人工标注元数据35 段记录 / 受试者人数官方未公布

35 段 8.5 分钟 / 单导联 250 Hz / 只标室颤起止

https://physionet.org/content/cudb/1.0.0/ 14

基因组学与多组学单细胞基因组学变异与注释肿瘤学

四百万条拷贝数的五种模态 — CNAScope 泛癌库

元数据多组学原始数据链接人工标注174,464 份样本 / 3,018,672 个单细胞 / 764,232 个空间位点

810 个数据集 / 五种模态 / 焦点与共识注释

https://cna.fengslab.com/ 12

基因组学与多组学变异与注释

变异效应的临床翻译层 — ClinMAVE 功能证据库

多组学本体映射元数据文献引用不适用（体外细胞实验，无个体受试者）

218 万变异 / 821 基因 / ACMG 证据分级

https://ngdc.cncb.ac.cn/clinmave/ 18

基因组学与多组学微生物组变异与注释蛋白质组学

十二万个糖苷基因簇 — dbCAN-HGM 肠道菌群库

多组学元数据本体映射原始数据链接6,031 株物种级代表基因组（源自 13,886 株非冗余 MAG、10 个队列、15,084 株原始 MAG）

12 万基因簇 / 6,031 株代表基因组 / 7.9% 有底物

https://pro.unl.edu/dbCAN_HGM 13

基因组学与多组学药物发现与化学

环状 RNA 的跨物种坐标系 — CIRCpedia 数据库

元数据多组学文献引用不适用（2,413 份测序样本 / 20 个物种）

20 物种 / 2,413 份测序 / 261 万条环状 RNA

https://bits.fudan.edu.cn/circpediav3 16

生理信号心血管疾病

只有心跳时刻，没有波形 — CHF2DB 心衰 RR 间期库

时序信号人工标注元数据29 名受试者 / 29 段记录

29 段长程心电 / 128 Hz 逐搏标注 / 原始信号不公开

https://physionet.org/content/chf2db/1.0.0/ 10

基因组学与多组学蛋白质组学药物发现与化学知识图谱

无膜隔间里的蛋白质名录 — CD-CODE 凝聚体知识库

多组学本体映射文献引用元数据不适用（无受试者；规模以 815 个凝聚体与 11,502 个蛋白计）

815 个凝聚体 / 11,502 个蛋白 / 409 个调节分子

https://cd-code.org/ 13

神经科学脑影像睡眠信号

十二只小鼠的皮层睡眠 — WFCI 睡眠状态库

原始影像人工标注时序信号元数据12 只小鼠 / 各约 3 小时

12 只小鼠 / 各 3 小时 / 10 秒一格分期

https://physionet.org/content/calcium-imaging-sleep-state/1.0.1/ 11

生理信号心电信号可穿戴传感心血管疾病

胸骨加速度与心电同录 — CEBSDB 心震图数据库

时序信号波形人工标注元数据20 名志愿者 / 60 条记录

60 条 / 20 人 / 4 通道 5 kHz / 约 20 小时

https://physionet.org/content/cebsdb/1.0.0/ 17

生理信号心电信号心血管疾病

心跳只剩时间戳 — CAST RR 间期子研究库

时序信号人工标注元数据809 名受试者 / 1543 条记录

809 人 / 1543 条 24 小时注释 / 1.5 亿 RR

https://physionet.org/content/crisdb/1.0.0/ 15

医疗NLP临床文本知识图谱

给无对应词的病名找词 — CUILESS2016 临床概念语料

文本语料人工标注本体映射不适用（行级单位是疾病提及，官方计数见正文）

五千余条疾病提及 / 组合式归一化 / 19 列管道分隔

https://physionet.org/content/cuiless16/1.0.0/ 13

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