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医学影像 AI-Ready 数据集

CTMRI病理X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

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图像分类目标检测语义分割

共 774 个数据集

PolypDB — 三中心五模态结肠镜息肉图像数据集
医学影像内窥镜影像医学图像分割目标检测结直肠癌评测基准

PolypDB — 三中心五模态结肠镜息肉图像数据集

人工标注影像数据原始数据未披露（3934 张图像，抽帧自真实结肠镜检查视频；三中心：挪威 Bærum、瑞典 Karolinska、越南 HMU/IGH）

挪威/瑞典/越南三中心 3934 张息肉图像的像素级分割掩码与检测框，覆盖 BLI/FICE/LCI/NBI/WLI 五种内镜成像模态，附分割/检测/联邦学习基线——首个开源五模态息肉数据集，OSF 公开直链

三中心结肠镜检查视频抽帧序列（Norway/Sweden/Vietnam）+ 像素级分割掩码（Labelbox 标注，≥2 名高级胃肠病专家交叉复核）+ 边界框检测标注 + 模态/中心双视图划分文件（COCO 格式标签） 51
DRIONS-DB — 视神经乳头分割基准数据集
医学影像眼科影像医学图像分割评测基准青光眼

DRIONS-DB — 视神经乳头分割基准数据集

人工标注影像数据原始数据110 张彩色眼底图像（来自 55 名患者；46.2% 男 / 53.8% 女；平均年龄 53.0 岁，S.D. 13.05；全体高加索族裔）

西班牙萨拉戈萨 Miguel Servet 医院 110 张彩色眼底彩照的双专家手工视盘轮廓标注库——2008 年由 UNED 与马德里三家机构联合发布，视盘分割研究的奠基基准之一，DRIU 等超人类性能方法的实验场，研究/教育限定许可直链分发

西班牙萨拉戈萨 Miguel Servet 医院眼科眼底图像库（随机抽 124 张后剔除 14 张白内障，得 110 张）；彩色模拟眼底相机采集、以幻灯格式保存，经 HP-PhotoSmart-S20 扫描仪数字化为 RGB 600×400、8 bits/pixel；2 名医学专家逐点手工描画视盘轮廓 33
MR-ART — 同一批 148 人配对静止与运动伪影 T1 脑 MRI 数据集
医学影像MRI脑影像医学图像分割评测基准

MR-ART — 同一批 148 人配对静止与运动伪影 T1 脑 MRI 数据集

影像数据原始数据人工标注148 名健康成人（95 女 / 53 男；年龄 18-75 岁，中位 25.16 岁，IQR 10.50 岁）；每人 3 套扫描（STAND/HM1/HM2，8 人 HM1 或 HM2 之一缺失）

同一批 148 名健康成人、每人三套 T1 结构脑 MRI（静止 STAND / 轻度点头 HM1 / 重度点头 HM2）的配对运动伪影数据集——附带 MRIQC 图像质量指标与两位神经放射科医师的临床可用性评分，CC0 公共领域于 OpenNeuro 公开直链，是运动伪影校正与脑 MRI 质控算法的真实世界验证标准

OpenNeuro ds004173（BIDS 组织的 T1w 3D MPRAGE 结构脑 MRI，1mm³ 各向同性）+ MRIQC v0.16.1 图像质量指标（SNR/EFC/CJV）+ 两位神经放射科医师 3 分制临床伪影评分（scores.tsv）+ participants.tsv（年龄/性别） 49
EchoNet-Pediatric — 最大公开儿科超声心动视频数据集
医学影像心血管疾病儿科医学图像分割评测基准

EchoNet-Pediatric — 最大公开儿科超声心动视频数据集

影像数据人工标注原始数据1,958 名患儿（0-18 岁，43% 女性）；4,467 次超声检查；7,643 段视频

斯坦福 7,643 段儿科心脏超声视频（1,958 名 0-18 岁患儿、A4C+PSAX 双视图）配专家描记与射血分数，与 EchoNet-Peds 模型共同验证「儿科专属训练显著优于成人模型迁移」

