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医学影像 AI-Ready 数据集

CTMRI病理X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

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共 780 个数据集

MIMIC-Ext-CXR-QBA — 胸片视觉问答的「问题-框-答案」三元组数据集
多模态视觉问答影像-文本对齐X光影像医学问答评测基准

MIMIC-Ext-CXR-QBA — 胸片视觉问答的「问题-框-答案」三元组数据集

影像数据文本数据衍生数据65,317 名患者（Train 64,524 / Val 500 / Test 293）；227,239 项检查、376,175 张图像

从 MIMIC-CXR 的 22.8 万篇放射报告自动构建 42,172,827 条胸片 VQA 问答对——每问附细粒度解剖边界框（正负发现均定位）、层级化整句答案与结构化标签，配套场景图与 ICLR 2026 结构化 VQA 任务基准，PhysioNet 凭证访问

MIMIC-CXR 派生的胸片 VQA 数据集（42,172,827 问答对，源 227,827 篇放射报告 / 377,110 张 MIMIC-CXR-JPG 图像），PhysioNet 凭证访问 38
Multi-site, Multi-domain Airway Tree Modeling — 肺气道树分割公共基准
医学影像CT医学图像分割评测基准挑战赛数据集

Multi-site, Multi-domain Airway Tree Modeling — 肺气道树分割公共基准

影像数据原始数据人工标注500 例胸部 CT（300 训练 / 50 验证 / 150 测试）；患者级独立例数未公开披露

MICCAI 2022 多中心多领域肺气道树建模挑战赛数据集 ATM'22——500 例胸部 CT（300 训练/50 验证/150 测试）由 3 名放射科医生标注三维气道树，含 COVID-19 噪声域，开放注册获取，MedIA 2023 正式发表

多中心多领域胸部 CT（NIfTI，含 COVID-19 毛玻璃影+实变噪声子集）+ 三维肺气道树二值标注掩码（3 名 >5 年经验放射科医生标注，气管/主支气管/肺叶支气管/远端段支气管） 35
HEADLINE: Benchmarking VLMs in Head CT Reporting — 3D 头部 CT 放射学报告生成挑战赛
医学影像CT医疗NLP多模态挑战赛数据集

HEADLINE: Benchmarking VLMs in Head CT Reporting — 3D 头部 CT 放射学报告生成挑战赛

3D 容积 CT放射学报告影像-文本对齐视觉问答神经影像17000

MICCAI 2026 挑战赛数据集：16,000+ 例 3D 头部 CT 配结构化自由文本报告，双阶段混合评估（自动 BERTScore + 放射科医生临床效用评分）

HEADLINE: Benchmarking VLMs in Head CT Reporting — MICCAI 2026 挑战赛数据集（University Hospital Bonn, CCIBonn） url: https://headline26.grand-challenge.org/ 56
Endoscopic Bladder Tissue Classification Dataset — TURBT 内镜四类膀胱组织分类（1754 图/23 例/CC BY 4.0）
医学影像内窥镜影像图像分类肿瘤学手术视频

Endoscopic Bladder Tissue Classification Dataset — TURBT 内镜四类膀胱组织分类（1754 图/23 例/CC BY 4.0）

影像数据原始数据人工标注23 例接受 TURBT 的患者（NBI 域仅来自其中 3 例）

米兰理工与斯特拉斯堡 ICube 联合 IEO 泌尿外科采集的经尿道膀胱肿瘤电切（TURBT）内镜图像分类数据集——1754 张白光照（WLI）与窄带成像（NBI）帧按切除组织病理回溯标注四类（HGC/LGC/NST/NTL），配套半监督 GAN 跨域方法，CC BY 4.0 于 Zenodo 公开直链

TURBT 手术内镜视频抽帧 PNG（WLI 与 NBI 双域）+ 逐帧注释文件 annotations.csv（帧名/成像类型/组织类型/数据划分）；样本总量 1754 张，四类 HGC 469 / LGC 647 / NST 504 / NTL 134；官方下载包 baldder_tissue_classification.zip（241.2 MB，md5 f507e28908fa73cb01fcfd48e1951675） 42
BAGLS-VF — 喉镜声门与左右声带像素分割数据集
医学影像内窥镜影像医学图像分割语音信号

BAGLS-VF — 喉镜声门与左右声带像素分割数据集

人工标注影像数据原始数据59250 帧视频喉镜影像（沿用 BAGLS 基础帧池，来自 640 段录音、7 家多中心机构）；BAGLS-VF 新增左/右声带两类像素级标注，患者级人数未单独披露

