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医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

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图像分类目标检测语义分割

共 770 个数据集

医学影像CT医学图像分割挑战赛数据集肿瘤学

SegRap 2023

ncCT 平扫 CTceCT 增强 CTOAR 分割掩膜GTV 分割掩膜MHA 体数据预对齐双模态200

MICCAI 2023 鼻咽癌放疗计划双模态 CT 分割挑战赛：200 患者 ncCT+ceCT 预对齐配对、45 OAR+2 GTV 双任务、训练 120/验证 20/测试 60 三分格局，Task01 冠军佳能医疗(中国) nnUNetV2 边界精修、Task02 冠军斯德哥尔摩大学 Astaraki，无 Zenodo、EUA 邮件请求制发放

SegRap2023 官网（grand-challenge.org 托管）+ Google Drive / 百度网盘 url: https://segrap2023.grand-challenge.org 59

医学影像皮肤影像图像分类挑战赛数据集评测基准皮肤癌

ISIC 2019 Challenge

人工标注影像数据原始数据训练 25,331 张图像（唯一 lesion ID 11,848 个）+ 测试 8,238 张；患者级人数官方未公布

ISIC 第 4 届皮肤镜病变分类挑战赛：25,331 张训练图 + 8,238 张含未知类测试图、balanced accuracy 主指标与 4,000 美元奖金，冠军 Gessert 团队多分辨率 EfficientNets 集成双任务登顶，训练集图像全部来自 HAM10000/BCN20000/MSK 三个既有数据源

ISIC 2019 Challenge 官方数据包：训练 25,331 张皮肤镜 JPEG（9.1GB）+ 8 类 one-hot ground truth + 测试 8,238 张 JPEG（3.6GB）+ 测试 GT（454KB，含评分权重）+ 训练/测试 metadata（年龄/性别/部位/lesion ID）；图像来源 BCN20000 + HAM10000 + MSK 三源聚合 45

医学影像CT医学图像分割挑战赛数据集评测基准脑影像

INSTANCE2022

人工标注影像数据原始数据200 例 NCCT 3D 体积（100 训练 + 30 验证 + 70 封闭测试）；10 位资深放射科医生参与标注精修

首个公开的颅内出血 3D 体素级分割基准：200 例 NCCT 各向异性体积（0.42×0.42×5mm），四指标 aggregate-then-rank 排名、HD=inf 劣后争议、小血肿与 SAH 双瓶颈，2026-09 起数据完全公开

北京大学首钢医院 2017-2019 年确诊 ICH 患者回顾性 NCCT 200 例（NIfTI，512×512×20-70，0.42×0.42×5mm 各向异性，体素级二值血肿掩码，Seg3D 粗标+10 位放射科医生精修互检） 59

医学影像病理图像医学图像分割挑战赛数据集肿瘤学

LYSTO

人工标注影像数据原始数据未披露患者级数量——83 张 WSI（train 43 / test 40）来自乳腺癌/结肠癌/前列腺癌成人病例，荷兰 9 个医学中心采集；数据集仅提供 patch 级淋巴细胞计数标签，无患者人口统计

Radboudumc 主办的 Lymphocyte Assessment Hackathon（MICCAI 2019 深圳现场赛）弱监督淋巴细胞计数基准数据集——83 张 CD3/CD8 IHC WSI 产出 train 20,000 + test 12,000 个计数 patch，七档 bins + QWK 主指标，五队现场对决全部 0.92+，附肺癌独立外验与四医生 reader study

83 张 CD3 或 CD8 IHC 染色全切片（3DHistech Pannoramic 250 Flash II 扫描，0.24 μm/pixel，每张约 11 个 ROI），切为 299×299 px patch（步长 200 px），标签为中心 267×267 px 区域内淋巴细胞点数；train 20,000 / test 12,000 / pilot 4,000；HDF5 格式；测试集图像完全派生自 LYON 挑战赛官方测试集 59