Lucile Packard Children's Hospital at Stanford（斯坦福儿童医院）+ Stanford AIMI Center（论文 J Am Soc Echocardiogr 2023;36(5):482-489） url: https://echonet.github.io/pediatric/ 49
ASOCA — 全冠状动脉树自动分割挑战赛数据集
医学影像CT医学图像分割挑战赛数据集心血管疾病评测基准

ASOCA — 全冠状动脉树自动分割挑战赛数据集

人工标注影像数据原始数据训练集 40 例（20 健康 + 20 患病，钙化评分为 0 且无狭窄征象者为正常）；测试集 20 例（10 健康 + 10 患病，挑战期 GT 不公开）；共 60 例 CTCA

MICCAI 2020 首个全冠状动脉树全自动分割挑战——40 例三专家投票级体素标注 CTCA（20 正常+20 患病）+ 20 例隐藏测试，另附中心线/钙化评分/STL 网格，UK Data Service 请求制获取

匿名 Cardiac CTCA（CT 冠状动脉造影，含造影剂，覆盖所有 >1 mm 血管）影像（.nrrd 格式）+ 三位专家独立体素级冠状动脉管腔分割经多数投票融合的标注 + 中心线（centrelines）+ 钙化评分（calcification scores）+ 平滑表面网格（.stl）；源自 Coronary Atlas 持续采集队列，患者知情书面同意 97
ORIGA-light — 新加坡 SiMES 队列 650 张眼底图的视盘/视杯分割与青光眼判读基准
医学影像眼科影像医学图像分割青光眼评测基准图像分类

ORIGA-light — 新加坡 SiMES 队列 650 张眼底图的视盘/视杯分割与青光眼判读基准

人工标注影像数据原始数据650 张眼底图（168 青光眼 + 482 正常），源自 SiMES 队列 3,280 名受试者；公开子集为去标识化图像级计数，无逐受试者明细

史上最早规模化公开的眼底视盘/视杯逐像素分割集：650 张非散瞳彩色眼底图（168 青光眼 + 482 正常），源自新加坡马来裔人群队列 SiMES，附 CDR/ISNT/RNFL 等 13 项专家结构判读标签，现由 Zenodo 社区镜像以 CC BY 4.0 承接发布

新加坡 SiMES（Singapore Malay Eye Study）队列非散瞳彩色眼底照相（Canon CR-DGi，视场约 45°，3072×2048 RGB），附眼科专家按 CERA 协议经 ORIGA-GT 工具标注的视盘/视杯边界与 13 项结构判读字段；现行打包于 Zenodo 10.5281/zenodo.10674885（ORIGA.rar 约 475 MB） 47
SLAM — 腹腔镜手术动作识别视频片段数据集
医学影像手术视频内窥镜影像图像分类评测基准

SLAM — 腹腔镜手术动作识别视频片段数据集

人工标注影像数据原始数据34 例患者 / 34 段完整手术视频（匿名化哈希 ID）；4,097 个视频片段；9 类术式（含 1 例跨科胸腔镜）

瑞金医院卢湾分院 34 台腹腔镜手术切分为 4,097 个 30 帧片段、覆盖 9 类术式与 7 类基础动作，三级医师标注体系，ViViT 基准最高 85.90%——CC BY 4.0 于 figshare 公开，与内窥镜 SLAM 定位数据集划清界限

瑞金医院卢湾分院 2021–2023 年 34 台腹腔镜手术录像（1920×1080 / 25fps / 26003BA HOPKINS 30° 内窥镜），统一切分为 30 帧片段，7 类基础动作标注，训练/验证/测试 70/15/15 划分（train.csv / val.csv / test.csv + LaparoMotion/clip/） 43
PhaKIR — 腹腔镜胆囊切除三任务联合标注（相位+器械关键点+实例分割）多机构视频数据集
医学影像手术视频内窥镜影像医学图像分割目标检测挑战赛数据集

PhaKIR — 腹腔镜胆囊切除三任务联合标注（相位+器械关键点+实例分割）多机构视频数据集

视频数据人工标注影像数据8 段完整手术视频（对应 8 例手术；患者级人口学信息未披露）；机构：TUM Rechts der Isar 6 + Heidelberg 1 + Weilheim-Schongau 1

8 段完整腹腔镜胆囊切除视频、3 家德国医院、同一批序列上联合标注 8 相位 × 19 器械类实例分割 × 2-4 关键点，Zenodo 受限申请制分发、CC BY-NC-SA 4.0，EndoVis 2024 子挑战