BAGLS 视频喉镜基准的三类像素级扩展——在 59250 帧多中心喉镜影像上把声门单类标注扩为声门区+左声带+右声带三类，半自动标准化协议产出 RGB 标签掩膜，支撑嗓音医学的声门面积量化与声带对称性分析

视频喉镜（videolaryngoscopy）图像帧（约 97% 灰度 + 约 3% 彩色 RGB）+ RGB 编码的三类标签掩膜（声门区/左声带/右声带）+ 标准化半自动标注协议；主托管 Zenodo (10.5281/zenodo.19593658)，祖代 BAGLS 见 Zenodo 10.5281/zenodo.3762320，论文见 BMC Research Notes 10.1186/s13104-026-07972-7 33
PANDA-CMS — 儿童后颅窝肿瘤 MRI 分割与小脑缄默综合征预测数据集
医学影像MRI医学图像分割脑肿瘤儿科肿瘤学

PANDA-CMS — 儿童后颅窝肿瘤 MRI 分割与小脑缄默综合征预测数据集

人工标注影像数据临床数据104 例术前儿童后颅窝肿瘤（description 原文 104 preoperative pediatric posterior fossa tumor MRIs）

104 例术前儿童后颅窝肿瘤 MRI + 分割掩码 + 临床数据的 figshare 公开数据集——面向自动肿瘤分割与小脑缄默综合征（CMS）预测双任务，GPL 3.0+ 软件许可用于数据集的罕见样本；与库内前列腺癌 PANDA（rid 560/27）、panda-plus（rid 640）同名不同体，勿合并

figshare 公开数据集 article id 30281506（doi:10.6084/m9.figshare.30281506.v1）：anonymized_data.zip（术前 MRI + 分割掩码 + 临床数据，含匿名化处理）+ Data Usage Agreement.pdf；版本 v1；发布时点 2025-10-05T16:06:12Z 42
Regensburg Pediatric Appendicitis Dataset — 782 例患儿腹痛 B 超影像 + 实验室检验 + 三大临床终点的可解释多模态基准
医学影像图像分类多模态儿科队列研究

Regensburg Pediatric Appendicitis Dataset — 782 例患儿腹痛 B 超影像 + 实验室检验 + 三大临床终点的可解释多模态基准

影像数据临床数据原始数据782 例儿科患者（建模子集 579 例；图像归档 v1.03 含 2097 张 BMP）

德国雷根斯堡圣海德维希儿童医院 2016–2021 回顾性队列：782 例疑似阑尾炎患儿、每人 1–15 张腹部 B 型超声（BMP）+ 护理/检验/体格/评分表格数据，三目标变量（诊断/管理/严重程度），CC-BY-NC-4.0 —— 配套概念瓶颈模型（CBM）论文发表于 Medical Image Analysis，是儿科阑尾炎超声 AI 领域被引用最多的公开基准之一

Zenodo（DOI 10.5281/zenodo.7669442，v1.01）；镜像 UCI ML Repository dataset 938 / Kaggle 社区镜像；图像 US_Pictures.zip 523.0 MB + 表格 app_data.xlsx 212.8 kB 39
ORCHID 口腔癌组织学图像数据库 — 印度五中心 150 例患者 14,705 张 512×512 病理 patch、OSMF 与 OSCC 三档分化五分类数据集
医学影像病理图像图像分类肿瘤学

ORCHID 口腔癌组织学图像数据库 — 印度五中心 150 例患者 14,705 张 512×512 病理 patch、OSMF 与 OSCC 三档分化五分类数据集

影像数据人工标注公开数据150 例患者 / 14,705 张 512×512 病理 patch（五类：normal / OSMF / WDOSCC / MDOSCC / PDOSCC；官方划分 训练 10,228 / 验证

印度 5 家顶级医疗中心 150 例活检、H&E 染色、1000X 有效放大（100X 物镜）切出的 14,705 张 512×512 组织病理 patch，按 normal/OSMF/WDOSCC/MDOSCC/PDOSCC 五类标注，官方 70/20/10 患者级划分，CC BY 4.0 完全开放下载；口腔癌与癌前病变病理 AI 的关键公开语料

印度 5 家顶级医疗中心采集的 150 例患者口腔活检组织切片，H&E 染色、1000X 有效放大（100X 物镜）成像后切出的 512×512 像素 patch（相邻重叠 256 像素），经病理学家分级标注为 normal/OSMF/WDOSCC/MDOSCC/PDOSCC 五类，含 Reinhard 染色归一化 25
TN-SCUI2020 — 甲状腺结节超声分割分类挑战赛数据集（4554 张）
医学影像医学图像分割图像分类挑战赛数据集评测基准