医学影像医学图像分割心血管疾病

心肌灌注显像数据库 — 静息态 SPECT 影像集

影像数据人工标注分割掩码83 名患者 / 101 studies / 103 幅 DICOM + 101 卷 NIfTI（含左心室壁掩码，20-90 岁）

83 名患者 103 幅 CZT 心脏 SPECT：巴西团队带来的第一份核医学分割数据库

Hospital Israelita Albert Einstein 前瞻采集（2023-02/03），GE Discovery NM 530c CZT 相机静息态 SPECT，专家 3D Slicer 手工分割掩码 39

医学影像手术视频评测基准挑战赛数据集图像分类目标检测

HeiChole — 腹腔镜胆囊切除手术工作流与技能分析多中心基准

视频数据人工标注真实世界数据33 段腹腔镜胆囊切除视频（3 家德国中心：Heidelberg 15 + Salem 15 + GRN-Sinsheim 3；患者级人口学未披露）；训练 24 / 测试 9

33 段腹腔镜胆囊切除视频 / 3 家德国手术中心 / 22 小时——7 相位 + 4 动作 + 21 器械 + 5 技能维度的四任务基准，绑定 2019 EndoVis 挑战赛 12 队对比验证；训练集 24 段 CC BY-NC-SA 公开，测试集 9 段私有（Docker 提交评测 + 在线排行榜）

33 段腹腔镜胆囊切除手术视频（3 家德国中心，共 22 小时）+ 借助 Anvil 工具以逐帧方式标注的 7 手术相位 / 4 手术动作 / 21 器械（7 类别）/ 5 技能维度评级；视频匿名化为 HeiChole-1…；测试集 9 段未公开 39

医学影像病理图像医学图像分割挑战赛数据集肿瘤学

OWL — 计算病理可解释性科学发现挑战

人工标注原始数据影像数据508 例前列腺癌根治术 WSI（Radboudumc 单中心）

可解释 AI 科学发现首基准：前列腺 WSI 生化复发预测+归因图+解释报告四输出——C-index 0.65 资格线+扰动忠实性+双专家 Likert 面板的第三种评分结构

Radboudumc 回顾性队列——与 LEOPARD 挑战赛训练集同源（GC 注册后经 LEOPARD 下载页获取） 66

医学影像图像分类

CIED 胸片数据集 — 心内植入装置分割与分类

13,393 张图像896 名患者27 个设备型号2,321 胸片 + 11,072 手机翻拍三值分割掩码896 名患者 / 13,393 张图像

CIED 胸片数据集：896 名患者 × 13,393 张图像 × 27 个设备型号——2,321 张正规胸片 + 11,072 张手机翻拍，把设备识别从影像科搬到床边

https://physionet.org/content/cardiac-implantable-device-cxr/1.0.0/ 44

医学影像电子健康记录公共卫生与流行病学COVID-19

CDSL — 西班牙多模态新冠住院数据集

多模态住院数据关系表EHRCT切片胸部X光4,479 住院记录（patient_id 为住院标识，患者数 ≤ 4,479，官方两口径并存）

从 Saves Lives 到 Shared Learning：4,479 份住院记录与 144 万张 CT 的六年半长征

HM Hospitales（西班牙私立医院集团；ED 信息系统/医院 EHR/ICU 信息系统/放射科信息系统） 43

医学影像皮肤影像医学图像分割图像分类目标检测挑战赛数据集

DFUC 2024

人工标注影像数据合成数据6,200 张足部照片（训练 4,000 = 原始 2,000 + 合成 2,000；验证 200；测试 2,000）；DFUC 系列累计图像库 11,000 张；患者级数量未公开

MICCAI 2024 第 4 届糖尿病足溃疡大挑战——6,200 张足部照片的自监督实例分割任务（训练 2,000 原始+2,000 合成/验证 200/测试 2,000），训练主分割集不带人工标注，DINOv2 probing 与 GroundedDINO+SAM 双基线，冠军 Dice 0.5709 与全监督代差显性化

足部彩色 RGB 临床照片（跨设备/跨光照/跨肤色采集，常伴胼胝/坏疽/敷料/脚趾干扰）+ 2,000 张按溃疡实例大小分组合成的训练图像 + 验证/测试集组织方实例分割标注；前作 DFUC 2022 为 4,000 张 640×480、5 位足病医师标注的语义分割集 40