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医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

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图像分类目标检测语义分割

共 780 个数据集

医学影像MRI医学图像分割脑肿瘤肿瘤学

BraTS-Africa

人工标注影像数据原始数据146 例患者（95 例弥漫性胶质瘤 + 51 例其他脑肿瘤）；挑战赛口径 2023 年 95 例 / 2024 年 115 例

撒哈拉以南非洲成人胶质瘤 mpMRI 分割数据集：146 例尼日利亚 1.5T 影像（95 例弥漫性胶质瘤+51 例其他脑肿瘤），MICCAI-CAMERA-Lacuna Fund 挑战赛 2023-2024 两届基准，专家三阶段标注，TCIA CC BY 4.0 公开——为 LMIC 资源受限场景补上全球脑瘤 AI 地图中最空缺的一块

尼日利亚多家诊断中心（TCIA 口径 6 家/NOAJ 论文口径 7 家）临床常规采集的回顾性术前脑 1.5T mpMRI（T1/T1-CE/T2/T2-FLAIR，2010-01~2022-12），经 AfNiA 汇总，按 BraTS 协议预处理（SRI24 配准、1mm³ 重采样、N4 校正、颅骨剥离）并三阶段专家标注 ET/NETC/SNFH 三肿瘤子区域 48

医学影像MRI脑影像挑战赛数据集评测基准

MRIxFields2026 — 跨磁场强度脑 MRI 协调与翻译挑战赛

影像数据原始数据配对数据回顾性非配对约 1056 例（ID 0001–1056 按场强分块）+ 前瞻配对 40 位流动志愿者；图像级展开口径见正文 §4 双口径存照

MICCAI 2026 卫星挑战赛：0.1T–7T 五档磁场强度、T1W/T2W/T2FLAIR 三模态、前瞻配对与回顾非配对混合脑 MRI，三任务评测 nRMSE/SSIM/LPIPS/Dice-14核团/体积一致性，Synapse 门控获取、代码与基线权重 MIT 全开

多中心 0.1T/1.5T/3T/5T/7T 脑 MRI（Siemens Healthineers、United Imaging Healthcare 联影、Point Imaging 设备），T1W/T2W/T2FLAIR，NIfTI 364×436×364 @0.5mm MNI float32；前瞻 travelling volunteers 配对 + 回顾非配对 66

医学影像内窥镜影像图像分类评测基准

LIMUC: Labeled Images for Ulcerative Colitis — 溃疡性结肠炎内镜 Mayo 评分 11,276 图专家标注数据集

人工标注影像数据原始数据564 名 UC 患者（11,276 张图像 / 1,043 次结肠镜操作，2011-12 至 2019-07）

马尔马拉大学医学院胃肠病学科 2011-12 至 2019-07 采集的 11,276 张结肠镜图像、564 名 UC 患者、1,043 次肠镜操作的 Mayo 内镜评分（MES 0-3）四分类专家标注数据集——双盲双专家加第三专家仲裁多数投票，官方 10 折交叉验证与固定测试集防泄漏，回归式深度学习融入类间有序距离，CC BY-4.0 于 Zenodo 公开直链

Marmara 大学医学院胃肠病学科 2011-12 至 2019-07 采集的结肠镜图像（统一缩放 352×288 BMP）+ Mayo 内镜评分（MES 0-3）三专家共识标注 + 官方 10 折交叉验证划分与固定测试集 + 按患者组织的全量图像包（patient_based_classified_images.zip） 59

医学影像MRI医学图像分割挑战赛数据集心血管疾病

M&Ms-2 多疾病多视图多中心右心室分割挑战数据集

人工标注影像数据原始数据360 例 cine CMR 研究（75 健康 + 7 组病理共 285 例；患者级去重数未披露）；训练 160 / 验证 40 / 测试 160

STACOM 2021 官方挑战数据集：360 例 cine CMR、3 家巴塞罗那医院、9 台扫描仪、8 组病理，短轴+长轴 4CH 双视图，DRV/TRI 未见病理测泛化，15 队参赛 nnU-Net 最优，DSC 较 M&Ms-1 提升 0.042

3 家西班牙巴塞罗那医院（Vall d'Hebron、Clínica Sagrada Familia、Dexeus）回顾性 cine CMR（短轴 SA + 长轴 4CH 双视图，ED/ES 两时相）+ LV/RV/MYO 三结构 NIfTI 标注（来源中心专家标注、另 2 人复核、cvi42 软件链）；挑战评估仅针对 RV 61

医学影像医疗NLP多模态X光影像

REFLACX — 眼动定位异常胸片数据集

眼动数据人工标注时序数据3,052 次读片（3,032 次有效眼动）/ 2,616 张胸片 / 2,199 名患者——5 位放射科医生眼动+转录同步采集

3,032 次读片的眼球轨迹：放射科医生'看哪里'第一次成为可下载的数据

MIMIC-CXR 派生：EyeLink 1000 Plus 眼动仪（1000 Hz）+ MATLAB/Psychtoolbox 接口 + IBM Watson 语音转写，5 位放射科医生三阶段采集（2020-11~2021-06） 60

医学影像医学图像分割图像分类挑战赛数据集脑影像阿尔茨海默病

SELMA3D

影像数据人工标注原始数据58 幅 3D 图像（2025 训练集：Task 1 离散结构 30 幅 + Task 2 连续结构 >25 幅）；2024 首届对照 35 幅 + 315 个标注 patch；小鼠 cleared

SELMA3D 2025：MICCAI 2025 卫星挑战赛——58 幅小鼠组织透明化光片显微 3D 图像（单幅最大 10000³ 体素）的自监督/半监督分割，两赛道分治离散与连续生物结构，设计文档 CC-BY-4.0，图像三层托管（Zenodo/EBI BioStudies/Grand Challenge 注册制）