TN-SCUI2020 — 甲状腺结节超声分割分类挑战赛数据集（4554 张）

人工标注影像数据原始数据4554 张超声图像（训练 3644 + 测试 910；训练集良性 1641 / 恶性 2003）

瑞金医院与中国医学超声人工智能联盟主办的 MICCAI 2020 关联挑战赛数据集：4554 张 B 型超声图像、3644 张带结节掩码与良恶性标签的训练集、910 张测试集，覆盖分割与分类双赛道；官方声明因伦理审批限制，数据集发布权仅限本挑战赛用途

上海交通大学医学院附属瑞金医院超声诊断科采集的甲状腺结节 B 型超声图像（PNG）+ 二值结节分割掩码（PNG，前景 255/背景 0）+ train.csv 良恶性标签表（CATE：0=良性/1=恶性） 44
MAVIS — 显微血管吻合术工作流与器械分割视频数据集
医学影像手术视频医学图像分割多模态视觉问答评测基准

MAVIS — 显微血管吻合术工作流与器械分割视频数据集

影像数据人工标注视频数据19 段视频（3 名微血管吻合术外科医生，1 mm 人工血管吻合，配对本操作）；帧级 10,652 帧

KIST 联合高丽大学医学院采集的 19 段显微血管吻合术视频（10,652 帧 @1920×1080）——帧级 6 阶段/4 相位/8 步工作流标注 + 逐帧七类器械像素级分割掩码 + 模板化 VQA，随 SurgMLLMBench 基准发布并 CC BY-NC-4.0 于 HuggingFace 公开直链

KIST Center for Humanoid Research 联合高丽大学医学院采集的 19 段显微血管吻合术操作视频（1920×1080，1 FPS 采样）+ 逐帧三层级工作流标注（6 阶段/4 相位/8 步）+ 像素级多边形器械分割掩码（COCO 格式，七类器械 + 分割 PNG）+ 模板化 VQA 问答对 41
developing Human Connectome Project — 发育人脑连接组新生儿脑 MRI 数据集（558 例）
神经科学脑影像MRI医学图像分割队列研究儿科

developing Human Connectome Project — 发育人脑连接组新生儿脑 MRI 数据集（558 例）

影像数据临床数据第二版 558 例新生儿（官网 subjects 口径；第三方去重口径 505 neonates / 558 T2w scans）；第四版 783 新生儿（886 数据集）+ 273 胎儿（297 数

KCL+帝国理工+牛津联合打造的首个生命早期四维连接组——第二版 558 例新生儿三模态（结构 T2w/扩散/静息态）脑 MRI，3T Philips Achieva 自然睡眠采集，注册+数据共享协议获取，第四版已扩至 783 新生儿+273 胎儿并接入基因组与 18 月龄发育结局

KCL+Imperial College London+University of Oxford 联盟于 Evelina Newborn Imaging Centre（伦敦圣托马斯医院）采集的新生儿三模态 3T MRI（结构 T2w/T1w + 扩散 MRI + 静息态 fMRI）+ 极简元数据（性别/出生孕周/扫描孕周/出生体重/头围/放射质控分）+ 分割（9 组织类型/87 区域）与皮层表面/连接组衍生数据 34
Helsinki Neonatal EEG — 79 例新生儿癫痫脑电秒级专家标注参考集
生理信号脑电信号神经科学癫痫儿科重症监护

Helsinki Neonatal EEG — 79 例新生儿癫痫脑电秒级专家标注参考集

人工标注原始数据时序数据79 例足月新生儿（term neonates）；共识 39 例有发作、22 例无发作

赫尔辛基大学医院 NICU 79 例足月新生儿多通道 EEG，中位 74 分钟、256 Hz、CC BY 4.0 于 Zenodo 公开；3 位专家独立盲标发作秒级起止，共识 39 例有发作 / 22 例无发作，是新生儿癫痫自动检测与观察者间一致性研究的公开金标准

赫尔辛基大学医院 NICU 多通道脑电：79 个 EDF 文件（referential montage、256 Hz、微伏）+ 3 位专家秒级标注（annotations_2017，CSV A/B/C 与 MAT，1 Hz、1=发作/0=非发作）+ clinical_information.csv（性别、出生体重、胎龄、天龄、神经诊断、神经影像所见） 45

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