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医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

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图像分类目标检测语义分割

共 754 个数据集

ISIC 2020 Challenge

医学影像皮肤影像图像分类挑战赛数据集评测基准皮肤癌

ISIC 2020 Challenge

人工标注影像数据原始数据训练集 2,056 名患者 / 32,701 个病灶（Cassidy 2022 分析口径）/ 33,126 张图像，平均每人约 16 个病灶；20.8% 患者至少含 1 个黑色素瘤；另测试集 10,9

SIIM-ISIC 2020 Melanoma Classification：33,126 张训练图、2,056 名患者的患者中心二分类黑色素瘤检测，584 张恶性全经组织病理确认；冠军 EfficientNets 集成私榜 AUC 0.9490，Kaggle 3,308 队十万次提交

ISIC 2020 Challenge 官方数据包：训练 33,126 张皮肤镜图像（JPEG 23GB / DICOM 48.9GB / DICOM corrected 23.0GB）+ GroundTruth.csv（二元 target）+ metadata v1/v2（patient ID/sex/age/anatomic site，v2 含 lesion ID）+ Duplicates.csv（425 张重复）+ 测试 10,982 张（无公开 GT）；DOI 10.34970/2020-ds01 45

SegPC-2021 — 775 图多发性骨髓瘤浆细胞核质双标注显微分割挑战赛全档案

医学影像医学图像分割病理图像挑战赛数据集评测基准肿瘤学

SegPC-2021 — 775 图多发性骨髓瘤浆细胞核质双标注显微分割挑战赛全档案

人工标注影像数据原始数据775 张骨髓涂片显微图像（来自两台不同显微镜，均为 AIIMS New Delhi 就诊的多发性骨髓瘤患者骨髓穿刺涂片，非逐患者计数公开）；训练 298 + 验证 200 + 最终测试 277

IEEE ISBI 2021 挑战赛数据集：IIIT-Delhi SBILab 与 AIIMS New Delhi 采集的 775 张骨髓涂片显微图像，对感兴趣细胞逐一标注细胞核与细胞质，两台不同显微镜刻意混采以逼出设备不变算法，52 队 696 人竞逐，Top-5 全部采用深度学习集成，最佳 ImAP 0.9389

IIIT-Delhi SBILab + AIIMS New Delhi 采集的 Jenner-Giemsa 染色骨髓涂片；图像均经 GCTI-SN 染色归一化；含逐感兴趣细胞的细胞核与细胞质灰度掩码（原值 0 背景 / 20 细胞质 / 40 细胞核）；Grand Challenge 门户、IEEE DataPort（DOI 10.21227/7np1-2q42）、Kaggle 镜像三渠道获取 36

ZCHSound — 浙江大学 1259 名儿童先心病心音数据库：五分类智能听诊基准

生理信号心血管疾病儿科医学问答与基准评测基准语音信号

ZCHSound — 浙江大学 1259 名儿童先心病心音数据库：五分类智能听诊基准

原始数据人工标注1259 名儿童受试者（941 名高质量 clean 子集 + 318 名新生儿 noisy 子集；共 1259 条录音）

浙大儿院牵头三中心采集 1259 名 2 天至 14 岁儿童的单听诊点心音（PCG），含 941 名高质量与 318 名新生儿低质量双子集，五类 CHD 诊断标签由双专家共识确认，配套正常/ASD/PDA/PFO/VSD 五分类、四任务基准与 84 维时频特征，随机森林基线 F1 达 90.3%

浙江大学医学院附属儿童医院等三中心 2020-2022 年前瞻采集的单听诊点心音（ChildCare G-100 智能电子听诊器，仰卧位胸骨左缘第 2-3 肋间，8000 Hz / 16-bit / .wav），配双心脏专家共识确认的五分类 CHD 诊断标签 37

HRA Knowledge Graph — 人体参考图谱 RDF 知识图谱：解剖-细胞-标志物主干

基因组学与多组学知识图谱单细胞基因组学多模态

HRA Knowledge Graph — 人体参考图谱 RDF 知识图谱：解剖-细胞-标志物主干

知识图谱本体与术语参考数据元数据人工标注HRApop v1.1 汇聚 175 位捐献者（男 92 / 女 83）的组织块与数据集；本体层本身不含患者个体，hra-pop-full 扩展层含 32,047 个供体实体（跨门户去重前口径）

NIH HuBMAP 主导、Indiana 大学 CNS 维护的 HRA 知识图谱：v2.2 发布 10,064,033 节点 / 171,250,177 边 / 125.84 GB，13 类数字对象经 Uberon 与细胞本体对齐；v2.5 起每年 6-15 与 12-15 双发，CC BY 4.0 全开放，SPARQL 与 Zenodo 双入口

HuBMAP、SenNet、KPMP、GUDMAP/RBK、HCA、CZ CELLxGENE、GTEx、HTAN、GEO 等门户的已注册实验数据 + 专家人工编纂的 ASCT+B 表、OMAP 抗体面板、2D FTU 插图与 71 个 3D 参考器官 32

ARCADE 冠脉造影狭窄检测与血管分割数据集

医学影像X光影像医学图像分割目标检测挑战赛数据集心血管疾病

ARCADE 冠脉造影狭窄检测与血管分割数据集

人工标注影像数据原始数据1,500 例（数据论文 Patient cohort 口径；帧级标注 3,000 帧）

MICCAI 2023 冠脉造影基准：每条任务 1,500 帧专家帧级标注，按 SYNTAX 段号分割血管并以实例分割形式给出≥50% 狭窄斑块，训练/验证/测试 1,000/200/300，CC0 全开放