小鼠组织透明化 + 特异性染色 + 光片显微镜三维成像（16-bit TIFF 体数据，单幅最大 10000³ voxels；2024 patch 为 NIfTI LPS+）；托管三层异构：Zenodo 设计文档 cc-by-4.0 / EBI BioStudies S-BIAD1196 + S-BIAD1197（2024 图像）/ Grand Challenge 注册制下载（2025 图像） 35

电子健康记录公共卫生与流行病学真实世界数据

maternal-ultrasound-nutrition — 孕期母体脂肪超声与营养数据集

纵向队列超声测量结局变量211 例孕产妇（272 入组-61 失访；2016-10~2017-12）

三孕期脂肪尺：211 例孕产妇队列把'母体腹部脂肪'变成 GDM 预警变量

巴西 Porto Alegre Murialdo Teaching Health Center 的前瞻性队列（116 变量表） 50

医学影像CT医学图像分割评测基准肿瘤学挑战赛数据集

ULS23 通用病灶分割挑战赛 — 首个公开 CT 3D 通用病灶分割基准与基线模型

影像数据人工标注开源数据评测集 284 患者；训练集患者数未在摘要单独披露（含 10 个公开数据集合集 + Radboudumc 自采）

ULS23 聚合 10 个公开 CT 数据集并新增 Radboudumc 胰腺/骨自采标注，训练集 38,693 病灶、评测集 775 病灶/284 患者，配套 nnU-Net v2 半监督基线（Dice 0.703）公开——CT 通用病灶分割的可复现基准

聚合 10 个公开 CT 数据集（DeepLesion、LIDC-IDRI、LiTS、KiTS21、Medical Segmentation Decathlon task 6/7/10、NIH-LN、CCC18 等）的病灶分割组件 + Radboudumc 新增胰腺/骨共 868 例自采标注（Part1：750 DeepLesion + 744 bone + 124 pancreas），统一为病灶体积兴趣区（VOI），Zenodo 分 Part1-6 公开，约 15.9 GB 52

医学影像医学图像分割评测基准挑战赛数据集

PSFHS — 分娩超声耻骨联合-胎头分割数据集

人工标注影像数据原始数据1358 张图像 / 1124 名孕妇（珠江医院 1045 张/1040 人 + 暨南大学附属第一医院 313 张/84 人）；前作 JNU-IFM 另含 51 名孕妇（南方医院）

MICCAI 2023 FH-PS & AOP 挑战官方数据集：1124 名孕妇 1358 张经会阴正中矢状面超声的耻骨联合-胎头像素级分割，学生双人独立初标+医师精修，标签 0 背景/1 耻骨联合/2 胎头，附 AOP 进展角测量素材，Sci Data 2024 论文同步公开 CC BY-4.0

分娩期经会阴超声 mid-sagittal 图像（便携超声 + 3.5 MHz 凸阵探头；ObEye 与 Esaote MyLab 两机）+ 像素级 MHA 分割掩码（0=背景/1=耻骨联合 PS/2=胎头 FH）+ MICCAI 2023 挑战赛训练/测试划分与排行榜元数据 56

医学影像眼科影像医学图像分割糖尿病视网膜病变青光眼

FIVES — 面向 AI 视网膜血管分割的彩色眼底图像数据集

图像像素级分割掩膜视网膜血管眼底彩照二值掩膜多病种573

800 张 2048×2048 眼底照片、573 名患者、四病种均衡、人工像素级血管掩膜——视网膜血管分割方向迄今规模最大的公开数据集之一

figshare（官方发布页，FIVES dataset version 1） 49

医学影像手术视频眼科影像图像分类挑战赛数据集

SICS-155 小切口白内障手术视频相位识别数据集

人工标注影像数据原始数据155 名患者（155 段手术视频，一对一；100 train / 15 validation / 40 test）

全球首个手动小切口白内障手术（SICS）视频逐帧相位标注数据集——印度 Sankara 眼科医院 155 段手术、18 相位、960×540@30FPS、平均 13:05 分钟，MICCAI 2025 卫星事件挑战赛基准，MS-TCN++ 基线 85.56% 到 boundary-aware FACT 87.98%，Zenodo CC BY-NC-4.0 受限获取

印度 Sankara Eye Hospital 手术显微镜录像（960×540，30 FPS，时长 5:01–21:58，平均 13:05）+ 逐帧相位标注（18 手术相位+background；groundTruth txt 逐帧标签 + CSV/Excel 起止时间表 + mapping.txt 类别索引） 41

医学影像CTMRI多模态影像肿瘤学

SynthRAD2025

原始数据影像数据人工标注2362 cases = Task 1 890 MRI-CT 配对 + Task 2 1472 CBCT-CT 配对（HN/TH/AB 三解剖区、5 欧洲中心；train 65% / val 10%

荷兰五中心联盟发布的全球最大公开合成 CT（sCT）挑战数据集——2362 例 MRI→CT 与 CBCT→CT 配对覆盖头颈/胸/腹盆三解剖区，两阶段预处理流水线+TotalSegmentator 几何评估+matRad/pyRadPlan 剂量计算双轨评测，Zenodo 公开直链（CC BY-NC 4.0 + Center D 有限许可），MICCAI 2025 挑战赛官方数据，排行榜开放至 2030

5 欧洲中心放疗科常规采集的 planning CT + 同日 MR 或治疗位 CBCT（经刚性/形变配准对齐），MetaImage .mha 格式，统一重采样 1×1×3 mm，v2 版 CT/CBCT 统一 clipping (-1024, 3071) HU，含 body mask（fov/mask 通道） 42

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