8 段腹腔镜胆囊切除术完整视频（MP4, 25 fps, 1920×1080）+ 相位 CSV + 关键点 JSON + 器械实例分割 PNG 掩码 + 剪切索引 CSV，源自 TUM/Heidelberg/Weilheim 三家德国医院，由 ReMIC Lab 组织标注 35
BIOSSES — 生物医学句子相似度人工标注基准
医疗NLP生物医学文献评测基准

BIOSSES — 生物医学句子相似度人工标注基准

人工标注文本数据评测数据不适用（句子级文本基准，无患者个体数据；语料源自已发表生物医学文献）

Boğaziçi 大学 2017 年发布的 100 句对生物医学语义文本相似度（STS）基准：5 位专家 0–4 分级取均值为金标准，首开生物医学句级相似度手工评测先河；论文同批提出字符串/本体/段落向量/监督回归四类方法，监督模型达 0.836 Pearson 相关，人类上界 0.902

选自 TAC 2014 Biomedical Summarization Track 训练集（20 篇 reference articles，每篇 12–20 篇 citing articles）的引用句，由 5 位人类专家标注 0–4 相似度后取均值为金标准；字段为 sentence1/sentence2/score 32
JustRAIGS — 青光眼转诊的双任务可解释筛查挑战赛与 10 万张眼底图训练集
医学影像眼科影像图像分类青光眼挑战赛数据集评测基准

JustRAIGS — 青光眼转诊的双任务可解释筛查挑战赛与 10 万张眼底图训练集

人工标注影像数据公开数据集全库 61,919 患者 / 111,178 张眼底图（TMI 论文口径）；公开训练集 101,442 张 / 55,736 患者；闭集测试集 9,736 张 / 6,183 患者

ISBI 2024 挑战赛：101,442 张眼底照相既要判「该不该转诊青光眼专科」（RG/NRG 二分类）又要说清「凭什么转」（10 个青光眼体征多标签），421 条标注规则由 20 名通过 EODAT 考核的 grader 双评+专家终审产出

EyePACS LLC（美国加州圣克鲁斯）糖网筛查项目眼底彩色照相（CFP，JPEG），经 Rotterdam Eye Hospital 眼科专家按 RG/NRG 二分类 + 10 项青光眼体征多标签标注；约 500 个筛查点、10 种相机型号，族裔异质人群 108
EBHI-Seg
病理图像医学图像分割结直肠癌肿瘤学图像分类

EBHI-Seg

人工标注影像数据原始数据2,228 张切片图像（+2,228 张 ground truth 掩码，合计 4,456 文件；患者级数量未披露）

东北大学 MIaMIA 组 4,456 张结直肠肠镜活检 H&E 图像（2,228 切片 + 2,228 像素级分割掩码）、六类肿瘤分化阶段，CC BY 4.0 于 figshare 公开直链；论文自带经典机器学习与深度学习分割基线（最高 Dice 0.965）

辽宁省肿瘤医院/中国医科大学附属肿瘤医院肠镜活检结肠组织 H&E 切片，Nissan Olympus 显微镜 400×（目镜 10× × 物镜 40×）采集，224×224 像素 PNG 切片图像 + 像素级二值分割掩码，六类肿瘤分化阶段（Normal/Polyp/Low-grade IN/High-grade IN/Serrated adenoma/Adenocarcinoma） 37
CheXlocalize
医学影像X光影像医学图像分割评测基准肺癌

CheXlocalize

人工标注影像数据原始数据700 患者（val 200 + test 500）；902 张胸片（val 234 + test 668）

斯坦福 AIMI 托管的胸片病灶定位标注集——2 名放射科医师 18/27 年经验对 CheXpert val/test 902 张逐像素勾画 643 条分割，度量 7 种 saliency 方法定位能力的老牌基准，代码由哈佛 Rajpurkar Lab 维护

CheXpert val/test 派生胸片 902 张 + 放射科医师像素级轮廓标注（643 条 val 分割，RLE 编码）+ test 集 human benchmark 分割与最代表点 + val 集 DenseNet121 Grad-CAM 热图 47

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