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医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

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图像分类目标检测语义分割

共 768 个数据集

医学影像神经科学病理图像肿瘤学脑肿瘤

Ivy GAP — 胶质母细胞瘤空间转录组与病理图谱

41 例患者 42 例肿瘤270 个 RNA-seq 样本846,743 张 DICOM 影像3,627 个分区富集基因五区解剖结构标注41 名患者（42 例肿瘤）

41 例患者 42 例肿瘤五区空间转录组与病理影像图谱

Allen Institute for Brain Science url: https://glioblastoma.alleninstitute.org/ 63

电子健康记录公共卫生与流行病学临床电子病历流行病学真实世界数据

Epic Cosmos — 3 亿+患者聚合 EHR 平台

3 亿+ 去重患者330+ 参与机构39% 患者 5 年+ 纵向数据聚合层免费行级层付费认证SlicerDicer + DSVM 双层访问3 亿+ 去重患者（截至 2026-09，官方口径 300M+）

3 亿+ 去重患者、330+ 机构的聚合 EHR 真实世界数据平台

Epic Systems Corporation url: https://cosmos.epic.com/ 90

医学影像CT图像分类影像-文本对齐肺癌

CT-RATE — 胸部 CT-报告多模态数据集

25,692 例胸部 CT 检查50,188 个配对 3D 体积21,304 名患者18 类异常标签TB 级 NIfTIHuggingFace 接受条款获取2.1 万名患者（25,692 例检查）

2.5 万例检查 · 5 万配对体积 · 18 类异常标签的胸部 CT 多模态数据集

Koç 大学 Rahmet-GPT 团队（HuggingFace 官方托管） url: https://huggingface.co/datasets/ibrahimhamamci/CT-RATE 84

医学影像X光影像多模态视觉问答医学问答评测基准

ReXVQA — 大规模胸片视觉问答基准

约 69.5 万道四选一 MCQ160,000 项胸片检查（上游）3 个 JSON 共约 1.58GB五技能分类标注三级难度标注非商业许可约 10.9 万名患者（上游 ReXGradient-160K 口径 109,487）

约 69.5 万道四选一胸片 MCQ · 16 万检查 · 五技能框架

Rajpurkar Lab, Harvard Medical School（合作：Saama AI Research、Seoul National University） url: https://huggingface.co/datasets/rajpurkarlab/ReXVQA 57

医学影像电子健康记录骨骼肌肉影像队列研究

OAI — 骨关节炎计划

约 2,662 万张影像4,796 名参与者2004 年起随访 96 个月以上3T MRI + 固定屈曲位 X 光SASASCII + DICOM (GZIP)NDA 注册免费获取4,796 名参与者

NIH 主导的十年膝骨关节炎纵向队列 · 4,796 名参与者 · 约 2,662 万张影像免费公开

NIH（NIAMS 牵头）与 FNIH 协调的公私合作联盟；UCSF 数据协调中心 url: {oai}/0 68

生理信号神经科学语音信号帕金森病

PC-GITA — 哥伦比亚西语帕金森语音

["100 名受试者""约 6,300 条语音录音""44.1 kHz16-bit WAV""多任务录音协议""学术申请获取"]100 名受试者（50 名 PD 患者 + 50 名健康对照）

100 名受试者、约 6,300 条多任务西班牙语录音的帕金森语音语料库

name: "Universidad de Antioquia — GITA 研究组" url: "https://gita.udea.edu.co" 61

医学影像医学问答与基准病理图像肿瘤学评测基准

Herlev Pap — 经典宫颈细胞学基准

917 张单细胞图像7 类细胞标签 + 分割掩码20 维数值特征BMP 格式 85.17MB免费免注册下载917 个单细胞样本（细胞级标注，无患者级元数据）

917 张单细胞 Pap 图像 · 7 类基准 · 宫颈细胞分类起点

丹麦技术大学（DTU）与 Herlev 大学医院；现由爱琴海大学 MDE-Lab 托管 url: http://mde-lab.aegean.gr/index.php/downloads/ 59

医学影像医学图像分割骨骼肌肉影像挑战赛数据集

US Nerve Segmentation — 颈部超声臂丛神经分割

5,635 张标注图11,143 张超声图2.3 GB TIFF竞赛专用获取Dice 0.7322647 名受试者

Kaggle 2016 超声分割竞赛 · 5,635 张标注图 · Dice 基准 0.73226

Kaggle（Ultrasound Nerve Segmentation 竞赛） url: https://www.kaggle.com/c/ultrasound-nerve-segmentation 45

医学影像医学图像分割图像分类肿瘤学

DDTI — 甲状腺结节超声分割开放库

637 张像素级标注超声图像约 18.75 MB（Kaggle 镜像）XML 多边形轮廓 + TI-RADS 字段开放获取（免费）约 99–400 例（口径不一，详见 §3.2）

637 张像素级标注甲状腺超声图像的经典小样本基线

Cim@Lab, Universidad Nacional de Colombia（哥伦比亚国立大学）& IDIME url: http://cimalab.intec.co/applications/thyroid/ 74

基因组学与多组学医学影像单细胞基因组学病理图像肿瘤学

Human Cell Atlas — 人类细胞图谱全身单细胞参考图谱

7,050 万细胞 · 多组织多模态18 个生物网络图谱CC BY 4.0 开放Data Portal + CELLxGENE Census月度更新快照细胞级参考图谱（非患者队列）：约 7,050 万细胞 / 1.12 万捐赠者 / 527 项目（截至 2026-09）

2016 年发起的国际开放联盟 · 7,050 万细胞 · 18 个生物网络 · 多组织单细胞与空间图谱

Human Cell Atlas Consortium / HCA Data Coordination Platform (EBI, Broad Institute, UCSC) url: https://data.humancellatlas.org 60

神经科学公共卫生与流行病学脑影像队列研究阿尔茨海默病

AIBL — 澳大利亚老龄化影像与生活方式纵向队列

约 3,045 名受试者18 个月间隔 8 次随访MRI+PET 多示踪剂影像血液与 CSF 生物标志物LONI IDA 申请获取约 3,045 名受试者（官网口径，截至 2023-02）

1,112 人起始队列、最长 15 年随访的 AD 影像-血液-生活方式多模态纵向队列

AIBL Research Group（CSIRO / 墨尔本大学 / Edith Cowan University 等） url: https://aibl.org.au/ 95

医学影像医学问答与基准手术视频评测基准

SERV-CT — 立体内镜 3D 重建验证基准

16 组立体对720×576 PNG16-bit 视差深度图CC BY 4.0 免费下载2 只猪尸体样本2 只 ex vivo 小型猪尸体(16 组立体对,非人类患者)

16 组锥形束 CT 参考立体对,免费开放的内镜 3D 重建验证基准

University College London (UCL WEISS) url: https://rdr.ucl.ac.uk/articles/dataset/SERV-CT_A_disparity_dataset_from_cone-beam_CT_for_validation_of_endoscopic_3D_reconstruction/26352199 56

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