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医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

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图像分类目标检测语义分割

共 759 个数据集

神经科学医学问答与基准脑影像医学图像分割心血管疾病挑战赛数据集

WMH Challenge — 脑白质高信号分割基准

170 例 T1+FLAIR 脑 MRI60 训练 + 110 隐藏测试5 台扫描仪 3 个厂商NIfTI 约 399MB注册后开放训练集170 例（60 训练 + 110 隐藏测试）

170 例多中心多扫描仪脑 MRI 分割挑战（60 训练 + 110 隐藏测试）

UMC Utrecht Image Sciences Institute url: https://wmh.isi.uu.nl/ 73

医学影像医学图像分割手术视频挑战赛数据集骨骼肌肉影像

PENGWIN — 骨盆骨折碎片分割挑战数据集

150 例骨盆 CT50,000 张合成 X-ray8.08 GB MHA 压缩包CC BY-NC-SA 4.0 开放下载逐碎片实例标注150 名骨盆复位手术患者

150 例多中心骨盆 CT 骨折碎片实例分割与 50,000 张合成 X-ray

PENGWIN 挑战赛组织方（北京航空航天大学、北京积水潭医院等） url: https://pengwin.grand-challenge.org 83

医学影像内窥镜影像手术视频

EndoMapper — 完整标定内镜手术数据集

96 段完整手术视频超 24 小时 1440×1080 视频268,679 帧解剖区域标注4,086 帧工具分割COLMAP 伪真值轨迹Synapse 申请获取未逐患者公开（96 段完整手术视频，含同患者相隔数周重复检查）

96 段完整标定内镜手术视频，超 24 小时真实结肠镜 VSLAM 基准

Universidad de Zaragoza (I3A) & Hospital Clínico Universitario Lozano Blesa url: https://www.synapse.org/#!Synapse:syn26707219/wiki/615178 84

生理信号语音信号心血管疾病

PhysioNet/CinC Challenge 2016 心音数据集 — 听诊音正常/异常分类基准

3,240 条训练录音764 人隐藏测试 1,277 条308 人2,000 Hz .wav 单导联解压约 1.1 GBODC-By 开放下载训练集 764 名受试者（隐藏测试集另有 308 名）

公开最大心音（PCG）分类基准 · 3,240 条录音 / 764 人 · 2,000 Hz .wav

PhysioNet（MIT Laboratory for Computational Physiology 等） url: https://physionet.org/content/challenge-2016/1.0.0/ 88

医学影像医学图像分割病理图像目标检测肿瘤学

DigestPath — 消化道病理检测与分割基准

687 张印戒细胞检测图872 张结肠镜组织分割图两任务合计 631 名患者XML 边界框 + JPG 掩码签署协议后免费申请631 名患者（印戒细胞 155 名 + 组织分割 476 名，两子任务）

MICCAI 2019 消化系统病理基准：687 张印戒细胞检测图 + 872 张结肠镜组织分割图

商汤科技 / 衡道病理 / 上海交通大学医学院附属瑞金医院 / 西京医院 / 上海市松江区中心医院 url: https://digestpath2019.grand-challenge.org 70

医学影像多模态CTMRI医学图像分割

CHAOS — 健康腹部跨模态器官分割基准

80 名健康受试者约 2.0 GB DICOM+PNGCT 40 例 + MRI 120 序列四器官手工标注Zenodo 开放下载80 名健康受试者（40 例 CT + 40 例 MRI）

80 名健康受试者 CT+MRI 四器官分割挑战数据（开放获取）

Dokuz Eylül 大学医院（土耳其伊兹密尔） url: https://chaos.grand-challenge.org/ 70

医学影像医疗NLP视觉问答评测基准

OmniMedVQA — 综合医学视觉问答基准

118,010 张医学影像127,995 个多选题12 种影像模态73 个来源数据集JSON 标注 + 原始图像不适用（影像问答评测基准，非患者队列）

118,010 张影像、127,995 个多选题的 12 模态医学 VQA 评测基准

上海人工智能实验室与香港大学（OpenGVLab） url: https://github.com/OpenGVLab/Multi-Modality-Arena 59

医学影像乳腺癌病理图像肿瘤学

TUPAC16 — 乳腺肿瘤增殖 WSI 评分挑战

约 821 张 WSI训练 500 + 测试 321注册后获取H&E SVS 全切片821 例 TCGA-BRCA + 73 例荷兰辅助有丝分裂病例

乳腺 WSI 肿瘤增殖评估标准挑战 · 821 张 WSI · 三大任务

Eindhoven 医学图像分析组 (IMAG/e) / Radboud DIAG url: https://tupac.grand-challenge.org/ 63

医学影像眼科影像医学图像分割皮肤影像骨骼肌肉影像

HRF — 45 幅高分辨率眼底血管分割基准

45 幅 3504×2336 眼底照健康DR青光眼各 15 幅单套专家共识血管金标准双专家视盘定位标注约 73 MB 开放直链下载45 幅眼底图像（健康、DR、青光眼各 15 幅；每幅独立病例）

45 幅 3504×2336 眼底照，健康/DR/青光眼三分组血管分割基准

Friedrich-Alexander-Universität Erlangen-Nürnberg (FAU), Pattern Recognition Lab url: https://www5.cs.fau.de/research/data/fundus-images/ 63

公共卫生与流行病学神经科学儿科脑影像队列研究

HBN — 儿童青少年脑与精神健康跨诊断队列

约 4,867 名受试者多模态 MRIEEG表型BIDS 格式CC BY-NC-SA 与 CC BY-SA 双许可DUA 申请获取约 4,867 名 5-21 岁受试者（Release 11，数据截至 2022-11）

5-21 岁约 4,867 名受试者的跨诊断儿童脑与精神健康开放生物样本库

Child Mind Institute（美国儿童心理研究所） url: https://fcon_1000.projects.nitrc.org/indi/cmi_healthy_brain_network/ 106

医学影像内窥镜影像目标检测手术视频结直肠癌

SUN Database — 昭和大学结肠镜视频数据库

113 段 HDTV 白光结肠镜视频158,690 帧逐帧边界框标注99 名患者100 个病理确诊息肉JPEG + TXT 角点坐标免费申请获取99 名患者（男 71 / 女 28，中位年龄 69 岁）

113 段结肠镜视频 · 158,690 帧逐帧息肉边界框

昭和大学北横滨医院消化疾病中心 & 名古屋大学 Mori 研究室 url: http://sundatabase.org/ 91

医学影像骨骼肌肉影像CT医学图像分割

CTSpine1K — 千例脊柱CT椎体分割数据集

1,005 例脊柱 CT11,172 个标注椎体约 150GB NIfTICC BY-NC-SA 4.0官方三段划分1,005 例受检者

1,005 例多中心脊柱 CT，11,172 个椎体实例级标注

中国科学院计算技术研究所智能信息处理重点实验室（MIRACLE 中心） url: https://github.com/MIRACLE-Center/CTSpine1K 67

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