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医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

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图像分类目标检测语义分割

共 276 个数据集

病理全切片乳腺癌肿瘤学图像分类

BRACS — 乳腺癌亚型全切片数据集 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

约 1.1TB WSI52GB ROI547 张全切片4,539 个 ROI7 类亚型病理学家共识标注CC BY-NC 4.0注册后免费获取189 名患者

乳腺 H&E 七亚型双层级标注 · 547 WSI / 4,539 ROI

ICAR-CNR & IRCCS Fondazione Pascale & IBM Research-Zurich url: https://www.bracs.icar.cnr.it/ 10

放射影像目标检测胸部X光边界框标注

ChestX-Det10 — 胸部X光异常检测数据集 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

3,543 张胸片8,339 个标注框10 类胸部异常3 名认证放射科医生标注图像 CC0 公有领域官方 traintest 划分3,543 张影像

ChestX-ray14 首个实例级框标注子集 · 3,543 张 · 10 类异常

Deepwise AI Lab（深睿医疗）｜图像来源：NIH Clinical Center url: https://github.com/Deepwise-AILab/ChestX-Det10-Dataset 9

基因组学变异注释临床遗传专家共识

ClinVar — 全球最大临床变异注释数据库 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

455.7 万唯一变异695.5 万提交记录3,512 家提交者0-4 星评审体系月度发布完全免费开放455 万个变异记录

变异-表型解读的全球事实标准 · 455 万唯一变异 · 3,512 家提交者

美国国家生物技术信息中心（NCBI）/ 美国国立卫生研究院（NIH） url: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/clinvar/ 7

队列研究老龄健康纵向调查多模态认知与痴呆

HRS — 健康与退休研究队列 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

43,216 名累计参与者16 波30 年追踪三级访问分级基因 + 生物标志物 + Medicare 联动公开层注册免费4.3 万名参与者

美国老龄研究的国家基础设施 · 43,000+ 人 · 30 年 16 波纵向追踪

密歇根大学社会研究所（ISR）调查研究中心 url: https://hrs.isr.umich.edu/ 12

药物发现分子结构结合亲和力AI 制药

PDBbind — 蛋白-配体结合亲和力数据库 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

约 4GB（v2020 免费版）23,496 个复合物KdKiIC50 实验值注册免费获取CASF 金标准基准每年更新（v2021+ 商业版）2.3 万+ 复合物

蛋白-配体亲和力金标准数据库 · 2.3 万复合物 · CASF 基准发源地

复旦大学药学院王任小团队（PDBbind-CN / PDBbind+） url: http://www.pdbbind.org.cn/ 11

内窥镜影像语义分割经典基准消化道

CVC-ClinicDB — 结肠镜息肉分割基准数据集 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

612 帧专家标注掩膜31 序列23 患者约 50MB 大小免费下载（非商业）MICCAI 2015 官方训练集23 名患者 · 612 帧

息肉分割领域被引最多的公开基准 · 612 帧专家标注 · 引用 2,400+

巴塞罗那自治大学计算机视觉中心（CVC）& Hospital Clínic de Barcelona url: https://polyp.grand-challenge.org/CVCClinicDB 15

心电信号生理信号时序数据竞赛基准

CPSC — 中国生理信号挑战赛心电数据集系列 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

6,877 条 12 导联 ECG四届赛事官方数据500 Hz400 Hz200 HzCC BY 4.0 开放获取隐藏测试集不公开1.3 万+ 条心电记录

中国首个心电 AI 挑战赛系列 · 12 导联分类到动态心电房颤检测

中国生理信号挑战赛组委会（东南大学刘澄玉团队 × ICBEB） url: http://2018.icbeb.org/Challenge.html 11

药物发现化学信息学机器学习基准多模态

TDC — 治疗科学机器学习基准平台 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

66 个 AI-ready 数据集22 个学习任务29 个公开排行榜pip 一键安装3 行代码加载代码 MIT 许可无患者数据 · 分子/蛋白实体级

66 个数据集 · 22 个学习任务 · 药物发现全管线基准

Harvard Medical School Zitnik Lab & MIT & Stanford 等 url: https://tdcommons.ai 12

皮肤科影像临床照片图像分类小样本基准

MED-NODE — 临床皮肤照片黑色素瘤数据集 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

约 24.7MB zip170 张图像70 黑色素瘤 + 100 痣非皮肤镜临床照片免费下载引用论文即可使用170 张图像

最常用的非皮肤镜临床照片基准 · 170 张图像 · 真实世界评估场景

格罗宁根大学 & 格罗宁根大学医学中心（UMCG）皮肤科 url: https://www.cs.rug.nl/~imaging/databases/melanoma_naevi 11

医疗NLP多模态基准医学影像基因组

MultiMedBench — 谷歌医学多任务多模态基准 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

14 项任务12 个数据集超 100 万样本7 种数据模态许可证混合（部分需 CITI 认证）无统一打包下载Google Research 发布超 100 万样本（12 个去标识化数据集）

Med-PaLM M 配套评测基准 · 14 任务 12 数据集 7 模态 · 超 100 万样本

Google Research & Google DeepMind url: https://research.google/pubs/towards-generalist-biomedical-ai/ 13

基因组学肿瘤变异注释精准肿瘤学

COSMIC — 肿瘤体细胞突变数据库 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

约 3,205 万唯一变异（v104）156.6 万份癌症样本750+ 癌症基因（CGC）GRCh37GRCh38 双装配学术注册免费商业需 QIAGEN 许可156.6 万份癌症样本

全球最大肿瘤体细胞突变知识库 · 3,205 万变异 · 20 年策展

Wellcome Sanger Institute（英国） url: https://cancer.sanger.ac.uk/cosmic 13

队列研究公共卫生基因组生存分析

China Kadoorie Biobank — 中国慢性病队列 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

512,891 名参与者10 地区（5 城 5 乡）随访近 20 年10 万人基因分型申请审核获取中国大陆香港学术免费51.2 万名参与者

全球最大中国人群前瞻队列 · 51.2 万参与者 · 随访近 20 年

牛津大学人口健康系 & 北京大学公共卫生学院 & 中国医学科学院 url: https://www.ckbiobank.org/ 16

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