哈萨克斯坦阿拉木图心脏病与内科研究所 X 光血管造影档案；Philips Azurion 3 与 Siemens Artis Zee 两台造影机，512×512 像素 DICOM 抽帧后转 PNG，CVAT 标注，COCO JSON 24

ECHOVIEW 超声心动图切面分类标注

医学影像多模态图像分类心血管疾病

ECHOVIEW 超声心动图切面分类标注

机器学习标注影像数据463 名患者（BIDMC，2017-2019）

MIMIC-IV-ECHO 派生切面分类标注：463 名患者 717 项检查的经胸超声视频逐段输出 23 类视图概率，机器学习预标注而非人工金标准

PhysioNet（MIT Laboratory for Computational Physiology） url: https://physionet.org/content/echoview/0.1/ 21

Endo-Aid 子宫内膜癌 Pipelle 活检检测

医学影像病理图像图像分类挑战赛数据集肿瘤学

Endo-Aid 子宫内膜癌 Pipelle 活检检测

人工标注影像数据临床数据91 张 WSI（测试集，对应 91 例 Pipelle 活检；患者级唯一性未在公开页面明确说明）；训练集 2,819 张不公开

Radboudumc 用 91 张 H&E 全切片搭起的公开测试集与在线评测平台：15 位病理医生的多数票当金标准，训练集不公开，只开放测试

Radboud University Medical Center（荷兰奈梅亨）病理科 2013 年 10 月至 2021 年 4 月的子宫内膜 Pipelle 活检 H&E 染色全切片，3DHistech P1000 扫描，MRXS 转 TIFF，91 张打包为 rar 12

BUS-UCLM — 西班牙 UCLM 683 张乳腺超声病灶分割数据集（38 患者/419 正常-174 良性-90 恶性/CC BY 4.0）

医学影像乳腺影像医学图像分割图像分类乳腺癌评测基准

BUS-UCLM — 西班牙 UCLM 683 张乳腺超声病灶分割数据集（38 患者/419 正常-174 良性-90 恶性/CC BY 4.0）

人工标注影像数据原始数据38

BUS-UCLM 乳腺超声病灶分割数据集：683 张（419 正常/174 良性/90 恶性）来自 38 位患者的原始 PNG 与三分类彩色掩膜，配 COCO 导出与患者级划分脚本，CC BY 4.0 可商用，含大量正常病例以缓解偏倚，是 BUS 分割与分类研究的实用基线集

Mendeley Data (BUS-UCLM, DOI 10.17632/7fvgj4jsp7.3) url: https://data.mendeley.com/datasets/7fvgj4jsp7/3 30

KNOAP2020 膝骨关节炎发病预测挑战赛

医学影像MRIX光影像骨骼肌肉影像挑战赛数据集队列研究

KNOAP2020 膝骨关节炎发病预测挑战赛

影像数据临床数据标签数据453 膝（242 人）；测试集 423、训练集 30；上游 PROOF 试验 407 名超重/肥胖女性

PROOF 队列 423 膝盲测、30 膝带标签：1.0–1.5T MRI 双序列 + 数字化 X 线 + 13 项临床因素预测 6.5 年新发

PROOF 研究基线与随访影像及临床变量（半屈位 PA 数字化 X 线、冠状位 2D PD 与矢状位 3D 水激发 MRI、13 项临床危险因素），经 Health-RI XNAT 以 NIfTI 格式分发；结局由 2.5 年与 6.5 年随访按 ACR 联合标准判定 14

Medical-CXR-VQA 胸片问答数据集

医学影像X光影像视觉问答评测基准多模态

Medical-CXR-VQA 胸片问答数据集

人工标注影像数据文本数据原始数据215,547 项胸部影像研究（源自 MIMIC-CXR，患者级数量以 MIMIC-CXR 口径为准）；问答对 780,014 条

基于 MIMIC-CXR 报告、经微调 LLM 流水线构建的大规模胸部 X 光视觉问答数据集——215,547 项影像研究上生成 780,014 个临床问答对，覆盖存在、异常、位置、级别、视图、类型六类问题，配套可解释关系图 VQA 方法与放射科医生双评质检

MIMIC-CXR v2.0.0 放射学报告（微调 LLaMA 2 抽取疾病实体与位置/类型/级别关键信息后模板化生成问答）+ MIMIC-CXR-JPG 14 项诊断标签（仅参考对照）+ 放射科医生评估附录 PDF 14

CPTAC 影像 — 泛癌影像-组学配对

医学影像CTMRI病理图像肿瘤学

CPTAC 影像 — 泛癌影像-组学配对

约 1,726 名受试者约 1.1 TB+ DICOMSVS11 个 TCIA 队列CC BY 3.0/4.0 开放2025-07 最新更新逾 1,700 名受试者（11 队列合计，放射影像数百例）

11 个 TCIA 队列、约 1,726 名受试者的泛癌影像-组学配对资源

美国国家癌症研究所（NCI）CPTAC 联盟 / 癌症影像档案馆（TCIA） url: https://www.cancerimagingarchive.net/?p=53438/ 59

PUMA — 黑色素瘤全景分割数据集

医学影像病理图像医学图像分割挑战赛数据集皮肤癌

PUMA — 黑色素瘤全景分割数据集

310 张 40× H&E ROI PNG约 14.5 GB Zenodo 归档97,429 个公开标注核CC0 1.0 公开直链GeoJSON 双层标注310 张 ROI（155 原发 + 155 转移）

310 张 40× H&E ROI 的黑色素瘤核与组织全景分割基准

UMC Utrecht & TU Eindhoven（PUMA Challenge） url: https://puma.grand-challenge.org 45

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